福建沿岸海域軟骨魚類資源及其系統(tǒng)進(jìn)化研究.pdf

1、本文以2006年至2007年福建沿岸海域游泳動物調(diào)查4個航次的底拖網(wǎng)漁獲軟骨魚類為研究對象,對該海域的軟骨魚類資源現(xiàn)狀進(jìn)行分析;對部分軟骨魚類的線粒體COI基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測序,對所得線粒體COI基因序列進(jìn)行分析,并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹;同時采用AFLP技術(shù)對福建沿岸海域軟骨魚類進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化的初步研究。主要結(jié)果如下：
　　 ⑴分析了2006年至2007年福建沿岸海域游泳動物調(diào)查共4個航次的底拖網(wǎng)漁獲物中軟骨魚類的種類組成、數(shù)量、資

2、源密度、棲息密度及其季節(jié)變化。結(jié)果表明:4個航次共捕獲軟骨魚類17種,隸屬于5目9科9屬,其中鲼形目最多,有9種。春、夏、秋、冬4個航次分別捕獲軟骨魚類8、13、15、9種;條紋斑竹鯊、何氏鰩、光缸、奈氏缸、日本單鰭電鰩和小眼缸在4個航次均有捕獲。4個航次捕獲的軟骨魚類占該海域魚類總漁獲量的15.99％;平均資源密度和平均棲息密度分別為99.38 kg/km2和295.81 ind/km2,平均資源密度以夏季最高,為170.28 kg/

3、km2,平均棲息密度則以秋季最高,為504.73ind/km2。4個海域中,閩東近岸海域的平均資源密度最大,為200.77 kg/km2;春季和冬季,廈門近岸海域的平均資源密度最大,夏季和秋季則以閩東近岸海域的平均資源密度最大。17種軟骨魚類中,出現(xiàn)頻率最高的是尖嘴魟,為27.08％;資源密度最大的是奈氏魟,為21.52kg/km2;條紋斑竹鯊的棲息密度最大,為86.25 ind/km2。條紋斑竹鯊的優(yōu)勢度指數(shù)最高,為756.52。條紋

4、斑竹鯊和尖嘴魟是福建沿岸海域軟骨魚類的優(yōu)勢種。
　　 ⑵通過PCR擴(kuò)增獲得福建沿岸海域15種軟骨魚類共74個個體的COI基因618 bp長度的同源序列,共有35種單倍型。35種單倍型的618 bp同源序列中,有267個可變位點(diǎn),包括253個簡約信息位點(diǎn)和14個單突變子,無插入和缺失位點(diǎn)。T、C、A、G各堿基的平均含量分別為31.8％、26.2％、25.4％和16.6％。所有種類的G含量都較低(14.7％～18.3％)。A+T含量

5、平均值57.2％,高于G+C含量(42.8％)。第1、2、3密碼子位點(diǎn)的A+T含量平均值分別為45.5％、57.2％和68.7％。所有位點(diǎn)的平均轉(zhuǎn)換/顛換比值為1.4,其中第1密碼子位點(diǎn)的轉(zhuǎn)換/顛換比值最高(5.0),而第3密碼子位點(diǎn)的轉(zhuǎn)換值(52)和顛換值(43)均顯著高于第1、第2密碼子位點(diǎn)。根據(jù)Kimura雙參數(shù)模型計(jì)算15種軟骨魚類74個個體的遺傳距離,魟鰩類個體間平均遺傳距離為0.1626,鯊類個體間平均遺傳距離為0.0851

6、,鯊類和缸鰩類間的遺傳距離為0.2664;74個個體間的平均遺傳距離為0.1936。對35種單倍型序列和鬼形兔銀鮫(Hydrolagus lemures)的同源序列進(jìn)行聚類分析,得到NJ系統(tǒng)樹。系統(tǒng)樹顯示,同種個體聚類成一支,同屬的所有種類也都聚在一起,聚類結(jié)果與傳統(tǒng)分類體系吻合。結(jié)果表明,線粒體COI基因序列可用于所研究的幾種軟骨魚類的種類鑒定和系統(tǒng)分類研究。
　　 ⑶利用AFLP技術(shù)對福建沿岸海域14種軟骨魚類進(jìn)行了分類的初

7、步研究。利用6對選擇性擴(kuò)增引物(E-AAG/M-CTA,E-AGG/M-CCG,E-ACG/M-CCG,E-AGG/M-CAG,E-ACC/M-CTA,E-ACC/M-CCG),在71個個體中共擴(kuò)增出241個AFLP可檢測位點(diǎn),其中236個為多態(tài)位點(diǎn),多態(tài)位點(diǎn)比率為96.7％。每對引物擴(kuò)增出的可檢測位點(diǎn)數(shù)為39～44個,平均40.2個。Popgene統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示種間遺傳距離為0.1308～0.5720。其中奈氏魟(Dasyatis na