不同水陸生境中喜旱蓮子草表觀遺傳調(diào)控因子動態(tài)表達式樣分析.pdf

1、喜旱蓮子草(Alternanthera philoxeroides(Mart.) Griseb.）是一種入侵植物，種內(nèi)遺傳多樣性很低，主要依靠極強的表型可塑性入侵不同生境。表型可塑性變異與基因選擇性表達密切相關(guān)，而表觀遺傳調(diào)控因子（如:DNA甲基化）參與基因的表達調(diào)控，介導(dǎo)可塑性變異的發(fā)生。為了解喜旱蓮子草適應(yīng)不同水陸生境過程中表觀遺傳調(diào)控因子的作用，我們對同質(zhì)園中栽培的喜旱蓮子草進行不同水陸條件處理，并運用實時熒光定量PCR、亞硫酸氫

2、鈉測序、RNA-Seq高通量測序等方法檢測各類表觀遺傳調(diào)控因子在不同環(huán)境條件下動態(tài)表達的特點，為研究喜旱蓮子草表型可塑性變異發(fā)生的分子基礎(chǔ)提供依據(jù)。研究結(jié)果顯示:
　　(1)16個表觀遺傳調(diào)控相關(guān)基因在不同水陸處理條件下、在不同處理時間點表達水平變化顯著，且多在水淹處理早期被強烈誘導(dǎo)上調(diào)。
　　(2)兩個在不同水陸處理下顯著差異表達基因的啟動子區(qū)中多個胞嘧啶位點甲基化修飾式樣隨不同處理條件以及不同處理時間呈現(xiàn)動態(tài)變化的特點，

3、其中涉及一些保守調(diào)控元件和部分連續(xù)分布的非對稱胞嘧啶位點。
　　(3)對不同水陸處理條件下miRNA表達譜進行分析，發(fā)現(xiàn)118個與不同處理條件相關(guān)且在不同處理時間點差異表達的miRNA，根據(jù)表達式樣將這些miRNA分為12類。
　　本研究結(jié)果初步揭示了喜旱蓮子草響應(yīng)不同水陸生境過程中表觀遺傳調(diào)控因子的動態(tài)表達式樣，證實了表觀遺傳變異與喜旱蓮子草表型可塑性變異的相關(guān)性，為深入研究喜旱蓮子草通過表型可塑性變異廣泛適應(yīng)不同水陸生境