白菜高密度遺傳圖譜的構(gòu)建和重要農(nóng)藝性狀的QTL定位.pdf

1、白菜類蔬菜是我國栽培面積最大的蔬菜之一，也是研究基因組多倍化和形態(tài)演化的模式植物。在國際白菜基因組測序數(shù)據(jù)公布前，已有數(shù)十張白菜遺傳圖譜公布，但多基于PCR標(biāo)記，標(biāo)記數(shù)量少而且操作繁瑣。因此，本研究力圖通過基于簡化基因組的RAD-seq技術(shù)，通過下一代高通量測序獲得大量SNP標(biāo)記，構(gòu)建了迄今為止白菜第一張完全由測序標(biāo)記所組成的精度最高的遺傳圖譜。并利用該圖譜對白菜重要農(nóng)藝性狀進(jìn)行了QTL檢測。其主要結(jié)果如下:
　　(1)以高代自交

2、系‘黃小雜’（父本）和‘Bqq094-11’（母本）以及其雜交后得到的120個F2群體為材料，構(gòu)建了一張由711個連鎖區(qū)域(bin)組成的白菜遺傳圖譜，711個連鎖區(qū)域包含3985個SNP標(biāo)記，10個連鎖群物理距離總長255.09Mb，連鎖區(qū)域間平均物理距離是358.77 Kb，遺傳距離總長為1223.44cM，連鎖區(qū)域間平均距離為1.72 cM。其中遺傳距離間距小于1 cM的連鎖區(qū)域共有490個，占連鎖區(qū)域總數(shù)的70％。
　　(

3、2)用WinQTL軟件進(jìn)行CIM分析，檢測到18個農(nóng)藝性狀共72個QTL位點(diǎn)，分布于除A04以外的所有染色體上，遺傳貢獻(xiàn)率在2.42％～80.38％之間。其中株高共檢測到2個QTL、株幅1共檢測到9個QTL、株幅2共檢測到6個QTL、葉片長共檢測到4個QTL、葉片寬共定位到3個QTL、葉柄長共有1個QTL、葉柄長共定位到4個QTL、葉翅共檢測到5個QTL、葉片皺縮共檢測到3個QTL、芯葉顏色共檢測到8個QTL、外葉顏色共檢測到7個QTL

4、、外葉顏色L*芡檢測到4個QTL、外葉顏色a*只檢測到1個QTL、外葉顏色b*檢測到3個QTL、內(nèi)外葉色差共檢測到3個QTL、葉柄顏色共檢測到2個QTL、結(jié)球共檢測到4個QTL、薹長共檢測到3個QTL。
　　(3)使用軟件QTLNetwork version2.1進(jìn)行MCIM分析，共檢測到9個農(nóng)藝性狀共15個QTL位點(diǎn)，同時還檢測到控制控制芯葉顏色和株幅2的兩對上位性QTL。其中與株幅1相關(guān)的QTL共檢測到1個、與葉柄長相關(guān)的QT