基因微陣列圖像數(shù)據(jù)自動(dòng)化提取.pdf

1、伴隨著人類(lèi)基因組測(cè)序計(jì)劃的發(fā)展和分子生物學(xué)相關(guān)技術(shù)的突破，數(shù)以萬(wàn)計(jì)的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)急待提取與分析。同時(shí)，計(jì)算機(jī)與自動(dòng)化技術(shù)不斷提高，使其在眾多領(lǐng)域的數(shù)據(jù)處理中發(fā)揮著不可替代的作用。面對(duì)如此龐大的數(shù)據(jù)量，如何充分利用多學(xué)科交叉的技術(shù)方法進(jìn)行自動(dòng)化基因數(shù)據(jù)分析是當(dāng)前生命科學(xué)的共同課題。 基因微陣列芯片技術(shù)的出現(xiàn)提供了集成度相當(dāng)高的實(shí)驗(yàn)工具，它可以一次性對(duì)大量基因樣品進(jìn)行檢測(cè)與分析。目前芯片的制備與掃描已基本實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化，但對(duì)于后續(xù)的基

2、因微陣列圖像數(shù)據(jù)提取卻一直難以實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化。這主要是由微陣列圖像數(shù)據(jù)量大，斑點(diǎn)密度高且不規(guī)則，噪聲干擾強(qiáng)且對(duì)比度不明顯等因素引起的。本文的研究目標(biāo)是在保證基因點(diǎn)定位與數(shù)據(jù)提取準(zhǔn)確性的前提下，實(shí)現(xiàn)基因微陣列圖像的整體自動(dòng)化提取。 為實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)，本文首先針對(duì)現(xiàn)有不利于自動(dòng)化的圖像處理流程進(jìn)行優(yōu)化改進(jìn)，先提取基因點(diǎn)邊緣再網(wǎng)格定位，后續(xù)進(jìn)行缺失點(diǎn)補(bǔ)償。然后，提出基于灰度形態(tài)學(xué)的自動(dòng)化圖像增強(qiáng)與自適應(yīng)二值化方法進(jìn)行自動(dòng)化預(yù)處理，并利用基因