具有遺傳印記效應(yīng)的傳遞-不平衡檢驗(TDT)的功效.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、尋找復(fù)雜性疾病易感性主基因,常用的方法有連鎖分析和關(guān)聯(lián)分析.依賴于標(biāo)記位點與疾病基因之間連鎖不平衡的關(guān)聯(lián)分析能夠解釋復(fù)雜疾病易感性的遺傳基礎(chǔ).Spielman等人1993年提出的傳遞/不平衡檢驗(TDT)具有較高的檢驗功效,并且檢驗的結(jié)果不受群體混合/層化的影響,因此得到廣泛的應(yīng)用.當(dāng)標(biāo)記位點就是疾病位點或者離疾病位點很近時,TDT檢驗比傳統(tǒng)的被感染同胞對方法的功效還要大.但Spielman等人1993年提出的TDT檢驗需要滿足如下條件

2、:(1)一個家庭中父、母親及其小孩在標(biāo)記位點的基因型都是已知的;(2)父、母親在標(biāo)記位點處的基因型中至少有一個是雜合體;(3)此小孩必須是被感染者;(4)父、母親是否患病是未知的,而且是隨機(jī)的;(5)標(biāo)記位點是一個二等位基因位點.因此很多專家學(xué)者對TDT進(jìn)行了推廣. 越來越多的研究顯示一個個體的同源染色體(或相應(yīng)的一對等位基因)因分別來自其父方或母方,而表現(xiàn)出功能上的差異,因此所形成的表現(xiàn)型也有所不同,這種現(xiàn)象稱為遺傳印記.如

3、果在研究中已確定存在連鎖不平衡,我們當(dāng)然希望進(jìn)一步探尋遺傳印記的效應(yīng).因此將遺傳印記引入到定位疾病位點中來是非常有必要的. 但是,以前的方法要么沒有考慮遺傳印記的影響、要么為了簡化而認(rèn)定標(biāo)記位點就是疾病位點,而無論是認(rèn)定這兩方面的哪一方面成立,都會損失信息,從而影響遺傳模式的選擇和檢驗功效的精確性.因此,本文考慮了在具有遺傳印記效應(yīng)的條件下從標(biāo)記位點可以是疾病位點也可以不是疾病位點的角度對經(jīng)典的TDT和部分推廣的TDT的漸近功

4、效進(jìn)行精確地計算:(1)第二章主要討論了在具有遺傳印記效應(yīng)的條件下從標(biāo)記位點可以是疾病位點也可以不是疾病位點的角度對經(jīng)典TDT的漸近功效進(jìn)行精確計算;(2)第三章利用計算機(jī)模擬的方法來驗證本文經(jīng)典TDT理論功效計算公式的精確性;(3)第四章主要討論了在具有遺傳印記效應(yīng)的條件下從標(biāo)記位點可以是疾病位點也可以不是疾病位點的角度對1-TDT的漸近功效進(jìn)行精確計算;(4)第五章主要討論了X伴性遺傳疾病的易感性基因的定位問題;(5)第六章主要討論

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