江西特有植物突托蠟梅遺傳多樣性研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、突托蠟梅是江西特有的兼性克隆植物,現(xiàn)已被列為國家重點保護植物。本文從7個天然居群采集突托蠟梅樣本,確定了從突托蠟梅葉片中制備模板DNA的最佳方法,優(yōu)化了PCR循環(huán)參數(shù),建立了ISSR—PCR擴增的最佳反應體系,篩選出擴增多態(tài)性片斷較多且擴增產(chǎn)物穩(wěn)定的引物,通過10條ISSR引物對213個突托蠟梅個體的基因組DNA進行擴增,對突托蠟梅居群的遺傳結構和克隆多樣性進行了研究。 研究結果表明,與CTAB法、SDS法、高鹽低pH值法、SD

2、S-CTAB法、SDS-蛋白酶K法相比,改良的CTAB法提取的DNA OD260/OD280值最好,濃度最高,是提取突托蠟梅基因組DNA的有效方法。ISSR擴增條件為:20μL PCR反應體系中,1×PCR緩沖液,2.0 U Taq DNA聚合酶,1.5 mmol/L MgCl2,0.6μmol/L引物,0.15 mmol/L dNTPs,50 ng模板DNA。最佳擴增反應程序:94℃預變性5 min,94℃變性30 s,50.8℃~5

3、8.3℃退火45 s,72℃延伸2 min,40個循環(huán);最后在72℃延伸5 min。 共對100條ISSR引物進行了篩選,分別篩選出擴增條帶較多、信號強、背景清晰的10條ISSR引物用于7個居群DNA樣本擴增,共擴增出74個位點,其中39個多態(tài)位點,多態(tài)性位點百分比為52.7%。 根據(jù)不同個體的擴增圖構建了0、1矩陣(其中模糊帶和弱帶忽略不計)輸入計算機。對ISSR數(shù)據(jù)處理結果如下:物種水平上,多態(tài)位點百分比P為52.7

4、%,Nei's基因多樣性指數(shù)H為0.1572,Shannon信息指數(shù)I為0.2408,平均克隆尺度Nc為1.1390,基因型比率PD為0.8780,Simple多樣性指數(shù)D為0.998;居群水平上,多態(tài)位點百分比P為21.62%~41.8g%,Nei's基因多樣性指數(shù)H為0.0958~0.1538,Shannon信息指數(shù)I為0.0946~0.2220,平均克隆尺度Nc為1.0000~1.2310,基因型比率PD為0.8620~1.000

5、0,Simple多樣性指數(shù)D為0.9840~1.0000,均勻度指數(shù)E為0.0000~0.7840,居群間的分化系數(shù)(Gst)為0.2489,AMOVA分析表明,26.37%的遺傳變異存在于居群間,表明居群間有一定的遺傳分化。Mantel檢測表明地理距離和Nei's遺傳距離間相關性顯著(r=0.712,p<0.001)。由UPGMA聚類分析得知安遠的4個居群聚為一支,會昌的3個居群聚為一支。 突托蠟梅表現(xiàn)出較低的遺傳多樣性和較高

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