東北太平洋多金屬結核區(qū)深海沉積物細菌多樣性研究.pdf

1、本研究探索了太平洋多金屬結核區(qū)沉積物總DNA的有效提取方法，并對DNA提取試劑盒進行了優(yōu)化，最終采用兩種方法分別提取了四個站位不同層次樣品的總DNA。 結果表明：環(huán)境總DNA量隨深度的增加而遞減，與細菌生物量隨深度的變化規(guī)律相吻合。采用克隆測序法（Clone-Sequencing method）研究結核區(qū)四個站位的細菌多樣性。構建了四個16S rRNA基因克隆文庫，隨機挑選克隆送測，去除嵌合體后，WS0505、ES0502、E2

2、005-01和EP2005-03四個站可用序列數(shù)分別為：65、76、67、164個。以細菌門為單位在各站分別構建系統(tǒng)發(fā)育樹。結果顯示結核區(qū)深海沉積物中含有豐富的細菌多樣性。WS0505、ES0502、E2005-01和EP2005-03四站沉積物分別涵蓋了6、7、6、10個門的細菌，另外還有一定比例的未定種。變形菌門（Proteobacteria）（包括Alpha、Beta、Gamma、Delta綱），酸桿菌門（Acidobacteri

3、a）、放線菌門（Actinobacteria）、擬桿菌門（Bacteroidetes）和芽單胞菌門（Gemmatimonadetes）為四個站共有細菌門。隸屬于Alpha和Gamma 變形桿菌的細菌在各站細菌中占據(jù)優(yōu)勢。ES0502a3、ES0502a7和ES0502a22同時出現(xiàn)在四個站，且占據(jù)一定的比例，其中ES0502a7可能與某些重金屬代謝有關；ES0502、WS0505和EP2005-03三站含有十分相似的細菌物種，除四站共有

4、的細菌外，ES0502a5、 ES0502a14、ES0502a27、ES0502b20、ES0502b24、ES0502b25和ES050c23為此三站共有菌種。其中ES0502a14、ES0502b20、ES0502b24、ES0502b25和ES0502c23尚未出現(xiàn)在其它環(huán)境的報導中，它們可能代表了結核區(qū)底質環(huán)境的特殊菌種。芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)是一新近發(fā)現(xiàn)的細菌門，本研究的四個站均有芽單胞菌門細菌出現(xiàn)，