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文檔簡介
1、高等植物脂質(zhì)轉(zhuǎn)運蛋白(lipid-transfer proteins,LTPs)是一類小分子量堿性單體蛋白質(zhì)。LTP能夠在生物膜之問轉(zhuǎn)運磷脂,參與細胞內(nèi)生物膜的形成。LTP還參與形成角質(zhì)與臘質(zhì),因此其與植物的抗病性和抗逆性相關(guān)。目前已報道多種植物LTP基因序列,且已純化出LTP蛋白。本研究從Au、Am、D、Eb、Ee、F、H、I、M、N、Ns、P、O、Q、R、St、Ss、Sl、Ssh、Ta、CD、AG和ABD等不同基因組組成的31份小麥
2、族材料中克隆LTP基因,并進行系統(tǒng)進化分析,獲得以下結(jié)果:
1、獲得LTP基因86個。其中大麥LTP基因編碼區(qū)長為354bp,其他材料基因組克隆獲得的LTP基因編碼區(qū)長度均為348bp。核酸序列多重比對結(jié)果表明相同材料克隆獲得的不同LTP基因序列問相似件為89.94%~100%,從D、Au、Am、F、I、H和ABD基因組克隆的序列相似性分別為100%。LTP基因與NCBI已報道序列一致性為88%~100%。相比于非編碼區(qū),
3、編碼區(qū)核酸序列比較保守,序列相似性為92.56%。變異類型主要發(fā)生在30~130bp區(qū)間堿基T與C間,共38次。大麥LTP基因序列在3′端終止密碼子前有一個ATTTAC插入突變。
2、大麥LTP基因推導的氨基酸序列包含117個氨基酸殘基,其他材料基因組克隆LTP基因推導的氨基酸序列包含115個氨基酸殘基,分子量介于11807Da~12281Da間,蛋白一級結(jié)構(gòu)相似性為86.70%。N端都含有長26個氨基酸殘基的信號肽。根據(jù)
4、半胱氨酸殘基(C)的數(shù)目、位置和二硫鍵形成方式可將LTP基因分為三類:從Au、Am、AG和F基因組克隆獲得的LTP歸為第一類,半胱氨酸C29與C74、C39與C53、C54與C98和C76與C113間分別形成二硫鍵;從CD、D、Eb、F、H、I、M、N、Ns、P、Q、R、St、Ss、Sl、Ssh、O、Ta和ABD基因組克降獲得的LTP歸為第二類,半胱氨酸C29與C76、C39與C53、C54與C98和C74與C113間分別形成二硫鍵;從
5、O基因組的亨氏草屬(Henrardia persica)克隆獲得的LTP18-P和LTP19-P第75位氨基酸為賴氨酸(K),是一個堿性氨基酸,以上所有LTP都含有8個位置保守的半胱氨酸,分別位于29、39、53、54、74、76、98和113位。從O基因組克隆獲得的LTP17-P含有10個半胱氨酸分別位于29、39、53、54、58、76、86、94、99和113位,歸為第三類。
3、推導的氨基酸序列同源聚類分析表明:來
6、自D、N、Ssh、ABD、Au、P、Am、AG、S1、M、CD、Ss、St、F和Ta,Eb、Ss、St、Ee、O、F和R,I和H.M、P、Ssh、Ns、Q、H和Ta基因組LTP分別聚為一類,O基因組的LTP17-P單獨聚為一類。系統(tǒng)進化聚類分析表明:Eb、Ee和Ns,ABD、D、N、Ssh、Sl、AG、Am、Au、F、M、CD、Ss、Ta和R,H、I、P、Q和St基因組分別聚為一類;O基因組單獨聚為一類。聚為同一類的基因組相互問可能存在
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