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1、南開(kāi)大學(xué)碩士學(xué)位論文基因表達(dá)數(shù)據(jù)中的聚類(lèi)技術(shù)研究姓名:葛建業(yè)申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專(zhuān)業(yè):計(jì)算機(jī)軟件及理論指導(dǎo)教師:黃亞樓2002.5.28AbstractTheInventionofGeneChipsallowsUStostudysimultaneousvariationsofgenesatthegenome—widescaleAtypicalgeneexpressiondatasetconsistsofthousandsoreventen
2、softhousandsofgenes,andafewdozensexperimentsWiththeexplosionofthegeneexpressiondata,howtousetheanalysistechnologiesincomputersciencetoanalysisthedataanddiscoveryusefulandinstructiveknowledgeforbiologicalexperimentisattra
3、ctingmoreandmoreattentionsforthebioinformaticiansKDDisthetechnologyofextractingpreviouslyunknownandpotentiallyusefulinformationfromlargesetsofdataAndithasrepresentedgreatpotentialinanalyzingbiologicaldataDuetotherelative
4、lyfewofknownfunctiongene,modelingisnotagoodmethodSo,clusteranalysisisthepreferredmethodtoanalysisthegeneexpressiondataClusteranalysisistheartoffindinggroupsinagivendatasetsuchthatdbjectsinthesamegrouparesimilartoeachothe
5、rwhileobjectsindifferentgroupsaredissimilarThisthesismainlyinvestigatesometraditionalclusteringalgorithms,suchasK—Means,HierachicalClusteringSelfOrganizingMapsAndtheCURE,whichhassuccessfulapplicationinotherfields,hasalso
6、beenimportedtoanalysisthegeneexpressiondataAllofthealgorithmshavegotthesatisfactoryresultsInthisthesistheapplicationofKDDinanalyzingotherbiologicaldataisalsointroducedMoreover,thebioinformaticsprototypesystemBIMiner,whic
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