版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡(jiǎn)介
1、大連理工大學(xué)博士學(xué)位論文生物序列分析中的非比對(duì)方法及其應(yīng)用姓名:劉迎照申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:博士專(zhuān)業(yè):應(yīng)用數(shù)學(xué)指導(dǎo)教師:王天明20081101大連理工大學(xué)博士學(xué)位論文TheAlignment—freeMethodsandTheirApplicationsforAnalysisofBiologicalSequencesAbstractWiththerapiddevelopmentofthemathematicsandcomputertechnol
2、ogiesandthecontinuousaccumulationofthetremendousbiologicaldata,anewandactiveinterdiscipline—ComputationalMolecularBiologycomesintobeingTheresearchincomputationalmolecularbiologywhichhasattractedplentyofcomputerscientists
3、,molecularbiologists,mathematiciansandSOontodevotetoit,ismainlyconcernedwiththeproblemsinvolvingthecomputationalcomplexinthebiologicalapplicationsBiologicalsequenceanalysisisthekeycontentoftheinterdisciplineandthetraditi
4、onalmethodsfortheanalysisarechieflybasedonalignmentofthestrings,whilewiththecomingofthe“postgenome”“era,alignmentfreemethodsofthesequenceanalysisasthecomplementanddevelopmentofthealignmentmethodshavebecomeahotresearchare
5、aofcomputationalmolecularbiologyInthisdissertation,wefirstlysimplyreviewthealignmentmethods;secondlyrelativelysystematicallysummarizethealignmentfleemethodsandproposesomenewalignmentfleemethods;finallymaketheanalysisfors
6、omespeciessequencesusingthenovelmethodsThemaincontentsofthisdissertationarehstedasfollows:BasedonthevectorsofLtupleprobabilitiesforbiologicalsequences,weprovideanoveldistancemeasurenormalizedEuclideandistance,andclassify
7、twosetsofproteinsequences一CK35andSP86accordingtoproteinsecondarystructuresusingthedistancefunctionFurther,wecompareourmethodwithothermetricsandalignmentmethodsviaROC(ReceiverOperatingCurve)analysisinordertoassesstheintri
8、nsicabilityofthemethodologytodiscriminateandclassifybiologicalsequencesandstructuresUsingLtuples,weconsidertoconstructthree8componentsvectorsandmultivariatevectorsforaDNAprimarysequence,andbythedifferentstartpositionsoft
9、heslidingwindow,asetofrelatedmatricesaregivenThenormalizedleadingeigenvaluesandFrobeniusnormfromtheconstructedmatriceshavebeenselectedasthenumericalcharacterizationsAsapphcations,wecomparethesimilarityanddissimilarityfor
10、exon1ofpglobingenesbelongingtoelevenspecies;wesimulatethesearchforsimilarsequencesofaquerysequencefromadatabaseof39librarysequencesbythemulti—variatevectorsrepresentationsofDNAsequence;wereconstructthephylogenetictreesII
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒(méi)有圖紙預(yù)覽就沒(méi)有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫(kù)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 基于Q學(xué)習(xí)的生物序列比對(duì)方法.pdf
- 功能基因的序列比對(duì)方法
- 基于序列比對(duì)方法的金融波動(dòng)研究.pdf
- 最優(yōu)化方法在生物序列比對(duì)中的應(yīng)用與研究.pdf
- 蟻群算法在生物序列比對(duì)中的應(yīng)用.pdf
- 新型單親遺傳算法及其在生物序列比對(duì)中的應(yīng)用.pdf
- 31186.基于lz算法的多序列比對(duì)方法研究
- 基于LemplE-Ziv序列向量表示的多序列比對(duì)方法研究.pdf
- 核學(xué)習(xí)方法及其在生物序列分析中的應(yīng)用.pdf
- 17353.基于遺傳算法的序列比對(duì)方法的研究
- 基于進(jìn)化算法和量子計(jì)算的多序列比對(duì)方法研究.pdf
- 基于最大權(quán)值路徑算法的DNA多序列比對(duì)方法.pdf
- 免疫遺傳算法在生物序列比對(duì)中的應(yīng)用.pdf
- 基于遺傳模擬退火算法的生物信息學(xué)雙序列比對(duì)方法研究.pdf
- 33790.基于譜的蛋白質(zhì)序列比對(duì)方法研究
- 基于并行計(jì)算的基因序列快速比對(duì)方法研究.pdf
- 改進(jìn)免疫算法在生物序列比對(duì)中的應(yīng)用研究.pdf
- 改進(jìn)蟻群算法及其在序列比對(duì)中的應(yīng)用.pdf
- 并行遺傳算法在生物序列比對(duì)中的應(yīng)用研究.pdf
- 機(jī)器學(xué)習(xí)方法在生物序列分析中的應(yīng)用.pdf
評(píng)論
0/150
提交評(píng)論