玉米自交系遺傳多樣性及產(chǎn)量性狀與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、玉米是世界上重要的谷類作物之一，在食品和工業(yè)中具有廣泛用途。我國(guó)玉米種植分布范圍廣泛但不均勻。研究玉米自交系的遺傳多樣性，確定其親緣關(guān)系遠(yuǎn)近，可為玉米的新品種選育工作提供依據(jù)。同時(shí)高產(chǎn)是玉米育種的首要目標(biāo)，玉米產(chǎn)量性狀的遺傳改良是其遺傳育種研究的熱點(diǎn)之一。本研究以172個(gè)玉米自交系為供試材料，利用分布在玉米10條染色體上的的115對(duì)SSR標(biāo)記對(duì)供試材料的遺傳多樣性進(jìn)行了分析。同時(shí)在分析供試自交系群體結(jié)構(gòu)和連鎖不平衡的基礎(chǔ)上，利用關(guān)聯(lián)分析

2、方法對(duì)供試材料的10個(gè)產(chǎn)量相關(guān)性狀與SSR標(biāo)記進(jìn)行了分析。從而為玉米自交系的進(jìn)一步改良提供依據(jù)。研究結(jié)果如下:
　　 (1)選用115對(duì)均勻分布于玉米10條染色體上的SSR引物，在所有供試材料中共檢測(cè)出644個(gè)等位差異片段，單個(gè)引物擴(kuò)增的差異片段變化范圍為2-15個(gè)，每對(duì)引物平均檢測(cè)出5.6個(gè)。所有標(biāo)記位點(diǎn)的PIC平均值為0.59，單個(gè)引物PIC值的變化范圍為0.18-0.91。所有位點(diǎn)基因多樣性的變化范圍為0.20-0.92，

3、平均值為0.64。其中umc1880的PIC值和基因多樣性值最高，分別0.91和0.92。
　　 (2)基于群體混合模型進(jìn)行群體結(jié)構(gòu)分析172份玉米自交系可分為5個(gè)亞群，運(yùn)用PowerMarker3.0軟件計(jì)算個(gè)亞群間的Nei's遺傳距離。結(jié)果發(fā)現(xiàn)亞群二與亞群五之間的遺傳距離為0.3981，為最大值。由此看出我國(guó)地方玉米品種與起源于熱帶地區(qū)的玉米品種親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。
　　 (3)玉米115個(gè)SSR位點(diǎn)的6555種兩兩組合中

4、，無(wú)論是線性的組合還是非線性的組合，均存在一定的連鎖不平衡現(xiàn)象。其中基于統(tǒng)計(jì)概率(p＜0.01)的不平衡位點(diǎn)占總位點(diǎn)組合數(shù)的64.30％，測(cè)驗(yàn)概率達(dá)到0.001顯著水平的位點(diǎn)有51.80％;而不平衡程度D’＞0.5的組合數(shù)占總位點(diǎn)數(shù)的1.08％。對(duì)于整個(gè)群體，LD在遺傳距離＜400cM普遍存在。
　　 (4)基于群體結(jié)構(gòu)的關(guān)聯(lián)分析檢測(cè)與10個(gè)產(chǎn)量性狀相關(guān)聯(lián)的SSR標(biāo)記達(dá)21個(gè)，總位點(diǎn)數(shù)為42個(gè);其中與穗重相關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有7個(gè)，解釋

5、表型變異率最高的為phi420701(0.37)，與穗長(zhǎng)、禿尖長(zhǎng)、穗粗、軸粗關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)均為3個(gè)，而與穗行數(shù)相關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有4個(gè)，累計(jì)解釋貢獻(xiàn)率43％;與行粒數(shù)和粒重相關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)都為5個(gè);與出籽率相關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)只有一個(gè)，表型解釋變異率為0.08;10個(gè)產(chǎn)量性狀中與百粒重相關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)最多，累計(jì)解釋貢獻(xiàn)率為53％。同一位點(diǎn)與多個(gè)農(nóng)藝性狀相關(guān)聯(lián)的情況普遍存在，位于8號(hào)染色體的標(biāo)記phi420701與7個(gè)產(chǎn)量性狀相關(guān)聯(lián)，表型解釋貢獻(xiàn)率均大于10％，而