中國鮡科魚類分子系統(tǒng)發(fā)育和石爬鮡屬物種有效性的研究.pdf

1、簡要回顧了分子系統(tǒng)學的基本原理、研究方法、分析流程和系統(tǒng)發(fā)育分析方法等,以及多變量形態(tài)度量學特點與應用、鮡科魚類系統(tǒng)發(fā)育研究進展,從而有助于理解該研究的方法、目的與意義.鮡科(Sisoridae)隸屬于硬骨魚(Teleostei)、鲇形目(Siluriformes),由Regan于1911年建立.鮡科共有20屬,50種以上,在中國有12屬.有關此類群的分子系統(tǒng)發(fā)育的研究還很貧乏,一些物種的分類還存在較大爭議.選擇鈍頭鮠科(魚央)屬(Li

2、obagrus)魚類的金氏(魚央)(L.kingi)和擬緣(魚央)(L.marginatoides)作為外類群.通過PCR技術,擴增了長度為532bp的金氏(魚央)和擬緣(魚央)以及長度為534-542bp的11種鮡科魚類(31個樣品)的16S rRNA基因片段.比對得到550個位點的同源序列,其中簡約性信息位點97個,約占全部位點的17.6﹪.分析了鮡科魚類16S rRNA基因部分序列莖區(qū)(stem regions)和環(huán)區(qū)(loop

3、regions)的進化特點;計算了Kimura 2-Parameter遺傳距離;并用鄰接法、最大簡約法、最大似然法重建了鮡科魚類分子系統(tǒng)樹.將S7核糖體蛋白基因內含子2首次用作遣傳標記進行中國鮡科魚類的系統(tǒng)發(fā)育分析.通過PCR技術,擴增了長度為154bp的金氏(魚央)和擬緣(魚央)以及長度為153~168 bp的11種鮡科魚類(17個樣品)的rpS7基因內含子2序列.序列比對得到181個排列位點,其中簡約信息位點56個,占全部位點的30

4、.9﹪.分析了鮡科魚類S7核糖體蛋白基因內含子2序列,計算了p-distance和Kimura 2-Parameter遺傳距離,并用鄰接法、最大簡約法、最大似然法重建了鮡科魚類分子系統(tǒng)樹.由于替代飽和,系統(tǒng)發(fā)育分析時,沒有選擇外類群.隨后,巨魾(Bagarius yarrelli)用作樹根分析.石爬鮡屬魚類的青石爬鮡和黃石爬鮡的物種界限一直不清楚.采用形態(tài)判別和線粒體16SrRNA基因片段分析相結合的方法,分別研究分析了青石爬鮡和黃石爬