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文檔簡(jiǎn)介
1、生物入侵機(jī)制的研究是入侵生態(tài)學(xué)研究的重點(diǎn)與熱點(diǎn)。遺傳物質(zhì)是生物表型性狀的重要決定因素之一。探討生物入侵的遺傳學(xué)機(jī)制將可以從根本上闡明入侵植物的成功入侵機(jī)制。加拿大一枝黃花(SolidagocanadensisL)為菊科一枝黃花屬多年生草本植物。原產(chǎn)北美,現(xiàn)大規(guī)模入侵我國(guó)。本研究以加拿大一枝黃花為研究對(duì)象,沿著其擴(kuò)張路徑取樣,采用簡(jiǎn)單重復(fù)序列(SSR)和葉綠體簡(jiǎn)單重復(fù)序列(cpSSR)分子標(biāo)記技術(shù)分析其種群遺傳多樣性,同時(shí)繪制分子系統(tǒng)進(jìn)化
2、譜系樹,預(yù)測(cè)其入侵路線。研究成果可以給入侵植物的管理與防治提供參考。
經(jīng)過優(yōu)化的SSR反應(yīng)體系包括4ng模板DNA,0.2mM4×dNTPs,1×PCR緩沖液,1.5mMMgCl2,1UTaq聚合酶(Promega公司)和0.2μM引物,總體積為20μL。14個(gè)不同地理種群加拿大一枝黃花的SSR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)自動(dòng)化毛細(xì)管電泳系統(tǒng)的分析,處理后結(jié)果顯示加拿大一枝黃花物種水平的核基因遺傳多樣性較高,多態(tài)位點(diǎn)百分率P為100%,Shan
3、non信息指數(shù)I為0.4023,Nei指數(shù)h為0.2429;不同種群加拿大一枝黃花的遺傳多樣性以蕪湖最高(P=100%,I=0.3950,h=0.2418);溫州最低(P=91.84%,I=0.3402,h=0.2053)。AMOVA分析顯示:在總遺傳變異中,種群間存在極小分化(Fst=0.0354),3.54%的遺傳變異存在于種群間,96.46%的遺傳變異存在于種群內(nèi);種群間的基因流較大,為6.8128。加拿大一枝黃花14個(gè)種群間遺傳
4、距離最小值為0.0078(蕪湖與漢口),最大值為0.0510(浦東與武昌)。根據(jù)加拿大一枝黃花14個(gè)種群間遺傳距離,采用UPGMA法對(duì)14個(gè)種群進(jìn)行聚類分析,結(jié)果表明不同地理種源的加拿大一枝黃花總共聚為兩大類,九江和浦東聚成一大類,南通、福州、連云港聚為一亞類,其余種群聚為另一亞類,兩個(gè)亞類再聚成一大類。
優(yōu)化后的cpSSR反應(yīng)體系包括4ng模板DNA,0.3mM4×dNTPs,1×PCR緩沖液,2.5mMMgCl2,1.5U
5、Taq聚合酶,,0.15μM引物,總體積為20μL。14個(gè)不同地理種群加拿大一枝黃花的cpSSR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)4500核酸片段分析系統(tǒng)分析,處理后結(jié)果表明加拿大一枝黃花物種水平的葉綠體基因遺傳多樣性較高,多態(tài)位點(diǎn)百分率P為100%,Shannon信息指數(shù)I為0.5843,Nei指數(shù)h為0.2684;加拿大一枝黃花的遺傳多樣性以福州最高(P=100%,I=0.9126,h=0.5116);杭州最低(P=80%,I=0.3285,h=0.183
6、6)。AMOVA分析顯示:遺傳分化系數(shù)Fst為0.2611,表明加拿大一枝黃花葉綠體基因26.12%的遺傳變異存在于種群間,而73.88%的遺傳變異存在于種群內(nèi);種群間的基因流較大,為1.4303。加拿大一枝黃花種群間葉綠體遺傳距離最小值為武昌和杭州(0.0227);遺傳距離最大值為南京和九江(0.6745),采用算術(shù)平均數(shù)的非加權(quán)成組配對(duì)法(UPGMA)對(duì)14個(gè)種群進(jìn)行遺傳聚類,結(jié)果顯示14個(gè)種群分為三大類群:虹橋和臺(tái)州聚在一起,再和
7、南京和浦東聚為一大類;九江單獨(dú)一類;景德鎮(zhèn)、福州、溫州、南通先聚成一亞類,漢口、連云港聚成一亞類,杭州、武昌和蕪湖聚成一亞類,三個(gè)亞類再聚在一起形成一個(gè)類群。
運(yùn)用Arlequin3.11軟件進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)一共有86個(gè)單倍型。單倍型(96/146/160/175/223)頻率最高,為0.1000,種群?jiǎn)伪缎投鄳B(tài)性:福州(FZ)的最高為0.5202,杭州(HZ)的最低,為0.1867。單倍型數(shù)量以南京(NJ)的最高,達(dá)23,杭州
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