利用微衛(wèi)星標記分析7個鴨品種的遺傳多樣性.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文利用微衛(wèi)星標記技術(shù),分析了7個鴨品種(金定鴨、連城白鴨、莆田黑鴨、山麻鴨、北京鴨、番鴨和卡基康貝爾鴨)在32個微衛(wèi)星基因座上的遺傳多樣性。根據(jù)等位基因頻率、多態(tài)信息含量、雜合度、有效等位基因數(shù)、遺傳距離和聚類結(jié)果,評估各品種內(nèi)的遺傳變異和品種間的遺傳關(guān)系。結(jié)果表明如下: 1.7個鴨品種在32個微衛(wèi)星基因座中共檢測到371個等位基因,平均每個基因座有11.7188個等位基因。有8個共享等位基因,每個群體都有其特有的等位基因,每

2、個基因座都有其優(yōu)勢等位基因。 2. 32個微衛(wèi)星基因座在7個鴨品種中的平均多態(tài)信息含量為0.5224,其中微衛(wèi)星CAUD070的多態(tài)信息含量最高(0.8159)。各位點的有效等位基因數(shù)在5.1410-6.96116之間,其中卡基康貝爾的平均有效等位基因數(shù)最少(5.1410),北京鴨的平均有效等位基因數(shù)最多(6.9611)。7個群體的基因雜合度變化范圍在0.5115-0.7000之間,雜合度較高。 3. 哈代-溫伯平衡檢驗

3、結(jié)果表明,只有個別位點的在個別品種中處于平衡狀態(tài),如北京鴨中的APH13和CAUD045、金定鴨中的CAUD004和APH13等,其它位點都處于不平衡狀態(tài)。造成不平衡的原因很多,主要原因是非等位基因之間遺傳共適應(yīng)的差異以及位點間的連鎖等,包括采樣誤差,以及群體本身確實處于瀕危狀態(tài),基因位點不平衡。 4. F-統(tǒng)計量分析表明:各微衛(wèi)星基因座FST的變化范圍從基因座CAUD037的0.0381到基因座APL82的0.6277,平均值

4、為0.2888。各基因座的Nm的變化范圍從基因座APL83的0.3598到CAUD070的2.5919,平均值為0.6156。 5. 用Popgene32軟件分別計算7個鴨群體之間的Nei氏標準遺傳距離DS和DA遺傳距離,并用該軟件對其進行聚類,結(jié)果表明,連城白鴨與莆田黑鴨的遺傳距離最近。用DA和DS遺傳距離將7個群體分為3類,其中福建地方特色品種金定鴨、莆田黑鴨、連城自鴨、山麻鴨與卡基康貝爾鴨聚為一類,而北京鴨聚為一類,番鴨也

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