大豆油脂合成基因家族的適應(yīng)性進(jìn)化研究.pdf

1、目的：對(duì)大豆和擬南芥、苜蓿、百脈根、番茄、葡萄6個(gè)雙子葉植物的全基因組進(jìn)行比較基因組學(xué)系統(tǒng)發(fā)育分析，確定油脂合成基因家族，大豆油脂合成基因受環(huán)境的選擇情況，發(fā)生基因丟失和基因置換進(jìn)行遺傳重組，探索大豆油脂合成基因家族的適應(yīng)性進(jìn)化規(guī)律。
　　方法：以大豆、擬南芥、苜蓿、百脈根、番茄、葡萄為研究對(duì)象，同源比對(duì)搜索確定油脂合成基因家族成員，構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。利用共線性分析軟件對(duì)物種基因內(nèi)、物種間的同源染色體片段進(jìn)行推斷，結(jié)合同源基因組結(jié)構(gòu)

2、分析，確定多倍化產(chǎn)生的重復(fù)基因片段。對(duì)油脂合成基因進(jìn)行正選擇分析、基因置換分析，結(jié)合多倍化產(chǎn)生的重復(fù)基因的特征，推斷該基因家族適應(yīng)性進(jìn)化與多倍化的關(guān)系。
　　結(jié)果：在大豆、擬南芥、苜蓿、百脈根、番茄、葡萄中篩選4215個(gè)油脂合成基因，其中大豆有1259個(gè)基因。基因組同源結(jié)構(gòu)分析，發(fā)現(xiàn)大豆自身、大豆和其他5個(gè)物種存在大量的DNA重復(fù)片段；大豆1259個(gè)油脂合成基因中有16.68％的基因參與基因轉(zhuǎn)換，80.04%的基因處于全基因組加倍