大熊貓Ⅱ類MHC功能基因的分離及適應(yīng)性進(jìn)化研究.pdf

1、浙江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士學(xué)位論文大熊貓Ⅱ類MHC功能基因的分離及適應(yīng)性進(jìn)化研究姓名：陳藝燕申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專業(yè)：動(dòng)物學(xué)指導(dǎo)教師：方盛國(guó);萬(wàn)秋紅20090430浙江大學(xué)博士學(xué)位論文 大熊貓I I 類M H C 功能基因的分離及適應(yīng)性進(jìn)化研究鑒此，基于維持圈養(yǎng)大熊貓的遺傳多樣性及提高大熊貓的疾病抵抗能力的必要性，本文建議應(yīng)加強(qiáng)該種群攜帶稀有等位基因之大熊貓個(gè)體的繁殖成功率．5 ) 大熊貓指名亞種和秦嶺亞種在多態(tài)的I I 類M H C 基因

2、中，具有明顯的等位基因豐度差異。其中，指名亞種在D Q 區(qū)比秦嶺亞種具有更多的等位基因( 1 6 ：1 0 ) ，但秦嶺亞種在D R 區(qū)的等位基因數(shù)又多于指名亞種( 1 1 ：9 ) 。與此同時(shí)，在D Q區(qū)和D R 區(qū)，指名亞種和秦嶺亞種分別具有9 條和5 條各自所特有的等位基因。上述結(jié)果，充分表明了大熊貓指名亞種和秦嶺亞種在其亞種分化之后，各自經(jīng)歷了獨(dú)立的進(jìn)化歷史，并進(jìn)化產(chǎn)生了適應(yīng)不同環(huán)境的亞種特異性I I 類M H C 基因。6 )

3、 在大熊貓I I 類M H C 基因中，存在著多個(gè)方面的平衡選擇證據(jù)：a ．基因的觀察雜合度明顯高于期望雜合度；b ．各基因抗原結(jié)合位點(diǎn)的氨基酸雜合度顯著地高于非抗原結(jié)合位點(diǎn)( P < o ．0 1 ) ；c ．抗原結(jié)合位點(diǎn)的選擇參數(shù)∞值( d N ／魂，即非同義置換率與同義置換率之比) 顯著地高于非抗原結(jié)合位點(diǎn)∞值( 尸< O ．0 1 ) ；d ．5 個(gè)多態(tài)性的座位共存在4 4 個(gè)受正選擇壓力的氨基酸位點(diǎn)，其中9 5 ．

4、4 5 ％位于抗原結(jié)合位點(diǎn)及其附近。這些平衡選擇證據(jù)，充分表明了I I 類M H C 基因在大熊貓的適應(yīng)性進(jìn)化過(guò)程中，發(fā)揮了重要作用。7 ) 大熊貓指名亞種在D R B l 和D Q A 2 座位上的選擇參數(shù)∞值均小于1 ，屬于凈化選擇模式，表明了凈化選擇在指名亞種的D R B l 和D Q A 2 基因中，是處于統(tǒng)治地位的。相反地，秦嶺亞種的選擇參數(shù)∞值在7 個(gè)表達(dá)的I I 類M H C 基因中均大于1 ，屬于正選擇模式，表明了正選擇

5、廣泛地存在于秦嶺亞種的I I 類M H C基因中。該結(jié)果，明晰地揭示了大熊貓指名亞種和秦嶺亞種在I I 類M H C 基因的進(jìn)化機(jī)制上，存在著驅(qū)動(dòng)因素的差異。8 ) 無(wú)論是大熊貓的指名亞種還是秦嶺亞種，在新發(fā)現(xiàn)的D R B 3 座位上，都具有極大的∞值( 抗原結(jié)合位點(diǎn)的∞值均大于9 ．2 7 ；非抗原結(jié)合位點(diǎn)的∞值均大于4 ．3 9 ) ，表明了D R B 3 新座位的抗原呈遞結(jié)構(gòu)域在其漫長(zhǎng)的進(jìn)化過(guò)程中，經(jīng)歷了有別于其它哺乳動(dòng)物之極強(qiáng)的