長(zhǎng)壯蝎蝽和斑衣蠟蟬線粒體基因組測(cè)序及分析(昆蟲綱：半翅目).pdf

1、本研究旨在獲得異翅亞目和蠟蟬亞目代表類群線粒體基因組的核苷酸序列及基因排序等信息，為后續(xù)解析廣義半翅目的畢業(yè)線粒體結(jié)構(gòu)和分子系統(tǒng)發(fā)育研究提供基礎(chǔ)科學(xué)數(shù)據(jù)。
　　 本研究測(cè)定了長(zhǎng)壯蝎蝽和斑衣蠟蟬線粒體基因組序列，二者均為雙鏈環(huán)狀分子，包含典型的節(jié)肢動(dòng)物線粒體基因組的37個(gè)基因，分別為13個(gè)蛋白質(zhì)基因、22個(gè)tRNA基因和2個(gè)rRNA基因，和1個(gè)A+T豐富區(qū)。兩種昆蟲線粒體基因組特點(diǎn)如下：
　　 1.長(zhǎng)壯蝎蝽和斑衣蠟蟬37個(gè)

2、線粒體基因排序和典型的節(jié)肢動(dòng)物完全相同。二者基因組結(jié)構(gòu)緊密，除（A+T）豐富區(qū)外，基因間所有非編碼序列總長(zhǎng)度最多只有43bp，甚至在9或12對(duì)基因之間存在著基因重疊現(xiàn)象。
　　 2.長(zhǎng)壯蝎蝽和斑衣蠟蟬線粒體基因組的兩條鏈上存在著嚴(yán)重的堿基偏向，其中蠟蟬具有更加顯著的AT堿基偏向。兩種昆蟲線粒體由H鏈編碼的基因，堿基A含量普遍高于T含量，堿基C含量均高于G含量，由L鏈編碼的基因四種堿基含量完全與H鏈相反。以此推測(cè)分布在2條鏈上的基

3、因在進(jìn)化中所承受的選擇壓力是不同。
　　 3.兩種昆蟲線粒體氨基酸和密碼子的使用都具有強(qiáng)烈的偏向性。主要表現(xiàn)在NNU和NNA形式的密碼子相對(duì)含量（RSCU值）在每種氨基酸密碼子中皆占絕對(duì)主導(dǎo)地位，相反NNC和NNG形式的密碼子相對(duì)含量普遍偏低，說(shuō)明這種密碼子使用的偏向性主要是由密碼子第3位點(diǎn)堿基的偏向性決定的。還發(fā)現(xiàn)在所有使用的氨基酸中疏水性氨基酸占據(jù)了一多半的比例，這和線粒體基因組編碼蛋白質(zhì)的功能相關(guān)。
　　 4.長(zhǎng)壯

4、蝎蝽與斑衣蠟蟬線粒體13個(gè)蛋白質(zhì)基因的起始密碼子都使用了通用的ATN作為起始密碼子。兩種昆蟲蛋白質(zhì)編碼基因開放閱讀框的終止密碼子多數(shù)是不完整的T-tRNA或T。
　　 5.長(zhǎng)壯蝎蝽與斑衣蠟蟬線粒體22個(gè)tRNA基因的反密碼子和多數(shù)節(jié)肢動(dòng)物一致，它們的二級(jí)結(jié)構(gòu)除了tRNA-Ser（GCU）缺失了DHC莖環(huán)結(jié)構(gòu)外，都可以折疊成典型的三葉草結(jié)構(gòu)，其中氨基酸受體莖和反密碼子莖、環(huán)結(jié)構(gòu)相對(duì)保守，而DHU莖環(huán)、TψC莖環(huán)和可變環(huán)的變異較大，