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1、分子生物學(xué)復(fù)習(xí)題第一章1、蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)稱為構(gòu)象(confmation),指的是蛋白質(zhì)分子中所有原子在三維空間中的排布,并不涉及共價鍵的斷裂和生成所發(fā)生的變化。2、維持和穩(wěn)定蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)的因素有共價鍵(二硫鍵)和次級鍵,次級鍵有4種類型,即離子鍵、氫鍵、疏水性相互作用和范德瓦力。3、蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)是指肽鏈中局部肽段的構(gòu)象,它們是完整肽鏈構(gòu)象(三級結(jié)構(gòu))的結(jié)構(gòu)單元,是蛋白質(zhì)復(fù)雜的立體結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ),因此二級結(jié)構(gòu)也可以稱為構(gòu)象單元。α螺旋
2、、β折疊是常見的二級結(jié)構(gòu)。4、一些肽段有形成α螺旋和β折疊兩種構(gòu)象的可能性(或形成勢),這類肽段被稱為兩可肽。5、兩個或幾個二級結(jié)構(gòu)單元被連接肽段連接起來,進(jìn)一步組合成有特殊幾何排列的局域立體結(jié)構(gòu),稱為超二級結(jié)構(gòu)(介于二、三級結(jié)構(gòu)間)。超二級結(jié)構(gòu)的基本組織形式有αα,βαβ和ββ等3類6、蛋白質(zhì)家族(family):一類蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)有30%以上同源性,或一級結(jié)構(gòu)同源性很低,但它們的結(jié)構(gòu)和功能相似,它們也屬于同一家族。例如球蛋白的氨基
3、酸序列相差很大,但屬于同一家族。超家族(superfamily):有些蛋白質(zhì)家族之間,一級結(jié)構(gòu)序列的同源性較低,但在許多情況下,它們的結(jié)構(gòu)和功能存在一定的相似性。這表明它們可能存在共同的進(jìn)化起源。這些蛋白質(zhì)家族屬于同一超家族。7、結(jié)構(gòu)域是一個連貫的三維結(jié)構(gòu),是可互換并且半獨(dú)立的功能單位,在真核細(xì)胞中由一個外顯子編碼,由至少40個以上多至200個殘基構(gòu)成最小、最緊密也最穩(wěn)定的結(jié)構(gòu),作為結(jié)構(gòu)和功能單位,會重復(fù)出現(xiàn)在同一蛋白質(zhì)或不同蛋白質(zhì)中。
4、8、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)所提供的信息有哪些?α螺旋、β折疊各自的特點(diǎn)?第二章1、DNA是由脫氧核糖核苷酸組成的長鏈多聚物,是遺傳物質(zhì)。具有下列基本特性:①具有穩(wěn)定的結(jié)構(gòu),能進(jìn)行復(fù)制,特定的結(jié)構(gòu)能傳遞給子代;②攜帶生命的遺傳信息,以決定生命的產(chǎn)生、生長和發(fā)育;③能產(chǎn)生遺傳的變異,使進(jìn)化永不枯竭。2、DNA鏈的方向總是理解為從5’—P端到3’—OH端。DNA的一級結(jié)構(gòu)實(shí)際上就是DNA分子內(nèi)堿基的排列順序。3、DNA是雙螺旋結(jié)構(gòu):主鏈由脫氧核糖和磷
5、酸基團(tuán)以3’,5’—磷酸二酯鍵交互連接構(gòu)成的,在雙螺旋的外側(cè),堿基在內(nèi)側(cè),堿基必須配對。一條鏈繞著另一條鏈旋轉(zhuǎn)、盤繞,一條鏈上的嘌呤與另一條鏈上的嘧啶相互配對,嘌呤與嘧啶以氫鍵保持在一起。4、雙螺旋DNA熔解成單鏈的現(xiàn)象稱為DNA變性。已經(jīng)變性的DNA在一定條件下重新恢復(fù)雙鏈的過程稱為復(fù)性。5、染色質(zhì)是以雙鏈DNA為骨架,與組蛋白(histon)、非組蛋白(nonhiston)以及少量的各種RNA等共同組成絲狀結(jié)構(gòu)。在染色質(zhì)中,DNA和
6、組蛋白的組成非常穩(wěn)定,非組蛋白和的間隔區(qū)可以有很大的長度差異和序列差異。重要的基因家族:rRNA基因家族、5SrRNA基因、組蛋白基因家族、珠蛋白基因家族、生長激素基因家族、超基因。7、超基因(supergene)是指一組由多基因和單基因組成的更大的基因家族。在高等真核細(xì)胞中,一個基因簇內(nèi)含有數(shù)百個功能相關(guān)的基因,它們可能是由基因擴(kuò)增后結(jié)構(gòu)上輕微變化而產(chǎn)生的,這些基因的結(jié)構(gòu)有程度不等的同源性,功能上仍保持原始基因的基本功能,或者進(jìn)化成具
7、有相關(guān)而不同的新功能,這樣的一簇基因稱為超基因家族。有免疫球蛋白超基因家族、核受體超基因家族、細(xì)胞因子超基因家族等。8、在初始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物hnRNA加工產(chǎn)生成熟的mRNA時,被切除的非編碼序列稱為內(nèi)含子(intron)。在成熟的mRNA或蛋白質(zhì)中存在的序列稱為外顯子(exon)?;虻牟贿B續(xù)性是真核生物基因所特有的,但不是所有真核生物基因都一定具有這種不連續(xù)性。9、內(nèi)含子的功能:(1)含有可閱讀框架(F),內(nèi)含子的F可能編碼酶或蛋白質(zhì),其中
8、包括逆轉(zhuǎn)錄酶、成熟酶。(2)含有各種剪接信號碼,內(nèi)含子編碼的成熟酶直接參與內(nèi)含子本身的剪接功能。(3)對基因表達(dá)有影響,內(nèi)含子對基因表達(dá)在多個水平上施加影響。內(nèi)含子中的增強(qiáng)子序列增加了基因轉(zhuǎn)錄的起始反應(yīng)。10、人類基因組計(jì)劃(humangenomicproject,HGP)的總體目標(biāo)是要完成人類全部24條染色體3109bp序列的分析。具體包括:①人類基因組作圖(遺傳學(xué)圖譜、物理圖譜)。②對基因組DNA進(jìn)行切割和克隆。③測定基因組的全部D
9、NA序列。④基因的鑒定。⑤信息系統(tǒng)的建立、信息的儲存和處理以及相應(yīng)軟件的開發(fā)。11、結(jié)構(gòu)基因組學(xué)(structualgenomics)以全基因組測序?yàn)槟繕?biāo)的基因結(jié)構(gòu)研究,闡述基因組中基因的位置和結(jié)構(gòu),為基因功能的研究奠定基礎(chǔ)。12、功能基因組學(xué)(functionalgenomics)是利用結(jié)構(gòu)基因組學(xué)提供的信息,以大規(guī)模實(shí)驗(yàn)方法及統(tǒng)計(jì)與計(jì)算機(jī)分析,全面系統(tǒng)地分析全部基因的功能。13、蛋白質(zhì)組(proteome)是一個基因組在特定細(xì)胞內(nèi)所
10、表達(dá)的蛋白質(zhì)。對于一種生物來說,它的基組DNA基本上是恒定的,但蛋白質(zhì)組是動態(tài)的。也就是不同組織的細(xì)胞中蛋白質(zhì)組是不同的,在同一細(xì)胞的不同生長狀態(tài)、病理狀態(tài)下也是不一樣的。蛋白質(zhì)組只指某一特定時間內(nèi)的蛋白質(zhì)集合體。14、生物信息學(xué)是用數(shù)理和信息科學(xué)的觀點(diǎn)、理論和方法去研究生命現(xiàn)象,組織和分析呈指數(shù)增長的生物學(xué)數(shù)據(jù)的一門學(xué)科。生物信息學(xué)位于生物、計(jì)算機(jī)、數(shù)學(xué)等多個領(lǐng)域的交叉點(diǎn)上,其研究目標(biāo)是揭示“基因組信息結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性及遺傳語言的根本規(guī)律
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