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文檔簡(jiǎn)介
1、本工作嘗試了用ITS1-5.8S-ITS2區(qū)序列探討屬內(nèi)種問(wèn)及種群?jiǎn)栍H緣關(guān)系及用SSU-rDNA單一基因序列探討地位不明屬的系統(tǒng)地位。主要開(kāi)展了對(duì)游仆類(lèi)和腹毛類(lèi)兩個(gè)類(lèi)群基于多基因信息的系統(tǒng)發(fā)生分析,并綜合了形態(tài)、細(xì)胞發(fā)生學(xué)信息對(duì)這兩類(lèi)纖毛蟲(chóng)的系統(tǒng)做了部分修訂,是目前為止旋唇綱中涉列種屬最多的一份多基因聯(lián)合分析工作。
本工作共計(jì)提交國(guó)際基因數(shù)據(jù)庫(kù)(Genbank)新序列94條:核糖體小亞基基因序列(SSU-rDNA)18條,轉(zhuǎn)錄
2、間隔區(qū)-5.8S基因序列(ITS1-5.8S-ITS2)32條,核糖體大亞基基因序列(LSU-rDNA)44條。其中,3個(gè)屬的SSU-rDNA序列,大部分的ITS1-5.8S-ITS2序列及全部的LSU-rDNA序列均為國(guó)際間首次獲得。
主要結(jié)果包括:
1.游仆類(lèi)
1)楣纖蟲(chóng)屬(Aspidisca)各種可以通過(guò)ITS1-5.8S-ITS2區(qū)序列很好的區(qū)分開(kāi)(ITS區(qū)在種內(nèi)和種間進(jìn)化速度有明顯差異),種群穩(wěn)定
3、地聚在一起;
2)ITS1-5.8S-ITS2與SSU-rDNA形成的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系在屬內(nèi)種間、屬間及亞綱間均有一定的差異;
3)多基因聯(lián)合分析顯示尾刺蟲(chóng)科(Llronychiidae)穩(wěn)定地形成三大分支,挑戰(zhàn)了基于形態(tài)特征做出的兩個(gè)亞科的傳統(tǒng)劃分;
4)雙眉蟲(chóng)亞科(Diophryinae)的單源發(fā)生性沒(méi)有得到多基因信息的支持;
5)與SSU-rDNA單基因系統(tǒng)分析結(jié)果不同,多基因聯(lián)合分析支持了擬雙
4、眉蟲(chóng)屬(Paradiophrys)的單源發(fā)生,支持了類(lèi)雙眉蟲(chóng)屬(Diophryops)和偏雙眉蟲(chóng)屬(Apodiophrys)兩個(gè)形態(tài)屬的建立;
6)偏雙眉蟲(chóng)屬(Apodiophrys)和擬雙眉蟲(chóng)屬(Paradiophrys)形成一獨(dú)立的支系,遠(yuǎn)離雙眉蟲(chóng)復(fù)合屬中的其他種類(lèi),很可能代表了一個(gè)亞科級(jí)階元;
7)高度特化的暗色偽雙眉蟲(chóng)(Pseudodiophrys nigricans)聚在雙眉蟲(chóng)屬(Diophrys)的內(nèi)部,
5、該屬建立的合理性有待更多信息的證實(shí)。
2.腹毛類(lèi)
1)首次測(cè)序獲得了譚氏旋頸蟲(chóng)(Spirotrachelostyla tani),檸檬類(lèi)瘦尾蟲(chóng)。(Uroleptopsis citrina)和維爾伯特泡毛蟲(chóng)(Tunicothrix wilberti)三個(gè)系統(tǒng)地位有爭(zhēng)議屬的核糖體小亞基(SSU-rDNA)基因序列;
2)泡毛蟲(chóng)屬(Tunicothrix)與兩個(gè)擬雙棘蟲(chóng)(Parabirojimia)形成姐妹支,支
6、持將其歸入擬雙棘蟲(chóng)科(Parabirojimidae);
3)旋頸蟲(chóng)(Spirotrachelostyla)和尖頸蟲(chóng)(Trachelostyla)穩(wěn)定地聚為姐妹支,并和小雙蟲(chóng)(Amphisiella)形成獨(dú)特的一支,位于整個(gè)散毛類(lèi)-尾柱類(lèi)的基部,證實(shí)了旋頸蟲(chóng)(Spirotrachelostyla)應(yīng)屬于尖頸蟲(chóng)科(Trachelostylidae)的推斷;
4)趨角毛蟲(chóng)屬(Thigmokeronopsis)和偏角毛蟲(chóng)屬
7、(Apokeronopsis)應(yīng)從偽角毛蟲(chóng)科(Pseduokemopsidae)轉(zhuǎn)入尾柱蟲(chóng)科(Urostylidae);
5)雙軸蟲(chóng)屬(Diaxonella)和偏巴庫(kù)蟲(chóng)屬(Apobakuella)歸入尾柱蟲(chóng)科(Urostylidae);
6)類(lèi)瘦尾蟲(chóng)屬(Uroleptopsis)降級(jí)為偽角毛蟲(chóng)屬(Pseduokeronopsis)的亞屬,修訂后的偽角毛蟲(chóng)屬(Pseduokeronopsis)和偽角毛蟲(chóng)科(Pseudo
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