基于表達(dá)調(diào)控相關(guān)蛋白的結(jié)構(gòu)和功能的研究.pdf

1、生物體內(nèi)許多重要的生物學(xué)過程受到嚴(yán)格的調(diào)控，如細(xì)胞生長調(diào)控，DNA損傷修復(fù)和蛋白質(zhì)的泛素化等。這些生物學(xué)事件都涉及到基因表達(dá)的調(diào)控?；虮磉_(dá)的調(diào)控要求許多蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)復(fù)合物的參與。我們挑選了幾個與基因表達(dá)調(diào)控相關(guān)的蛋白質(zhì)進(jìn)行研究，這幾個蛋白質(zhì)的溶液結(jié)構(gòu)通過核磁共振的方法獲得，并進(jìn)行了生物學(xué)作用的研究。這篇論文共分為5個部分。
　　 1.YEATS domain作為一個新穎而保守的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域家族在從酵母到人的很多生物中發(fā)現(xiàn)。T

2、af14 YEATS domain呈現(xiàn)一個β三明治式的構(gòu)型。結(jié)構(gòu)比較發(fā)現(xiàn)Taf14 YEATS domain和Yaf9 YEATS domain在一些方面存在很大的差異，暗示著YEATS domain家族可能存在著不同的結(jié)構(gòu)亞型。酵母細(xì)胞內(nèi)功能的研究證明在外界的壓力環(huán)境下Taf14 YEATS domain抑制細(xì)胞的生長。此外，Taf14的C末端與轉(zhuǎn)錄因子Sth1相互作用，而Sth1是RSC蛋白質(zhì)復(fù)合物中必不可少的元件。所有這些數(shù)據(jù)暗示

3、著Taf14參與酵母細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)過程，而Taf14YEATS domain對于酵母細(xì)胞的生長起著負(fù)調(diào)控作用。
　　 2.N末端含有一個BRCT domain的Rap1在酵母細(xì)胞內(nèi)發(fā)揮著很多作用，如控制端粒的復(fù)制以及參與糖分解和核糖體蛋白基因的激活。我們解析了Rap1BRCT domain的溶液結(jié)構(gòu)。結(jié)構(gòu)的比較顯示Rap1 BRCT domain擁有和其它BRCT domains相似的構(gòu)型，同時Rap1 BRCT domai

4、n展示了一些不同于其它BRCT domains的結(jié)構(gòu)特征，這些特征揭示了一個新穎的BRCT domain構(gòu)型。
　　 3.Urm1是一個泛素類似蛋白質(zhì)。我們解析了錐體蟲中Urm1的溶液結(jié)構(gòu)，結(jié)構(gòu)的比較顯示TbUrm1擁有泛素類似蛋白家族的結(jié)構(gòu)特征，同時TbUrm1擁有和原核生物泛素類似蛋白MoaD相似的結(jié)構(gòu)，這些證據(jù)支持Urm1作為一個獨一無二的分子化石揭示了泛素類似蛋白家族的進(jìn)化過程。
　　 4.SAMP1和SAMP2

5、是新發(fā)現(xiàn)的古細(xì)菌中的泛素類似蛋白。NMR實驗證明SAMP1和SAMP2在低鹽的環(huán)境下分別擁有兩套構(gòu)象，即有結(jié)構(gòu)的構(gòu)象和無規(guī)構(gòu)象。但是在高鹽的環(huán)境下它們只保留了一套構(gòu)象，即有結(jié)構(gòu)的構(gòu)象。同時研究發(fā)現(xiàn)SAMP1能夠與蛋白酶亞基分子PanA和PanB結(jié)合，這表明SAMP1可能參與古細(xì)菌中泛素調(diào)控的蛋白質(zhì)降解過程。這個課題由我，廖善輝和范楷三個人共同完成，我負(fù)責(zé)蛋白質(zhì)溶液結(jié)構(gòu)的解析和核磁數(shù)據(jù)的分析。
　　 5.在酵母細(xì)胞中，Set9催化