高維數(shù)據(jù)下半?yún)?shù)可加危險率模型中基于ISIS的變量選擇方法及其應(yīng)用.pdf

1、目的：
　　本文主要介紹高維數(shù)據(jù)下半?yún)?shù)可加危險率模型中基于ISIS的變量選擇方法，并探討AHAZISIS模型，AHAZLASSOISIS模型，AHAZENISIS模型，AHAZSSCADISIS模型在高維數(shù)據(jù)生存分析中的優(yōu)劣。從而揭示死亡或其他生存結(jié)局發(fā)生的時間與基因表達之間的關(guān)系，從基因?qū)用嫔蠟榧膊〉脑\療和預(yù)后以及改進治療方案提供依據(jù)。
　　方法：
　　介紹AHAZISIS模型，AHAZLASSOISIS模型，AH

2、AZENISIS模型和AHAZSSCADISIS模型的基本方法原理。針對生物信息學(xué)高維度，強相關(guān)，小樣本量的數(shù)據(jù)特征進行數(shù)據(jù)模擬，并比較四種模型在不同模擬數(shù)據(jù)下的表現(xiàn)情況。最后利用來源于TCGA的前列腺癌數(shù)據(jù)進行實證研究。
　　結(jié)果：
　?、俑鞣N模擬數(shù)據(jù)情形下，三種初次懲罰函數(shù)的模擬結(jié)果在一致性和精確性的表現(xiàn)上差別不大。
　?、诟鞣N數(shù)據(jù)情形下，四種再次懲罰函數(shù)在一致性方面OS-SCAD表現(xiàn)最好，SSCAD次之，Lass

3、o第三，EN表現(xiàn)最差；而在精確性方面，OS-SCAD和SSCAD較好，Lasso次之，EN表現(xiàn)最差。
　?、鄹鞣N數(shù)據(jù)情形下，再次懲罰函數(shù)SSCAD的不同steps在一致性方面，steps=1表現(xiàn)最好，steps=2,3,4,5比較接近；在精確性方面，steps=1表現(xiàn)最差，steps=2,3,4,5比較接近。
　?、苋N初次懲罰函數(shù)，四種再次函數(shù)以及再次懲罰函數(shù)SSCAD的不同steps在精確性方面與協(xié)變量相關(guān)系數(shù)大小呈負(fù)相

4、關(guān)，即相關(guān)系數(shù)較小則精確性高，反之精確性則低。
　?、軦HAZISIS模型、AHAZSSCADISIS模型在實證研究中篩選出基因數(shù)目少，模型可解釋性較好。根據(jù)log-rank檢驗的p值大小，AHAZISIS模型、AHAZSSCADISIS模型在實證研究中預(yù)測能力方面表現(xiàn)較好。
　　結(jié)論：
　　在模擬研究和實證研究中，各模型表現(xiàn)一致。AHAZISIS模型和AHAZSSCADISIS模型的模型解釋性較好，估計精確性也較高，