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文檔簡介
1、本研究采用涼山半細(xì)毛羊資源參考家系從1997~2007年間的相關(guān)育種資料(系譜、經(jīng)濟(jì)性狀和分子遺傳標(biāo)記)作為研究對象。面向動物遺傳參數(shù)評估工作的實(shí)踐需求,運(yùn)用數(shù)據(jù)倉庫技術(shù)構(gòu)建一套遺傳參數(shù)估測系統(tǒng),供遺傳育種實(shí)踐作決策支持。 本研究數(shù)據(jù)源有親權(quán)鑒定出的系譜數(shù)據(jù)、表型鑒定數(shù)據(jù)、分子遺傳標(biāo)記和QTL定位。對數(shù)據(jù)源分別實(shí)施校對記錄,刪除缺失記錄,審查系譜等數(shù)據(jù)清洗后,消除所有數(shù)據(jù)噪聲。 面向遺傳參數(shù)估測的實(shí)際需求,定義和劃分了系
2、譜、羊毛性狀和體重性狀等主題域。數(shù)據(jù)粒度層次劃分遵循全局?jǐn)?shù)據(jù)倉庫的需求,遺傳育種細(xì)節(jié)數(shù)據(jù)都劃分為低粒度,表型值部分劃分為中等粒度數(shù)據(jù)或者高等粒度數(shù)據(jù)。在從屬數(shù)據(jù)集市當(dāng)中,部分?jǐn)?shù)據(jù)采用了雙重數(shù)據(jù)粒度劃分層次。 按照確定好的系統(tǒng)邊界,把遺傳育種數(shù)據(jù)進(jìn)行分區(qū)處理和預(yù)處理。相關(guān)數(shù)據(jù)源(結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)、非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù))經(jīng)過抽取、轉(zhuǎn)換和裝載之后,轉(zhuǎn)入關(guān)系數(shù)據(jù)庫中存儲。然后,面向主題域抽取數(shù)據(jù)構(gòu)建從屬數(shù)據(jù)集市。 本研究的數(shù)據(jù)倉庫采用雪花型概
3、念模型設(shè)計。依照動物遺傳參數(shù)評估特點(diǎn)設(shè)計數(shù)據(jù)倉庫的邏輯模型。數(shù)據(jù)倉庫的物理設(shè)計和實(shí)現(xiàn)是運(yùn)用多維數(shù)據(jù)模型理論。采用多維數(shù)據(jù)模型實(shí)現(xiàn)三個從屬數(shù)據(jù)集市,即系譜數(shù)據(jù)集市、羊毛性狀數(shù)據(jù)集市和體重性狀數(shù)據(jù)集市。 從屬數(shù)據(jù)集市是關(guān)系型數(shù)據(jù)倉庫當(dāng)中分離出來的。數(shù)據(jù)集市的每一個維度存儲一個數(shù)量遺傳表型值。對每個數(shù)據(jù)立方體鉆去、切片和旋轉(zhuǎn)等操作來完成遺傳參數(shù)匯總、聚集等工作,為決策實(shí)施服務(wù)。 運(yùn)用數(shù)據(jù)挖掘工具估測涼山半細(xì)毛羊的遺傳參數(shù),預(yù)測
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