玉米苗期耐漬QTL的遺傳定位.pdf_第1頁
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文檔簡(jiǎn)介

1、玉米是全世界最重要的糧食作物之一。澇漬是熱帶、亞熱帶地區(qū)玉米生產(chǎn)的主要逆境脅迫之一,也是我國(guó)南方地區(qū)影響玉米最終產(chǎn)量的主要逆境因子之一。本研究旨在采用關(guān)聯(lián)分析和連鎖定位策略,針對(duì)玉米耐漬性的不同表型,利用96份自交系的關(guān)聯(lián)分析群體進(jìn)行候選基因關(guān)聯(lián)分析,利用144份自交系的關(guān)聯(lián)群體進(jìn)行玉米45868個(gè)SNP的全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)。同時(shí),還利用BC2F2∶3分離群體對(duì)顯著關(guān)聯(lián)位點(diǎn)進(jìn)行連鎖作圖驗(yàn)證。取得了以下主要結(jié)果:
  

2、1、利用EcoTILLING技術(shù)在96份自交系群體中,開展了候選基因zmbRLZ和Hemoglobin內(nèi)SNP與耐漬性的關(guān)聯(lián)分析。研究發(fā)現(xiàn):候選基因zmbRLZ區(qū)段有33個(gè)SNP,多數(shù)位點(diǎn)的最小等位基因頻率(MAF<5%)。測(cè)序鑒定10個(gè)SNP位點(diǎn)MAF大于5%,LD分析顯示,部分位點(diǎn)之間有顯著相關(guān),其中5個(gè)SNP可以代表大部分的遺傳多樣性信息。關(guān)聯(lián)分析的結(jié)果顯示,有1個(gè)位點(diǎn)與耐漬響應(yīng)性狀的關(guān)聯(lián)達(dá)到顯著(P<0.005)。另有2個(gè)位點(diǎn)與

3、耐漬響應(yīng)性狀的關(guān)聯(lián)達(dá)到顯著(P<0.05)。
   2、利用全基因組關(guān)聯(lián)分析在144份自交系群體里鑒定了2個(gè)SNP位點(diǎn)(PUT-163a-93013517-4810、bin9.07,PZE-105105668、bin5.04)分別與正常水分下的RFW(根鮮重)和漬水處理下的SFW(莖鮮重)顯著關(guān)聯(lián)(p<2.18×10-6)。在825624次(45868位點(diǎn)×9性狀×2環(huán)境)可能關(guān)聯(lián)中,檢測(cè)到27次SNP與性狀的顯著關(guān)聯(lián)(p<2.

4、18×10-5),涉及到5個(gè)SNP位點(diǎn);檢測(cè)到141次SNP與性狀的顯著關(guān)聯(lián)(p<2.18×10-4),涉及53個(gè)SNP位點(diǎn)。
   3、對(duì)性狀的耐漬系數(shù)、死葉指數(shù)等次級(jí)綜合性狀的GWAS分析結(jié)果顯示,3個(gè)位于第一染色體上的SNP位點(diǎn)與多個(gè)性狀的耐漬系數(shù)顯著關(guān)聯(lián)(p<2.18×10-5);但死葉指數(shù)沒有檢測(cè)到關(guān)聯(lián)位點(diǎn)。以10kb作為一個(gè)單倍型分析的窗口進(jìn)行基因型分析,在兩種模型下同時(shí)檢測(cè)到N4590位點(diǎn)(bin6.05)與死葉指

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