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文檔簡(jiǎn)介
1、<p><b> 中文13000字</b></p><p> 出處:Shi L, Liu W, Zhang H, et al. A survey of GPU-based medical image computing techniques[J]. Quantitative imaging in medicine and surgery, 2012, 2(3): 188.<
2、;/p><p> 基于GPU的醫(yī)學(xué)圖像計(jì)算技術(shù)綜述</p><p> A survey of GPU-based medical image computing techniques</p><p> 學(xué) 部(院): 電子信息與電氣工程 </p><p> 專 業(yè): 生物醫(yī)學(xué)工程
3、 </p><p> 基于GPU的醫(yī)學(xué)圖像計(jì)算技術(shù)綜述</p><p> Lin Shi,Wen Liu,Heye Zhang,Yongming Xie,DefengWang,</p><p> 影像與介入放射學(xué)教研室,中國(guó)香港大學(xué),新界沙田,中國(guó)香港; </p><p> CUHK深圳研究院,中國(guó)廣東省深圳市;</p>
4、<p> 中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院,中國(guó)廣東省深圳市;</p><p> 對(duì)應(yīng):DefengWang博士。影像與介入放射學(xué),中國(guó)香港大學(xué),威爾斯親王醫(yī)院,Shatin,新界,中國(guó)香港。電子郵件:dfwang@cuhk.edu.hk。</p><p> 摘要:醫(yī)學(xué)影像目前被用于整個(gè)醫(yī)療科學(xué)研究、診斷和治療計(jì)劃之中,對(duì)整個(gè)臨床應(yīng)用有至關(guān)重要的作用。然而,醫(yī)學(xué)成像過(guò)程通常
5、在計(jì)算上要求很高,大的三維(3D)醫(yī)療數(shù)據(jù),是在實(shí)際臨床應(yīng)用中被處理的。隨著圖形處理器性能的提高,它提高了編程支持,并且具有了良好的價(jià)格性能比。圖形處理單元(GPU)已成為一個(gè)有競(jìng)爭(zhēng)力的并行計(jì)算平臺(tái),它能處理復(fù)雜的任務(wù),在醫(yī)學(xué)圖像廣泛應(yīng)用。本次調(diào)查的主要目的是,給參與基于GPU的醫(yī)學(xué)圖像處理的初學(xué)者或研究人員提供一個(gè)全面的參考源。在本次調(diào)查中,GPU計(jì)算不斷進(jìn)步,用于醫(yī)學(xué)圖像處理,即分割,登記和可視化的三個(gè)領(lǐng)域,以及現(xiàn)有的傳統(tǒng)的應(yīng)用程序
6、,并且對(duì)潛在的優(yōu)勢(shì)和目前GPU再醫(yī)學(xué)成像相關(guān)的挑戰(zhàn)進(jìn)行了討論,激發(fā)中醫(yī)藥未來(lái)的應(yīng)用。</p><p> 關(guān)鍵詞:圖形處理單元(GPU);圖像分割;圖像配準(zhǔn);圖像可視化;高性能計(jì)算</p><p><b> 介紹</b></p><p> 并行處理,是醫(yī)療應(yīng)用中的未來(lái)。在過(guò)去的幾年中,GPU的不斷發(fā)展為具有更高性能的加速器平臺(tái)數(shù)據(jù)并行計(jì)算工
7、具,特別是在醫(yī)學(xué)圖像處理和分析打好夯實(shí)的基礎(chǔ)。由于需求迅速增加,比如高性能計(jì)算和更復(fù)雜的圖形和科學(xué)應(yīng)用,商用的圖形硬件已經(jīng)從具有固定功能流水線顯著演變到可編程超級(jí)計(jì)算機(jī)(1)。同時(shí),GPU也迅速發(fā)展成為范圍廣泛的計(jì)算密集型的處理器。此外,GPU設(shè)計(jì)用于特定類的具有以下特征的應(yīng)用:(Ⅰ)大的計(jì)算需求,(Ⅱ)基本平行,和(III)全過(guò)程的延遲。</p><p> 在最近幾年,GPU的運(yùn)算速度迅速增加,從而GPU可用
8、于許多計(jì)算上繁重的任務(wù)。它比常規(guī)基于CPU的計(jì)算框架速度更為優(yōu)秀。近日,GPU已經(jīng)成為了高性能計(jì)算領(lǐng)域具有競(jìng)爭(zhēng)力的平臺(tái),因?yàn)槠渚薮蟮奶幚砟芰ΑH欢?,它不能接受通用或非圖形計(jì)算。其結(jié)果是,由映射通用應(yīng)用到圖形硬件實(shí)現(xiàn)通用計(jì)算許多努力被稱為通用計(jì)算上的圖形處理單元(GPGPU),其被引入用于基于現(xiàn)有GPU硬件的非圖形算法。 GPGPU的計(jì)算是通過(guò)使用專門的圖形處理,而不是矢量和矩陣運(yùn)算符(3)進(jìn)行的。然而,只有專業(yè)的研究人員和開(kāi)發(fā)人員熟悉的
9、圖形API能流利地使用傳統(tǒng)的GPU / GPGPU開(kāi)發(fā)平臺(tái),它給不熟悉它的實(shí)際應(yīng)用優(yōu)勢(shì)的客戶帶去了不便(4)。幸運(yùn)的是,統(tǒng)一計(jì)算設(shè)備架構(gòu)(CUDA)技術(shù)的出現(xiàn)可以克服這些缺點(diǎn),在當(dāng)前的GPU / GPGPU版本,以一定程度上存在。在2006年年底,NVIDIA公司推出的CUDA開(kāi)發(fā)平臺(tái),這有一種新型的編程接口和環(huán)境,為自己的GPU通用編程。對(duì)于通用的并行編程對(duì)NVIDIA GPU的方便,CUDA帶來(lái)的類似C開(kāi)發(fā)環(huán)境,并提供給程序員(5)
10、。圖1顯示了CUDA編程模型的示意性概述。</p><p> 在醫(yī)學(xué)和外科手術(shù),第2卷,沒(méi)有2012年9月3日的定量成像</p><p> Shi等?;贕PU的醫(yī)學(xué)圖像計(jì)算調(diào)查</p><p> 圖1的CUDA編程模型的概念框架。每個(gè)內(nèi)核被分配到由多個(gè)塊的網(wǎng)格,并且每個(gè)塊包含螺紋(6)</p><p> 一般來(lái)說(shuō),每個(gè)CUDA功能的
11、GPU是由多流多處理器集合的,是一個(gè)全球性的存儲(chǔ)器。如圖1中,內(nèi)核是CUDA的基本構(gòu)造塊,這將從主機(jī)(CPU)啟動(dòng),并在圖形裝置(GPU)上執(zhí)行。在圖形裝置的一部分,每個(gè)線程塊是一個(gè)單流多處理器,是由一組芯執(zhí)行。同時(shí),該線程被組織到線程塊塊(7)的網(wǎng)格內(nèi)。也存在一些其它方法對(duì)GPGPU進(jìn)行計(jì)算,如Khronos 組織的OpenCL和微軟的DirectCompute,它們?nèi)坑刹⑿杏?jì)算的類似概念推導(dǎo)(7)。 CUDA已被廣泛研究,并廣泛應(yīng)
12、用于各種應(yīng)用領(lǐng)域,包括醫(yī)學(xué)物理,計(jì)算機(jī)視覺(jué),計(jì)算機(jī)圖形學(xué),等等。由于處理大型數(shù)據(jù)集的便捷,OpenCL和DirectCompute也將對(duì)CUDA更加成熟,在未來(lái)幾年。同時(shí),相比以前的GPU(GPGPU),CUDA具有以下優(yōu)點(diǎn)(4,8,9):</p><p><b> ?</b></p><p> 1.通用的編程環(huán)境。 CUDA簡(jiǎn)單的理解為,它帶來(lái)了類似C開(kāi)發(fā)環(huán)境,
13、為程序員提供不熟悉GPU。這是種類似C語(yǔ)言的編程,有更好的兼容性和可移植性。</p><p><b> ?</b></p><p> 2.更強(qiáng)大的并行計(jì)算能力。 CUDA是一個(gè)高性能并行計(jì)算平臺(tái),并且也非常適合于充分利用GPU加速的并行功能。</p><p><b> ?</b></p><p&g
14、t; 3.更好的發(fā)展平臺(tái)。它是一種多用途的開(kāi)發(fā)平臺(tái),有CUDA證據(jù)的參考,如科學(xué)圖書(shū)館,開(kāi)源編譯器,調(diào)試器和分析器。</p><p><b> ?</b></p><p> 4.更短的等待時(shí)間。主機(jī)(CPU)和圖形設(shè)備(GPU)之間的數(shù)據(jù)傳輸速率和等待時(shí)間已明顯改善。</p><p> 雖然CUDA開(kāi)發(fā)優(yōu)勢(shì)顯著,但是在過(guò)去的幾年里,CU
15、DA代碼手冊(cè)發(fā)展,仍然是很費(fèi)力又費(fèi)時(shí)的通用多核系統(tǒng)。因此,如何把喜愛(ài)的編程語(yǔ)言轉(zhuǎn)換成有效的并行CUDA程序,對(duì)此有相當(dāng)?shù)闹匾砸饬x,尤其是對(duì)普通用戶的CUDA。 A C到CUDA轉(zhuǎn)化體系,提出生成兩個(gè)級(jí)并行CUDA代碼,是在高效的數(shù)據(jù)訪問(wèn)(10)進(jìn)行了優(yōu)化。圖2實(shí)現(xiàn)的系統(tǒng)步驟順序。</p><p> 在圖2中,CLooG是國(guó)家的最先進(jìn)的代碼生成器,生成無(wú)CUDA代碼開(kāi)發(fā)的手冊(cè)(10)轉(zhuǎn)化代碼。這項(xiàng)轉(zhuǎn)換框架可以產(chǎn)
16、生,處理任意輸入C編程代碼相應(yīng)的、有效的CUDA代碼?;诟咝阅苡?jì)算的競(jìng)爭(zhēng)能力,GPU計(jì)算已發(fā)展為一種有效的研究平臺(tái),應(yīng)用在醫(yī)學(xué)圖像處理和分析,如醫(yī)學(xué)圖像重建(11,12),實(shí)時(shí)去噪( 13,14),登記(15,16),解卷積(17),分段(18,19)和可視化(20,21),由于旨在利用多線程功能GPU的并行計(jì)算能力-core結(jié)構(gòu)。 GPU計(jì)算在醫(yī)學(xué)物理學(xué)最近一個(gè)詳細(xì)的調(diào)查能(22),其中Pratx是在接受調(diào)查的醫(yī)療物理學(xué),發(fā)現(xiàn)了優(yōu)化
17、三個(gè)方面現(xiàn)有的應(yīng)用程序,即圖像重建以及圖像處理,劑量計(jì)算和治療計(jì)劃醫(yī)學(xué)圖像配準(zhǔn),兩個(gè)或兩個(gè)以上的圖像轉(zhuǎn)變成一個(gè)共同的參照框架,除了保留傳統(tǒng)的GPU的優(yōu)點(diǎn),例如巨大的存儲(chǔ)器功率的高性能計(jì)算,新開(kāi)發(fā)的GPU計(jì)算平臺(tái),帶來(lái)的可編程性和一般性的(24)。為了提供參考源,研究人員計(jì)劃開(kāi)發(fā)修改GPGPU技術(shù)的程序,是歐文等人的研究領(lǐng)域。通用計(jì)算上的圖形硬件和各種通用計(jì)算應(yīng)用(25)進(jìn)行了調(diào)查。此外,比較GPGPU和傳統(tǒng)CPU的許多性能的研究發(fā)表。使
18、用GPG</p><p><b> 醫(yī)學(xué)圖像分割</b></p><p> 圖像分割的定義和方法</p><p> 如今,醫(yī)學(xué)圖像分割在醫(yī)學(xué)圖像分析中起著的重要作用,例如,計(jì)算機(jī)輔助診斷(CAD),手術(shù)計(jì)劃和導(dǎo)航(19)。其目的是把目標(biāo)圖像劃分成連接的區(qū)域,這是有意義的數(shù)學(xué)分析和醫(yī)學(xué)圖像的量化。由經(jīng)典定義,圖像分割表示分割一個(gè)目標(biāo)圖像劃分
19、成其非重疊結(jié)構(gòu)區(qū)根據(jù)某些準(zhǔn)則,如彩色信息,灰度強(qiáng)度或紋理特征(29)。為求圖像分割定義中,某一圖像2的域Ω:IRRΩ??被分成一組N類標(biāo)簽被映射{}:1,2,...,SNΩ??,則分割問(wèn)題可表示作為確定子標(biāo)簽kS?Ω其聯(lián)合是整個(gè)圖像域Ω,而子標(biāo)簽KS必須滿足</p><p> 在醫(yī)學(xué)成像過(guò)程中,一個(gè)分段方法應(yīng)該找到,那些對(duì)應(yīng)于不同的解剖結(jié)構(gòu),或感興趣的區(qū)域的圖像(30)中的標(biāo)簽。其結(jié)果是,許多分割算法已被廣泛地
20、在宿主出版物(31)研究了很多年,但他們依然是開(kāi)放的困難任務(wù),由于對(duì)象形狀的巨大可變性和圖像質(zhì)量的變化。這些分割方法,大致可分為四組:(Ⅰ)基于像素的,(II)基于邊界的基礎(chǔ),(Ⅲ)基于區(qū)域的,和(IV)混合為基礎(chǔ)的方法</p><p> 2D,3D的精確分割,甚至4D醫(yī)療圖像隔離解剖結(jié)構(gòu)的,進(jìn)一步醫(yī)療分析是必要和重要的,幾乎任何計(jì)算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)都被應(yīng)用。 2006年8月,Boukerroui介紹了超聲圖像分
21、割的調(diào)查在臨床應(yīng)用中的作用,相應(yīng)的分割技術(shù)進(jìn)行了進(jìn)一步的分類,使用前信息(33)的條款。通常情況下,獲得良好的分割性能總是依賴于定量的視覺(jué)表征和圖像特征,這有助于從圖像背景提取組織/結(jié)構(gòu)。由于傳感器噪聲或低信噪比的情況下,分割技術(shù)往往不能達(dá)到目標(biāo)。因此,為了提高分割性能,圖像功能已經(jīng)廣泛地在醫(yī)學(xué)圖像分割(34)成功地利用。同時(shí),統(tǒng)計(jì)形狀模型的主動(dòng)形狀??模??型(ASM),提出了有效地改善分割的質(zhì)量的結(jié)果(35)?;谛〔ㄗ儞Q,Dava
22、tzikos等。進(jìn)一步提出了在(36)以分層的ASM的方法。本地和全局域的方法,是根據(jù)目標(biāo)圖像的強(qiáng)度分布,也被廣泛用于圖像分割(37)。此外,奧謝爾和Sethian于1988年首先提出的水平集方法,是一個(gè)強(qiáng)大而靈活的數(shù)字技術(shù)的圖像分割(38)。目前,這種電平設(shè)定方法及其擴(kuò)展已被廣泛用于去噪,登記,圖像修復(fù)等,更多的圖像處理應(yīng)用。</p><p> 上述的自動(dòng)分割技術(shù)通常以實(shí)現(xiàn)所需的臨床和實(shí)際應(yīng)用(39)強(qiáng)大的分
23、割結(jié)果。其結(jié)果是,許多自動(dòng)交互式機(jī)制最近已成為最佳的選擇,在現(xiàn)實(shí)生活中的醫(yī)療應(yīng)用,例如交互式輪廓圈定(40)和種子區(qū)域生長(zhǎng)(41,42)。理想的是,所述交互過(guò)程可發(fā)生在以允許用戶接收,關(guān)于他們的行為的即時(shí)反饋和改善的組織/結(jié)構(gòu)分割的準(zhǔn)確性。醫(yī)學(xué)圖像的分割仍然是一個(gè)挑戰(zhàn)性的問(wèn)題。</p><p> 在基于GPU的細(xì)分相關(guān)工作</p><p> 雖然上述分割的研究已經(jīng)變得越來(lái)越活躍,近幾十
24、年來(lái),因?yàn)樗鼈兊膬r(jià)格昂貴,不適合實(shí)時(shí)診所應(yīng)用。幸運(yùn)的是,分割的方法可以以實(shí)時(shí)來(lái)實(shí)現(xiàn),通過(guò)這些方法給GPU結(jié)構(gòu)(19)的移植去適應(yīng)操作環(huán)境。表1列出了一些基于GPU的圖像分割的方法和各自的特點(diǎn)</p><p> Shi等。基于GPU的醫(yī)學(xué)圖像計(jì)算調(diào)查</p><p> 基于GPU的醫(yī)學(xué)圖像分割技術(shù)的首次實(shí)施是通過(guò)制定水平集分割的、圖像融合(50)的、圖形運(yùn)算符的、序列來(lái)實(shí)現(xiàn)的。可編程著色
25、器帶來(lái)了更大的靈活性,并啟用使用曲率正規(guī)化等值面(51)3D圖像的分割。然后,在CUDA(52)實(shí)現(xiàn)的。在一般情況下,分割的方法也可以被分為寬窄兩類,即,低級(jí)別和高級(jí)別的方法。區(qū)別低層次的方法,需要關(guān)于圖像中的對(duì)象的類型,沒(méi)有統(tǒng)計(jì)的信息,直接操縱像素/體素信息,以形成感興趣的(19)連接的對(duì)象/區(qū)域。分水嶺(53)和區(qū)域生長(zhǎng)方法(54)的基于GPU的實(shí)現(xiàn)是典型的低級(jí)別的方法。一個(gè)更復(fù)雜和強(qiáng)大的統(tǒng)計(jì)分割,是基于自適應(yīng)區(qū)域生長(zhǎng)過(guò)程(55)G
26、PU平臺(tái)來(lái)實(shí)現(xiàn)。此外,馬爾可夫隨機(jī)場(chǎng)(MRF)和圖割有另外兩種類型的低級(jí)別在文獻(xiàn)(56,57)找到。</p><p> 在高層次的框架分割,測(cè)地活動(dòng)輪廓(58),傳統(tǒng)的活動(dòng)輪廓的變形(蛇)(59),已經(jīng)有效地實(shí)現(xiàn)在GPU上,以結(jié)構(gòu)如(在二維圖像的前景和背景區(qū)域之間的差異60)為研究目標(biāo)。在GPU的計(jì)算框架,其它方法用于實(shí)現(xiàn)主動(dòng)輪廓與梯度矢量流(GVF)外力已被引入(61,62),但他們被限制于僅2D圖像分割。然
27、后,基于NVIDIA CUDA架構(gòu)的并行分割的框架,提出了使用離散變形模型(19)體積圖像分割。還提出了幾種醫(yī)學(xué)圖像分割的方法,通過(guò)CUDA的(63)和CUDA的GPU(64)不同的方式實(shí)施,實(shí)現(xiàn)了高性能的增速比(65)。此外,醫(yī)學(xué)影像繼續(xù)增加的尺寸和體積。為了在臨床能應(yīng)用高維圖像分割,至關(guān)重要的圖像分割方法可以,用在GPU / CUDA非常大的數(shù)據(jù)集。因此,在GPU /基于CUDA的高維分割,用低計(jì)算成本仍然是為未來(lái)的醫(yī)學(xué)成像樹(shù)立挑戰(zhàn)
28、。</p><p><b> 互動(dòng)種子區(qū)域生長(zhǎng)</b></p><p> 引晶的區(qū)域生長(zhǎng)方法被引入,以實(shí)現(xiàn)進(jìn)行最終分割結(jié)果(41)。然而,對(duì)于傳統(tǒng)的基于CPU的分割執(zhí)行的計(jì)算成本太高,在生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用中始終是負(fù)的情況下。GPU / CUDA可以用來(lái)加速和滿足,種子區(qū)域生長(zhǎng)方法化潛在的臨床應(yīng)用的要求里。</p><p> 在互動(dòng)種子區(qū)域生長(zhǎng)的
29、分割過(guò)程中,種子點(diǎn)的選擇是一個(gè)至關(guān)重要的步驟。在實(shí)際應(yīng)用中,快速體積分割框架,采用可編程圖形硬件,提出了一種基于該種子區(qū)域生長(zhǎng)方法(54)。在此框架下,用戶被允許以交互方式作畫(huà),種子在卷的剖面圖繪制。最近,Schenke提出的。已經(jīng)實(shí)施了基于GPGPU的種子區(qū)域生長(zhǎng)方法片段著色器和VTK(32)。在種子區(qū)域生長(zhǎng)分割的框架,它是必不可少的繪制作為許多種子點(diǎn),盡可能充分利用GPU / CUDA的并行性能。 2006年,提出了一種基于草圖的接
30、口,為種子區(qū)域生長(zhǎng)量的分割提供了可能,用戶可以自由勾畫(huà)感興趣區(qū)域(ROI)。同時(shí),區(qū)域生長(zhǎng)方法被提出,用于快速三維器官分割,比的CPU(66)傳統(tǒng)的分割方法更快。考夫曼和Piche提出了種子細(xì)胞自動(dòng)機(jī)(CA)。交互式種子區(qū)域生長(zhǎng)可以高效和有效的用于2D / 3D醫(yī)學(xué)圖像分割,但不能在大量需要在有限的時(shí)間內(nèi)在線臨床分析的圖像。</p><p><b> 變分水平集分割</b></p&g
31、t;<p> 變分水平集方法(LSA)已被廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)圖像分割。簡(jiǎn)單地說(shuō),主要思想是嵌入移動(dòng)接口的初始位置,在任意時(shí)刻t,作為零水平集更高維函數(shù)的(X,)它,其中所述表面由所有點(diǎn)</p><p> 在水平設(shè)置的框架內(nèi),可以通過(guò)引入一個(gè)適當(dāng)?shù)倪\(yùn)動(dòng)功能(X,)表面tυ執(zhí)行各種各樣的變形。對(duì)于分割,速度往往包括兩個(gè)方面的結(jié)合</p><p> 其中D是一個(gè)數(shù)據(jù)術(shù)語(yǔ),二維醫(yī)療
32、用圖像分割(n=2 in </p><p> 這種方法代表了一個(gè)不斷發(fā)展的分割邊界,作為一個(gè)功能上的二維網(wǎng)格(67)的零水平集。對(duì)LSA廣泛的研究已經(jīng)完成,以此來(lái)提高分割性能。這個(gè)LSA的全面審查和其相關(guān)的數(shù)字技術(shù),被記錄在醫(yī)療成像文獻(xiàn)(29,30,33)。水平集方法處理好接口與尖角,以及3D并發(fā)癥(68)。 LSA的許多擴(kuò)展,因?yàn)椴⑿行院透咚儆?jì)算要求的高度,適合使用在實(shí)施GPU。早期的貢獻(xiàn)有Lefohn和惠特
33、克,他們展示了完整的3D級(jí)別設(shè)置求解器,使用圖形處理器用于MRI腦分割(69)。然后Lefohn等。設(shè)計(jì)了一個(gè)交互式的LSA,基于GPU計(jì)算時(shí)臨床應(yīng)用的目標(biāo)對(duì)象,用10×15×加速在非加速版本(48)。然而,這些方法都注意到的級(jí)別設(shè)置偏微分方程的稀疏性質(zhì)二酯酶(PDE)的優(yōu)點(diǎn),因此,計(jì)算性能用現(xiàn)有高度優(yōu)化的CPU實(shí)現(xiàn)(70)。在(71),一個(gè)有效的基于GPU的分割方法,通過(guò)包裝的級(jí)別設(shè)置,稀疏紋理格式得到高的分割性能
34、。依靠圖形硬件,這個(gè)級(jí)別設(shè)置分割方法可以運(yùn)行在實(shí)時(shí)臨床。</p><p> 在GPU上運(yùn)行計(jì)算問(wèn)題,即使透過(guò)水平集分割方法也總是不盡人意。在工作??效率的并行算法框架方面,羅伯茨等人,提出了一種新的基于GPU的水平集分割算法,這使得雙方的工作效率加強(qiáng)了。該算法減少處理級(jí)別設(shè)置字段的元素?cái)?shù),由16×和減到14×,比先前基于GPU的算法更快,而分割精度不降低(44)。這種分割方法是第一次基于GP
35、U的水平集分割算法,具有線性工作的復(fù)雜性和對(duì)數(shù)步的復(fù)雜性。同時(shí),另一新穎CUDA加速水平集分割方法提出了顯著改善的性能的方法,例如,16×減少在計(jì)算域的大小,9×加速相比以前的GPU的方法,但在分割正確性上沒(méi)有減少精度(72)。擴(kuò)展二維水平集分割算法的3D仍然是一個(gè)相對(duì)簡(jiǎn)單的,但困難的任務(wù)。例如,計(jì)算水平集的更新需要有更多的衍生物。此外,該存儲(chǔ)和計(jì)算三維醫(yī)學(xué)圖像分割的復(fù)雜性,還必須理解的(73)</p>
36、<p><b> 醫(yī)學(xué)圖像配準(zhǔn)</b></p><p> 圖像配準(zhǔn)的定義和方法</p><p> 如在醫(yī)學(xué)圖像處理的最重要的步驟之一,圖像配準(zhǔn)的目的是獲得的來(lái)自多個(gè)源收集的信息綜合分析。在一般情況下,該醫(yī)療用圖像注冊(cè)應(yīng)建立一個(gè)參考圖像,RI和目標(biāo)圖像之間的對(duì)應(yīng)措施,TI,使用參數(shù)變換,()tT?,圖像幾何形狀中具有相似功能的線,()ρ?的,指定的注冊(cè)
37、的性能,兩個(gè)圖像具有不同的尺寸,投影算子,RP和TP,可并入到項(xiàng)目更高維圖象域,變換到一個(gè)較低的三維圖像域,然后,將</p><p> 式優(yōu)化。 [3]大多數(shù)值是來(lái)確定最佳的變換()tT?。從初始猜測(cè)開(kāi)始,()tT收斂到最佳的一系列目標(biāo)函數(shù),圖像轉(zhuǎn)換和優(yōu)化技術(shù)(31,74)迭代步驟。如圖(75,76),所述圖像配準(zhǔn)過(guò)程一般包括以下四個(gè)步驟:</p><p> 特征檢測(cè)。在此步驟中,突出
38、的顯著特征/結(jié)構(gòu)會(huì)被手動(dòng)或自動(dòng)地優(yōu)選萃取。該地區(qū)一樣,線,點(diǎn)的特點(diǎn)也是所考慮的重要對(duì)象。同時(shí),該特征檢測(cè)過(guò)程不是在退化圖像的加法性,噪音丟失的數(shù)據(jù)敏感性。在此步驟中,相應(yīng)的映射的算法還應(yīng)該是有力和有效的。該特征是對(duì)應(yīng)映射功能后建立的,根據(jù)使用構(gòu)造映射函數(shù)疊加的兩個(gè)圖像的參照?qǐng)D像作為變換的目標(biāo)圖像。圖像需要重采樣和改造。在最后的步驟中,變換處理,可以實(shí)現(xiàn)向前或向后的方式。同時(shí),應(yīng)當(dāng)提出適當(dāng)?shù)膬?nèi)插技術(shù)來(lái)計(jì)算,目標(biāo)圖像的非整數(shù)坐標(biāo)的強(qiáng)度值。&
39、lt;/p><p> 每個(gè)登記步驟都有其典型問(wèn)題。因此,用戶必須決定什么樣的功能是適合于給定的醫(yī)學(xué)圖像,以逐步提高配準(zhǔn)精度。此外,用于圖像配準(zhǔn)的電流的技術(shù)可以分為兩大類:即,基于特征和基于像素的兩種方法(77)。這些類別也稱為醫(yī)療成像幾何登記和標(biāo)志性的登記。</p><p> 如果同時(shí)引用和目標(biāo)圖像明顯與眾不同,容易辨識(shí)物體/地區(qū),是基于特征的登記方法選擇。然而,如果簡(jiǎn)單的顯著特點(diǎn)是難于從
40、兩個(gè)圖像中提取,所述基于像素的方法可能更有效,更高效。在基于特征的方法中,參考和目標(biāo)圖像是使用一組有限的特征提取的?;谔卣鞯姆椒ǖ幕驹硎牵员M量減少對(duì)參考圖像的使用:穩(wěn)健M估計(jì)方法(78)的彎曲點(diǎn),它們的對(duì)應(yīng)點(diǎn)與目標(biāo)圖像之間的總誤差。 Pilet等。提出了一種更先進(jìn)的方法,其中登記可經(jīng)受非常大的非仿射變形(79)。的基于特征的配準(zhǔn)算法的主要優(yōu)點(diǎn)是,它可以處理大的變形,有效的計(jì)算復(fù)雜性方面的方法。基于像素的登記是用于圖像配準(zhǔn),這種方
41、法的主要優(yōu)點(diǎn)是,用于參數(shù)估計(jì)的數(shù)據(jù)比在基于特征的方法更密集。如在基于特征的方法,它是無(wú)法估計(jì)超參數(shù)的(77)。</p><p> 相似性度量,幾何變換和優(yōu)化過(guò)程</p><p> 圖像配準(zhǔn)技術(shù)的目標(biāo)是最大化相似性和最小化的兩個(gè)圖像之間的匹配誤差:基準(zhǔn)圖像(也稱為靜態(tài)圖像)和對(duì)象圖像(運(yùn)動(dòng)圖像)。圖3示出醫(yī)學(xué)圖像配準(zhǔn)可以由四個(gè)分量來(lái)表示的方法:相似性測(cè)量(測(cè)量器),幾何變換,優(yōu)化過(guò)程和插
42、補(bǔ)。如圖3所示,參數(shù)Ψ和ζ表示兩個(gè)顳圖像和預(yù)選的閾值之間的匹配程度。</p><p> 基于GPU的相似性測(cè)量</p><p> 相似性測(cè)量是測(cè)量圖像的相似性,這是需要的自動(dòng)圖像配準(zhǔn)的方法。這項(xiàng)措施可以評(píng)估如何讓圖像緊密對(duì)齊。理想的是,該相似性度量ρ達(dá)到其最大值,該圖像被完全對(duì)齊。該相似性度量可分為兩大類:(Ⅰ)基于特征,和(II)的基于強(qiáng)度的措施。像素強(qiáng)度基于相似性度量,利用該圖像數(shù)
43、據(jù)的一個(gè)大的部分,因此,通常達(dá)到高于基于特征的方法(80)更準(zhǔn)確的配準(zhǔn)結(jié)果。因此,我們主要調(diào)查在本文中,這些強(qiáng)度為基礎(chǔ)的相似性措施的平方差(I)之和(SSD)</p><p> 在SSD已實(shí)施在GPU上,如在(81),這是最簡(jiǎn)單的體素的相似性度量。在數(shù)學(xué)上,SSD定義如下:</p><p> 其中,RTI是兩個(gè)圖像RI和TI和RI的重疊和Ti是兩個(gè)圖像RI和TI分別的強(qiáng)度。</p
44、><p> (II)的歸一化互相關(guān)(NCC)的</p><p> GRABNER等。調(diào)查NCC作為相似性度量,驗(yàn)證的圖像中的(82)的強(qiáng)度之間的仿射關(guān)系的存在。 NCC由下式給出</p><p> (Ⅲ)的相關(guān)性比(CR)的</p><p> 在CR概括的相關(guān)系數(shù),它是一個(gè)對(duì)稱量度的線性依賴性兩個(gè)圖像(83)之間:</p>
45、<p> (四)互信息(MI)</p><p> MI已經(jīng)利用成功用于大量的各種組合包括MR,CT,PET,和SPECT。定參考圖像RI和目標(biāo)圖像TI,我們定義他們的聯(lián)合概率密度函數(shù),特皮杰,通過(guò)簡(jiǎn)單的2D-直方圖。讓()RPI和()TPJ表示相應(yīng)的邊際概率密度函數(shù)(83,84)。 RI和TI之間的MI被定義如下:</p><p> MI可能是目前最流行的多峰測(cè)量,以及相應(yīng)
46、的MI為基礎(chǔ)的圖像配準(zhǔn)技術(shù)已受到很大關(guān)注,在文獻(xiàn)(85)。在(86),提出了一個(gè)近似直方圖計(jì)算方法,加快MI計(jì)算和注冊(cè)使用NVIDIA CUDA GPU,但是在精度降低的代價(jià)基礎(chǔ)上。然后同第一作者進(jìn)一步提交的MI相似性度量,這可以實(shí)現(xiàn)高速性能(小于1秒),用于使用一種商品的GPU(87)的三維醫(yī)學(xué)圖像配準(zhǔn)并行計(jì)算的有效方法。其他研究人員也已經(jīng)意識(shí)到GPU計(jì)算的計(jì)算相似度的潛在能力,并提出很多有效的措施相似。 Ruiz等。登記顯微圖像非硬
47、性(88)建議對(duì)GPU的一個(gè)里程碑,基于相似性度量。在(89)中,新的相似性度量是通過(guò)組合數(shù)字重建射線照片(的DRR)和X射線圖像之間的8相似的措施,更精確和魯棒計(jì)算的相似性度量引入。以產(chǎn)生在低維空間中,Khamene等相似性度量。提出利用投影另一種新的方法和GPU(90)進(jìn)行了比較研究,在不同的相似性措施。根據(jù)實(shí)證研究(81),梯度相關(guān)(GC),在GPU上執(zhí)行一個(gè)特定的相似性度量的另一實(shí)例中,可有助于提高登記性能的穩(wěn)健性。</p
48、><p> 基于GPU的幾何變換</p><p> 由于六度在幾何變換自由度,圖像配準(zhǔn)方法可以分為三類:剛性,仿射,以及非剛性(參數(shù)或非參數(shù))接近(80)。另一方面,在剛性和仿射幾何變換僅取決于幾個(gè)全局參數(shù)(例如圖像大小,位置和方向),因?yàn)樗鼈儾恍枰袼兀?)的非線性位移。這兩種轉(zhuǎn)化方法適用于剛性的組織,如骨盆,股骨,并且其通過(guò)顱骨約束大腦運(yùn)動(dòng)。相比之下,非剛性配準(zhǔn)是利用當(dāng)身體部位進(jìn)行非剛
49、性運(yùn)動(dòng)或變形期間的醫(yī)療圖像采集,這是適合于軟組織,例如乳腺和肝(91)。迄今為止,只有少數(shù)的非剛性的應(yīng)用已經(jīng)公布,相對(duì)于剛性2D / 3D配準(zhǔn)出版物。</p><p> 目前,基于GPU的剛性幾何變換方法已在(1,23)審查。盡我們所知,Strzodka等。首次提出在2003年(92)在DX9圖形硬件快速的2D變形圖像配準(zhǔn)。在(92)的正規(guī)化梯度流量(RGF)的方法,梯度是由雅可比迭代過(guò)程中多重網(wǎng)格循環(huán)正規(guī)化。
50、此外,RGF準(zhǔn)算法的擴(kuò)展有效地在(93)中實(shí)現(xiàn)的二維和三維可變形圖像配準(zhǔn)通過(guò)GPU加速。在圖像配準(zhǔn)的常用方法是惡魔的算法,這是一種光流的變體(94)。在(95),Sharp等。實(shí)施使用布魯克編程環(huán)境的惡魔的算法。此外,加速了惡魔的算法得到了進(jìn)一步的落實(shí)上利用GPU CUDA,和高品質(zhì)和卓越的性能均達(dá)到(96)。同時(shí),Rezk-薩拉馬等提出了一個(gè)適當(dāng)?shù)臄?shù)學(xué)模型,并示出如何卷的變形可以通過(guò)數(shù)據(jù)并行處理使用圖形硬件(97)而加速。同時(shí),幾何變
51、換方式花費(fèi)其大部分的總計(jì)算時(shí)間進(jìn)行插值。這些內(nèi)插方法,例如線性,二次,三次,三次B樣條和高斯插值,已被普遍用于幾何變換(98)。</p><p> 基于GPU的優(yōu)化過(guò)程</p><p> 圖像配準(zhǔn)的目的是發(fā)現(xiàn),通過(guò)優(yōu)化相似性度量函數(shù)在方程拉一個(gè)圖像到最佳的空間對(duì)應(yīng)與其他圖像的最優(yōu)幾何變換。 3.在圖像配準(zhǔn)中,優(yōu)化過(guò)程可以被廣義地分類為基于梯度或梯度自由,全局或局部和串行或并行(23)。
52、基于梯度的方法需要的成本函數(shù)的偏導(dǎo)數(shù)的計(jì)算。因此,基于梯度的方法是不是從實(shí)現(xiàn)的角度來(lái)看梯度自由方法更多地參與。大量的算法已實(shí)施了醫(yī)學(xué)圖像配準(zhǔn)(91,99,100),但只有小部分可以被直接利用GPU的并行計(jì)算平臺(tái)上,以滿足實(shí)際的臨床應(yīng)用的要求。 2007年,維特爾等人。提出了一種基于梯度的配準(zhǔn)方法,包括使用頂點(diǎn)紋理取2D直方圖的一個(gè)GPU的友好的計(jì)算,以及遞歸高斯濾波GPU上(101)的實(shí)現(xiàn)。同時(shí),另一個(gè)快速GPU實(shí)現(xiàn)還提議在(102),
53、其采用的DX10兼容GPU的新的硬件功能和一系列優(yōu)化策略快速非剛性多模態(tài)體積登記。該相似性度量和幾何變換的計(jì)算是注冊(cè)的計(jì)算瓶頸。因此,研究人員應(yīng)進(jìn)一步支付開(kāi)發(fā)更有效的并行技術(shù)為這些組件的更多關(guān)注。</p><p><b> 醫(yī)學(xué)圖像可視化</b></p><p> 在醫(yī)學(xué)圖像可視化的一般方法和挑戰(zhàn)</p><p> 在一般情況下,圖像的可
54、視化已成為視覺(jué)分析,例如,在科學(xué),工程和醫(yī)學(xué)學(xué)科一個(gè)越來(lái)越重要的工具。尤其是在醫(yī)療成像應(yīng)用,可視化是醫(yī)療診斷和手術(shù)計(jì)劃開(kāi)采列入2D / 3D圖像數(shù)據(jù)集的重要信息是必不可少的。為了進(jìn)一步了解和洞察生成的圖像數(shù)據(jù)背后,可視化技術(shù)是一個(gè)正確的選擇,這可能探索和查看醫(yī)療數(shù)據(jù)集的視覺(jué)圖像的方便(103)。例如,所收集的醫(yī)療數(shù)據(jù),這源于傳感器測(cè)量,例如CT和MRI的數(shù)值模擬,總是趨向于非常大。因此,醫(yī)療數(shù)據(jù)的可視化是不可或缺的理解和充分利用這一醫(yī)療
55、數(shù)據(jù)(104,105)。</p><p> 根據(jù)不同的方法中,圖像的可視化的方法可以分為兩個(gè)不同的組(103):表面繪制,和體繪制。表面呈現(xiàn)歷來(lái)通過(guò)從3D標(biāo)量場(chǎng)提取相應(yīng)的等值面的多邊形網(wǎng)格,通常通過(guò)使用移動(dòng)立方體(MC)算法(106107)的一些變種來(lái)實(shí)現(xiàn)。在表面繪制的第一步是構(gòu)造物體表面的數(shù)學(xué)模型。堆焊渲染技術(shù)被利用來(lái)重構(gòu)連續(xù)的表面,然后以計(jì)算紋理坐標(biāo)和范數(shù)向量的最后面。此外,在渲染圖像的像素值是正比于光的朝
56、向從所有可見(jiàn)表面區(qū)域(108)的觀察者反射的光量。然而,表面呈現(xiàn)有幾個(gè)缺點(diǎn)和問(wèn)題。首先,它是難以實(shí)施的更復(fù)雜的照明模型,可以對(duì)形狀的更好的視覺(jué)感知(107)是有用的。其次,使用多邊形網(wǎng)格體積的分段線性逼近可以從卷中數(shù)據(jù)的實(shí)際等值面拓?fù)洳煌?。這樣的不良行為是不可接受的一些科學(xué)應(yīng)用(109110)。第三,雖然表面渲染對(duì)渲染時(shí)間一個(gè)令人滿意的性能,它可能只顯示醫(yī)療對(duì)象的表面特征</p><p> 不像表面繪制方法,體
57、繪制(也稱為直接體繪制)是用于可視化三維離散采樣數(shù)據(jù)通過(guò)計(jì)算有色半透明體積的二維凸起設(shè)置的技術(shù),其可以顯示三維標(biāo)量場(chǎng)的全部信息(111)。在一般情況下,該體積通常被認(rèn)為是氣態(tài)顆粒在體繪制的分布。為了進(jìn)一步理解的體繪制,沿著觀看線傳遞的體積,然后到達(dá)觀察者是仿照?qǐng)D4中的入射光的原理。</p><p> 在數(shù)學(xué)上,光強(qiáng)度I的差分變化以位置S沿射線被定義由下列微分方程:</p><p> 其
58、中,() Sτ是消光系數(shù),該衰減的光強(qiáng)度()是在位置s。 ()QS是源項(xiàng),讓光在位置S排出量。最終強(qiáng)度I開(kāi)始的初始強(qiáng)度I 0,必須在差動(dòng)式數(shù)值近似。[8]。</p><p> 圖4原理容積再現(xiàn):一個(gè)觀察光線追蹤的道路上的觀察者。而光線穿過(guò)體積,入射光強(qiáng)度I 0是由發(fā)射和吸收改變,從而導(dǎo)致在最終的強(qiáng)度I到達(dá)觀察者(112)</p><p> 體繪制的方法可分為兩類:空間域和變換域的方法。
59、該空間域的方法可以進(jìn)一步劃分為對(duì)象的順序和圖像順序的方法在表2中(103)。近年來(lái),研究已經(jīng)提出了一些混合方法(120121),但他們的fundaments仍然基于的兩個(gè)主要類別。由于圖像像素的預(yù)測(cè)是離散的,對(duì)象,訂單量渲染的方法很簡(jiǎn)單,速度快,但往往免受不必要的渲染假象(122)受到影響。幸運(yùn)的是,建議潑灑(或占用)方法可以克服這一缺點(diǎn)(113114)。由于在潑灑的方法的視圖依賴性重采樣,剪切經(jīng)線體繪制方法,被認(rèn)為是速度最快的類型的體
60、繪制,提出克服重采樣為任意的立體圖(115)的缺點(diǎn)。然而,這種方法尚未優(yōu)選在現(xiàn)代醫(yī)學(xué)和臨床應(yīng)用中,由于其不理想的渲染質(zhì)量和所需復(fù)雜的預(yù)處理(123)。相比之下,光線投射算法,一個(gè)圖像階體繪制方法,實(shí)現(xiàn)了更高的渲染性能比剪切變形體繪制方法(124)。然而,圖像訂單量渲染的方法,違背了GPU生成圖像的方式。其他對(duì)象階3D紋理基體繪制算法也被廣泛應(yīng)用到遮光體繪制的,因?yàn)樗鼈兛梢酝ㄟ^(guò)GPU加速(116)大大加速通過(guò)數(shù)據(jù)并行處理。</p&g
61、t;<p> 通過(guò)使用傅立葉切片定理,體繪制,也可以在頻域中實(shí)現(xiàn)。后面的體積數(shù)據(jù)被轉(zhuǎn)換成頻率,逆快速傅立葉或快速哈特利變換被用于產(chǎn)生最終的圖像通過(guò)將所提取的切片回空間域(117118)。盡我們所知,變換域渲染方法包括:傅里葉體繪制(FVR)以及傅里葉小波體繪制(FWVR)。該FWVR充分利用了光線投射渲染和小波潑灑在小波空間(125,126)的優(yōu)勢(shì)。通過(guò)使用小波作為重建過(guò)濾波器,小波潑灑可以修改在實(shí)際應(yīng)用中(119)的標(biāo)
62、準(zhǔn)方法潑灑。此外,F(xiàn)WVR和標(biāo)準(zhǔn)FVR具有相同的時(shí)間復(fù)雜度,即2(日志)ONN,而小波潑灑具有復(fù)雜3()接通。盡管如此,F(xiàn)WVR經(jīng)常遭受的切片需要重新采樣的傅立葉空間以全分辨率(127)處于劣勢(shì)。</p><p> 對(duì)基于GPU的醫(yī)學(xué)圖像可視化方法的優(yōu)點(diǎn)</p><p> 由于醫(yī)學(xué)成像的快速增加計(jì)算的復(fù)雜性,現(xiàn)在限制了先進(jìn)的技術(shù)在醫(yī)療和臨床應(yīng)用的發(fā)展。最初設(shè)計(jì)用于數(shù)據(jù)并行加速在計(jì)算機(jī)圖
63、形的過(guò)程中,在GPU將自身定位為用于運(yùn)行并行計(jì)算來(lái)處理的醫(yī)療數(shù)據(jù)集(22),一個(gè)通用平臺(tái)。尤其是現(xiàn)在在醫(yī)學(xué)診斷,其高度依賴于,必須在實(shí)時(shí)可視化的體積的成像方法。所有上述體繪制方法可在GPU的被部分地或完全地實(shí)現(xiàn)為加速度。面繪制(SR)是顯示三維圖像,這可被分為兩大類的常用方法:直接面繪制(DSR)和間接面繪制(ISR)(128129)。 DSR可視為直接體繪制(DVR)的一種特殊情況,而ISR被認(rèn)為是物體表面的建模。在最近的醫(yī)療應(yīng)用中,
64、通過(guò)使用GPU加速和幾何著色器的優(yōu)點(diǎn),在ISR渲染技術(shù)已經(jīng)大大加快了(130)。對(duì)于DSR,表面呈現(xiàn)可以在沒(méi)有中間的幾何圖元的表示來(lái)實(shí)現(xiàn)</p><p> 表面繪制往往實(shí)現(xiàn)對(duì)比度增強(qiáng)CT數(shù)據(jù)顯示骨骼和血管結(jié)構(gòu)。但是,有時(shí)很難為研究者和醫(yī)生呈現(xiàn)(131)圖像的準(zhǔn)確性和可靠性。另一方面,DVR的一個(gè)主要的技術(shù)是用于3D醫(yī)療數(shù)據(jù)顯示,實(shí)施對(duì)所述數(shù)據(jù)集的整個(gè)圖像顯示,而不對(duì)應(yīng)于所述關(guān)注的特征明確地提取表面。光線投射可能
65、是DVR的最探索渲染方法,并且非常適合于基于GPU由于光線被獨(dú)立處理的并行執(zhí)行。原來(lái)光線投射方法可分為三部分:初始化和射線設(shè)置,射線遍歷,并寫(xiě)入渲染結(jié)果(132)。同時(shí),首次提出了克魯格和韋斯特曼(133)和Röttger等基于GPU的光線投射的方法。 (134)于2003年通過(guò)發(fā)布一些數(shù)據(jù)管理工作的CPU,加速體繪制,板坯的鑄造技術(shù)是基于經(jīng)驗(yàn)呈現(xiàn)的,獲得從比較片段著色器執(zhí)行原始光線投射到實(shí)現(xiàn)直接轉(zhuǎn)換到CUDA內(nèi)核(132)。
66、</p><p> 近來(lái),實(shí)時(shí)4D心臟數(shù)據(jù)采集的技術(shù)已經(jīng)成為在實(shí)際臨床環(huán)境應(yīng)用,多維醫(yī)學(xué)成像模式成為現(xiàn)實(shí)。為了有效地處理4D體繪制大量的醫(yī)療容積數(shù)據(jù)的棘手的問(wèn)題,應(yīng)該加速四維醫(yī)學(xué)圖像可視化,開(kāi)發(fā)操作框架心臟數(shù)據(jù)集的(136)顯示器,這是有效地利用現(xiàn)代的并行計(jì)算能力來(lái)實(shí)現(xiàn)建造GPU??删幊坦芫€的圖形硬件和基于GPU的光線投射體繪制方法的新穎原理的進(jìn)行了描述詳細(xì)(136)。這種基于GPU的光線投射體繪制方法,是直接
67、實(shí)現(xiàn)在圖形硬件可編程頂點(diǎn)和片段處理器上。為了進(jìn)一步提高3D渲染性能,加速光線投射算法,被有效地實(shí)現(xiàn)了基于一種新穎的空間跳躍加速技術(shù)(137)。然而,呈現(xiàn)單一同質(zhì)體積不足以用于在現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的臨床。提高對(duì)多個(gè)數(shù)據(jù)集的體繪制的性能,應(yīng)該使用多卷數(shù)據(jù)集的光線投射一個(gè)新的基于GPU渲染系統(tǒng),提出在(138)。此提出了基于該代理的幾何光柵化CUDA來(lái)實(shí)現(xiàn)的,而不是傳統(tǒng)的圖形流水線的事實(shí)。與此同時(shí),多幀速率體積渲染是因?yàn)樾枰獮橥该鞯奈矬w的體積(139)
68、也特別具有挑戰(zhàn)性。</p><p> 傳統(tǒng)的多幀速率系統(tǒng)重構(gòu)整個(gè)圖像場(chǎng)景作為一個(gè)單一的表面,其中的運(yùn)動(dòng)視差知覺(jué)被摧毀。為了提高渲染質(zhì)量,Hauswiesner等。提出了多幀速率體繪制系統(tǒng),高品質(zhì)的重建和快速透明的容積再現(xiàn)(140)卓越能力。其他體繪制技術(shù),諸如像素射線圖像(141)和光場(chǎng)的表示(142),顯示出目標(biāo)卷的更豐富的描述,但要求相當(dāng)?shù)姆治鲱A(yù)處理和分別因?yàn)樗鼈兊拇蟪叽绮贿m合頻繁總線傳輸。隨著高性能計(jì)算的
69、快速發(fā)展不斷增加和近期可編程性圖形硬件,圖形硬件已經(jīng)演變成一個(gè)引人注目的平臺(tái),是廣泛的計(jì)算苛刻的任務(wù),如醫(yī)學(xué)圖像處理(143),劑量計(jì)算和治療計(jì)劃優(yōu)化(144145),計(jì)算機(jī)視覺(jué)(146),等等。如今,GPU的是高性能的標(biāo)準(zhǔn)工具之一,并在整個(gè)行業(yè)和學(xué)術(shù)界被廣泛采用(22)。許多研究人員和開(kāi)發(fā)人員成為有意利用GPU的電源通用計(jì)算。我們已經(jīng)提出了基于GPU的醫(yī)學(xué)圖像計(jì)算技術(shù)的全面調(diào)查在這篇文章中。一所有這些醫(yī)療成像的廣泛分類建議三個(gè)主要的醫(yī)
70、療用圖像處理的基礎(chǔ)上成分:分割,登記和可視化。傳統(tǒng)的基于CPU的實(shí)現(xiàn)是過(guò)慢適合于實(shí)際的臨床應(yīng)用。為了克服這一限制,目前的醫(yī)學(xué)圖像計(jì)算總是在現(xiàn)代GPU實(shí)現(xiàn)的。尤其是在醫(yī)學(xué)影像學(xué)的臨床實(shí)踐</p><p> ?。ㄒ唬┑牟糠秩莘e組織的統(tǒng)一框架分割。</p><p> ?。ǘ┽t(yī)療圖像配準(zhǔn)的部分或丟失的數(shù)據(jù)。</p><p> ?。ㄈ┚C合體繪制框架。</p>
71、<p> 圖像分割起著實(shí)際重要的作用,臨床應(yīng)用,并作為各種初步階段。診斷技術(shù)中,相應(yīng)的高分割腦部MRI圖像的性能是必不可少的,至關(guān)重要。提供正確診斷的參考信息,研究人員和醫(yī)生(147),研究大腦圖像?;屹|(zhì)(GM)白質(zhì)(WM)和腦脊髓液(CSF)。每部分體積(PV)的圖像中的體素被建模為屬于這三類中的一個(gè)(148)。在自然界中,在大腦中的光伏體素包含兩種或更多種的混合物組織類型,因此難以準(zhǔn)確地細(xì)分這些同時(shí)只使用一個(gè)3組織結(jié)構(gòu)
72、特殊的方法。大多數(shù)現(xiàn)有的分割方法[互動(dòng)種子區(qū)域生長(zhǎng),(測(cè)地線)活躍輪廓和電平組,等]不可能正確地提取的感興趣的對(duì)象/區(qū)域,其中僅含有均質(zhì)體素。統(tǒng)計(jì)模式識(shí)別可能是高效且健壯的技術(shù)作為一個(gè)統(tǒng)一的框架PV組織分割,根據(jù)素強(qiáng)度在腦MRI的統(tǒng)計(jì)特征圖像。此外,馬爾可夫隨機(jī)場(chǎng)(MRF)(149),期望最大化(EM)算法(150),和隱藏馬爾科夫鏈(HMC)(151)已被用來(lái)改善圖像分割性能??。為了加快統(tǒng)計(jì)分割過(guò)程中使用GPU加速,我們應(yīng)該進(jìn)一步思
73、考這些方法并適應(yīng)它們用于大規(guī)模并行處理環(huán)境中的實(shí)時(shí)實(shí)際的臨床應(yīng)用。在醫(yī)療和臨床應(yīng)用中,醫(yī)療圖像從相似或不同的方式經(jīng)常需要與對(duì)齊參考圖像作為許多預(yù)</p><p> 方法可以在(111156),其目的在于提供可以找到研究人員和開(kāi)發(fā)人員的指導(dǎo)方針上方法最適合在這種情況下。例如,該潑濺和光線投射呈現(xiàn)最高質(zhì)量的圖像上渲染速度,而剪切經(jīng)線和3D為代價(jià)基于紋理的方法是能夠最大程度地交互式幀率的圖像質(zhì)量(111)的成本。同時(shí)
74、,頻率域的方法進(jìn)行快速的繪制,而是被限制在平行投影和X-射線型呈現(xiàn)(157)。為了提高渲染品質(zhì),加快渲染速度,有前途的綜合性框架可以通過(guò)構(gòu)建組合空間域和變換域方法,或結(jié)合不同的空間域方法。因此,該全面的方法可能有出色的能力創(chuàng)造高品質(zhì)的渲染,減少計(jì)算時(shí)間,這可能是在不同類型的渲染的利用3并且有效地并聯(lián)用于實(shí)時(shí)醫(yī)療應(yīng)用上實(shí)現(xiàn)的GPU。</p><p><b> 參考文獻(xiàn):略</b></p
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