BAC肺癌相關(guān)蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析.pdf

1、中山大學(xué)碩士學(xué)位論文BAC肺癌相關(guān)蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析姓名：單志輝申請學(xué)位級別：碩士專業(yè)：信息生物學(xué)指導(dǎo)教師：何淼20070606中山大學(xué)碩士學(xué)位論文白質(zhì)可以聚為5 類，類內(nèi)蛋白質(zhì)聯(lián)系緊密而類與類蛋白質(zhì)之間的相關(guān)系數(shù)很小。取相關(guān)系數(shù)閾值為0 ．7 5 ，在此基礎(chǔ)上構(gòu)建B A C 肺癌相關(guān)蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)，得到一個由三個子網(wǎng)絡(luò)構(gòu)成的網(wǎng)絡(luò)。通過和公共數(shù)據(jù)庫己知信息比對，得到預(yù)測結(jié)果的準(zhǔn)確率6 l ％，假陰性率為3 9 ％。對該網(wǎng)絡(luò)

2、進(jìn)行分析，推斷出一些B A C 肺癌發(fā)生過程中分子間新的調(diào)控關(guān)系，發(fā)現(xiàn)另外一些蛋白質(zhì)，它們和現(xiàn)在己知處于腫瘤中心調(diào)控地位的p 5 3 、r b l 蛋白可能具有同樣的地位和作用。這些調(diào)控關(guān)系對現(xiàn)有的細(xì)胞內(nèi)信號通路是很好的補(bǔ)充，可以為進(jìn)一步的研究提供很好的指導(dǎo)作用。同時，通過對B A C 相關(guān)蛋白質(zhì)和其它非小細(xì)胞肺癌相關(guān)蛋白質(zhì)之間相互作用研究，計算得到蛋白質(zhì)之間的2 1 3 3 個相關(guān)系數(shù)：預(yù)測發(fā)現(xiàn)了一批可能的候選B A C 肺癌相關(guān)蛋白