graphpad-prism-6.0的基礎(chǔ)應(yīng)用

1、張妮妮2016-5-31 19:00圖書館二樓多媒體培訓(xùn)教室,醫(yī)學(xué)繪圖與分析軟件,GraphPad Prism 6.05基礎(chǔ)應(yīng)用,GraphPad Prism是一款集數(shù)據(jù)分析和作圖為一體的數(shù)據(jù)處理軟件，尤其適合生物醫(yī)學(xué)類，可以直接輸入原始數(shù)據(jù)獲得高質(zhì)量的科學(xué)圖表。它在統(tǒng)計分析上劣于SPSS 等統(tǒng)計軟件。不需要輸入程序語言，只需輸入原始數(shù)據(jù)。容易操作，繪圖美觀。可與ppt，word相鏈接。Graphpad與origin的比

2、較,簡介,大綱,統(tǒng)計圖基本知識GraphPad Prism6繪圖界面案例分析統(tǒng)計圖的排版與導(dǎo)出,統(tǒng)計圖的基本知識,統(tǒng)計圖基本要素常見統(tǒng)計方法的圖形表達,統(tǒng)計圖的基本要素,1.標(biāo)題：一般位于圖的正下方，簡明扼要說明主要內(nèi)容2.X軸：有兩種 分類軸：表示兩種不同的類別 數(shù)據(jù)軸：表示一個數(shù)值概念3.Y軸：一般為數(shù)值軸4.圖形區(qū)：二維平面內(nèi)點、線、條表達數(shù)據(jù),From www.drheart.cn,常見統(tǒng)計方法的圖形表達

3、,1.獨立樣本t檢驗2.配對t檢驗,3.完全隨機設(shè)計資料的方差分析4.析因設(shè)計資料的方差分析5.重復(fù)測量資料的方差分析,6.兩組獨立樣本的秩和檢驗7.多組獨立樣本的秩和檢驗,GraphPad Prism6繪圖界面,一、歡迎界面二、軟件主界面三、目錄樹四、快捷菜單欄五、圖像模塊詳解六、坐標(biāo)軸調(diào)整七、圖形設(shè)定界面,歡迎界面,歡迎界面要對統(tǒng)計方法進行選擇特定的統(tǒng)計方法→對應(yīng)的數(shù)據(jù)錄入格式和圖

4、像類型,設(shè)定統(tǒng)計類別、圖像類型和數(shù)據(jù)輸入格式后，進入軟件主界面,1.統(tǒng)計類型,2.數(shù)據(jù)輸入格式,3.示例數(shù)據(jù)，也是統(tǒng)計方法的提示,,,二、軟件主界面,,,,,三、目錄樹,數(shù)據(jù)集；點擊，進入數(shù)據(jù)錄入窗口，在歡迎界面選擇不同的統(tǒng)計類型，數(shù)據(jù)集的表格會有所不同,圖形；當(dāng)完成數(shù)據(jù)錄入，點擊該圖標(biāo)，則自動生成圖像,布局,文檔操作模塊，如打開、新建、保存、前進、后退、復(fù)制和粘貼。該模塊與office軟件操作一致。,分析模塊。,圖形模塊，將對圖形類

5、型、坐標(biāo)軸和圖形本身進行分析，將重點解釋。,文字修飾模塊，可以繪制線條、添加文字，并對文字進行調(diào)整。,圖形輸出模塊，包括圖形導(dǎo)出，打印和一鍵輸入至word，ppt中。,四、快捷菜單欄,,,五、圖形模塊詳解,相當(dāng)于統(tǒng)計方法和圖形類型選擇項，可以對統(tǒng)計方法重新選擇，但一般只對圖形類型進行選擇。,對坐標(biāo)軸進行具體設(shè)定，包括原點、X軸和Y軸。,對圖形進行具體調(diào)整。,圖表的配色方案，默認(rèn)為黑白圖表。,六、坐標(biāo)軸調(diào)整,1.坐標(biāo)框與原點,（1）Ori

6、gin原點的設(shè)定,（2）繪圖區(qū)的形狀、大小和位置進行設(shè)定，一般不需要設(shè)定。,繪圖區(qū)的顏色,背景顏色,（3）坐標(biāo)軸的顏色,（4）對圖形框和網(wǎng)格線進行設(shè)定,X axis(X軸),Gaps and Direction：只有XY圖形，才能進行設(shè)定,X軸是否分段和方向,一般為線性，濃度選擇logo刻度,對刻度圖示進行調(diào)整,添加輔助線，還可對兩條輔助線內(nèi)區(qū)域進行填色,3. Left Y axis(左Y軸),4. Right Y axis(右Y

7、軸),軟件默認(rèn)無右Y軸,與X軸設(shè)定方法類似,Note：添加右Y后，所有圖像仍跟隨左Y,如果某些數(shù)據(jù)需要按照右Y,需要在Format Graph對話框中實現(xiàn)。,5. Titles & Fonts(標(biāo)題和字體),七、圖像設(shè)定界面,Data Set,Style:樣式，不同的圖形,Additional options,可以選擇數(shù)據(jù)集是否依據(jù)左Y還是右Y進行顯示，如果出現(xiàn)第二Y軸，此處應(yīng)進行設(shè)定。,,,案例分析,配對t檢驗,適用情況（

8、4種）：配對的兩組受試對象分別接受兩種處理同一受試對象處理前后的比較同一受試對象兩個不同部位的比較同一樣品用兩種方法（儀器等）檢索結(jié)果的比較,*,實例1,抽取15名某大學(xué)的學(xué)生進行了為期3個月的發(fā)展腿部爆發(fā)力的訓(xùn)練，運用實驗的方法在訓(xùn)練前后分別測試了每一人的立定跳遠(yuǎn)成績。統(tǒng)計15名學(xué)生訓(xùn)練前后的數(shù)據(jù)。,該實例的圖像表達,應(yīng)該采用單一研究對象前后值連線的方式表達與獨立t檢驗區(qū)別開來若數(shù)據(jù)太多，則不適合用圖形表達,圖形繪制,S

9、tep 1：圖形類型選擇1.Column → 適合t檢驗、ANOVA、秩和檢驗…2.新建數(shù)據(jù)集,進入主界面,圖形繪制,圖形繪制,Step 2：數(shù)據(jù)錄入1.在data窗口，錄入數(shù)據(jù)2.點擊左側(cè)目錄樹中的Graphs。3.選擇圖形。4.圖形生成。,初始圖形,Step 3：坐標(biāo)軸和圖形調(diào)整1. 點擊快捷菜單欄change模塊中 彈出坐標(biāo)軸對話框2.選擇左Y軸，對Y軸進行調(diào)整,,,,

10、,,,修改前后對比,3.選擇標(biāo)題和字體，對其進行調(diào)整,,,Note：不論中文還是英文，一旦亂碼，就要對“字體”進行調(diào)整。,4.選擇X軸，對X軸進行調(diào)整,5.對圖形的Symbols（符號）進行修改,,,,圖形繪制,Step 4：文字修飾1. 不需要的文字點擊刪除即可2.可通過Write插入文字3.在Text菜單欄對字體進行調(diào)整,分析數(shù)據(jù),圖形繪制,最后圖形如下：,*,成組t檢驗,實例2,該實例的圖形表達,1.散點圖（圖1）：清晰描述

11、各點數(shù)據(jù)，易發(fā)現(xiàn)離群點，橫線為均值，適合數(shù)據(jù)較少時。2.誤差圖（圖2）：箱頂為均數(shù)，觸須線表示SD，也可表示SE,適合數(shù)據(jù)較多時。3.誤差圖（圖3）：點表示均數(shù)，直線表示兩側(cè)SD。,圖形繪制,Step 1：圖形類型選擇1.Column → 適合t檢驗、ANOVA、秩和檢驗…2.新建數(shù)據(jù)集,圖形繪制,Step 2：數(shù)據(jù)錄入1.在data窗口，錄入數(shù)據(jù)2.點擊左側(cè)目錄樹中的Graphs。3.選擇圖形。4.圖形生成。,圖形繪制

12、,圖形繪制,添加P值的bar,,圖形繪制,最后圖形如下：,實例3,為了探討雌激素預(yù)防骨質(zhì)疏松癥的作用，研究者將30只10月齡SD雌性大鼠隨機等分到假手術(shù)組（組1）、卵巢切除組（組2）和卵巢切除后補充17β-雌二醇組（組3），12周后處死大鼠，取其股骨，測量股骨重量。,定量資料----統(tǒng)計方法選擇,定量資料正態(tài)：均值的比較 兩組：t檢驗 多組：方差分析非正態(tài)：中位數(shù)的比較 兩組：非參（Mean-Whitney

13、 U檢驗） 多組：非參（Cruskal-Wallis H檢驗）,圖形繪制,Step 1：圖形類型選擇1.Column → 適合t檢驗、ANOVA、秩和檢驗…2.新建數(shù)據(jù)集3.選擇圖形類型 ---垂直柱狀圖,圖形繪制,圖形繪制,,,最終的圖形,實例4,某醫(yī)生將病人隨機分為兩組，分別以新療法和傳統(tǒng)療法治療。比較兩種療法的退熱時間有無差別。,兩組獨立樣本資料比較的秩和檢驗,兩組獨立樣本資料比較的檢

14、驗方法 --- 滿足正態(tài)分布和方差齊性 -----可用t檢驗或完全隨機設(shè)計的方差分析--- 不滿足正態(tài)分布或方差齊性 -----可采用Wilcoxn秩和檢驗（rank sum test） -----推斷兩獨立樣本分別代表總體分布位置是否不同。,二、圖形繪制,Step 1：圖形類型選擇1.Column → 適合t檢驗、A

15、NOVA、秩和檢驗…,圖形繪制,Step 2：數(shù)據(jù)錄入1.在data窗口，錄入數(shù)據(jù)2.點擊左側(cè)目錄樹中的Graphs—Data4，自動生成圖形。3. 選擇Median，用橫線表示中位數(shù)。,圖形區(qū)：均值與中位數(shù)的修改,,最終的圖形,實例5—折線圖,研究進食量與體重增加的關(guān)系,二、圖形繪制,Step 1：圖形類型選擇1.XY → 線性回歸，非線性回歸，相關(guān)分析2.新建數(shù)據(jù)集3.選擇圖形類型 ---散點圖,

16、,,兩變量的關(guān)聯(lián)性分析,二、圖形繪制,圖形繪制---添加擬合直線,,圖形繪制---坐標(biāo)軸和圖形調(diào)整,,,圖形繪制---坐標(biāo)軸和圖形調(diào)整,,,統(tǒng)計分析--自動生成,,,Y=0.06479X＋1.997,R2＝0.899,,最后的圖形,統(tǒng)計圖的排版與導(dǎo)出,統(tǒng)計圖的排版與導(dǎo)出,,統(tǒng)計圖的排版與導(dǎo)出,,,,統(tǒng)計圖的排版與導(dǎo)出--投稿圖片,,,,,,導(dǎo)出后的圖片,統(tǒng)計圖的排版與導(dǎo)出—ppt、word,,雙擊圖片，返回到GraphPad程序,致謝,