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1、應(yīng)用RT-PCR技術(shù)擴(kuò)增得到水稻黑條矮縮病毒(Rice black-streaked dwarfvirus,RBSDV)浙江水稻分離物(Zj)基因組片段5(S5)的全長(zhǎng)cDNA克隆并測(cè)定了它的全序列。RBSDV-Zj S5由3164個(gè)堿基組成,具有末端保守序列(+)5′-AAGTTTTTTTCACTC---GAGTGAATACAGCTAATGTC-3′,緊鄰其末端保守序列,有一段特異性7個(gè)堿基的反向重復(fù)序列。S5編碼鏈含有二個(gè)開(kāi)放閱讀框
2、(openreading fram,ORF),分別編碼 107.1kDa和26.5kDa的p5A和p5B蛋白。序列同源性比較發(fā)現(xiàn),RBSDV-Zj S5 與 RBSDV 河北玉米分離物(RBSDV-Hbm)S5、Fijidisease virus(FDV) S5、Mal de Rio Cuarto virus(MRCV)S5的同源性分別為93.58%、49%和65.60%。 構(gòu)建了S5的原核表達(dá)載體。經(jīng)IPTG誘導(dǎo),在大腸桿菌中
3、表達(dá)了RBSDV-S5編碼的p5A和p5B 2種蛋白,并制備了相應(yīng)的抗血清。Western-blot分析結(jié)果顯示,用p5A的抗血清能夠與RBSDV侵染的水稻葉片和純化的RBSDV粒子蛋白發(fā)生反應(yīng);p5B的抗血清只能與RBSDV侵染的水稻葉片蛋白發(fā)生反應(yīng)。表明RBSDV-Zj p5A是一種結(jié)構(gòu)蛋白,而p5B是一種非結(jié)構(gòu)蛋白。 構(gòu)建了S5第二個(gè)編碼框的植物表達(dá)載體pRR-S5BC,通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)入水稻品種秀水04中,經(jīng)PCR、S
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