醫(yī)學(xué)文獻檢索技巧

1、2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,1,醫(yī)學(xué)文獻數(shù)據(jù)庫MEDLINE,2010.4,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,2,一、數(shù)據(jù)庫概況,（一）編制單位：美國國立醫(yī)學(xué)圖書館(NLM) 。（二）收錄學(xué)科內(nèi)容：主要收錄生物醫(yī)學(xué)、衛(wèi)生保健以及生命科學(xué)相關(guān)文獻。包括行為科學(xué)、健康專業(yè)所需要的化學(xué)、生物工藝學(xué)、基礎(chǔ)研究；臨床、護理、公共衛(wèi)生、衛(wèi)生政策發(fā)展或相關(guān)教育活動的內(nèi)容。2000年起增加了生物、環(huán)境科學(xué)

2、、海洋生物、植物和動物學(xué)、生物物理學(xué)和生物化學(xué)等生命科學(xué)方面的研究內(nèi)容。,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,3,（三）文獻來源：70多個國家和地區(qū)；近5000種生物醫(yī)學(xué)期刊美國衛(wèi)生研究院文獻選擇技術(shù)評估委員會Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)評估挑選NLM和各專業(yè)協(xié)會的數(shù)據(jù)協(xié)作采集專家推薦。近年數(shù)據(jù)涉及37種語種，回溯至1949年的數(shù)據(jù)涉及

3、60種語種。47%為美國本土出版文獻，90%為英文文獻，79%的文獻有文摘。（以上由2009年7月數(shù)據(jù)庫提供）,,一、數(shù)據(jù)庫概況,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,4,二、 MEDLINE的檢索平臺,廣域網(wǎng)免費平臺：NCBI-PubMed（含非MEDLINE數(shù)據(jù)）,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,5,校園網(wǎng)內(nèi)可用平臺（IP控制）：Ovid SPWeb of KnowledgeEBSCOOC

4、LC First Search,二、 MEDLINE的檢索平臺,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,6,校園網(wǎng)內(nèi)可用平臺的Medline,,,,,,,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,7,PubMed數(shù)據(jù)庫檢索,http://www.pubmed.gov,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,8,（一）開發(fā)機構(gòu)：NCBI（美國國立生物技術(shù)信息中心）http://www.ncbi.nlm

5、.nih.gov NCBI的任務(wù):利用計算機信息處理技術(shù)，建立分子生物學(xué)、生物化學(xué)、遺傳學(xué)知識的自動存儲和分析系統(tǒng)，并開展相關(guān)先進方法的研究。促進生物技術(shù)研究者和醫(yī)藥治療人員對數(shù)據(jù)庫和軟件的使用。 促進全世界范圍內(nèi)生物技術(shù)信息收集的合作。,一、 PubMed簡介,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,9,NCBI網(wǎng)站,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,10,NCBI提供的數(shù)據(jù)庫,檢索大分子生物學(xué)數(shù)據(jù)

6、獲取GenBank, EMBL等數(shù)據(jù)庫的核酸序列；獲取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白質(zhì)序列，從核酸序列翻譯到蛋白質(zhì)的序列；獲取基因和染色體圖譜；蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)及大分子模式（MMDB）等其他生物信息數(shù)據(jù)庫檢索。PubMed等文獻數(shù)據(jù)。,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,11,廣域網(wǎng)免費提供題錄和文摘提供與原文的網(wǎng)址鏈接(部分免費獲取） 提供檢索詞智能轉(zhuǎn)換匹配界面簡潔，操作簡便,（二）

7、PubMed的特點,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,12,MEDLINE Indexed1966 to prensent的MEDLINE已標(biāo)引數(shù)據(jù)，有MeSH字段和摘要，每條記錄標(biāo)有：[PubMed-indexed for MEDLINE] OldMEDLINE1949-1965年間的MEDLINE數(shù)據(jù)，無MeSH字段和摘要，每條記錄標(biāo)有：[PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966],（

8、三） PubMed收錄數(shù)據(jù),2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,13,MEDLINE Inprocess最新的MEDLINE處理中數(shù)據(jù)，未標(biāo)引，無MeSH字段。每條記錄標(biāo)有：[PubMed-in process]。Publisher-Supplied出版商提供的電子文獻題錄，每條記錄標(biāo)有: [PubMed-as supplied by publisher]，分為兩類： MEDLINE 收錄，逐步轉(zhuǎn)為

9、In Process, Indexed狀態(tài)。 Not MEDLINE：PubMed 收錄，MEDLINE不收錄，一直標(biāo)注[PubMed-as supplied by publisher]或[PubMed],（三） PubMed收錄數(shù)據(jù),PubMed記錄狀態(tài)子集,,PubMed記錄狀態(tài)子集,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,16,二、PubMed的檢索功能,基本檢索輸入框,,檢索限制,高級檢索,檢索指南,檢索工具：特

10、定文獻檢索臨床查詢專題查詢,其他資源：規(guī)范詞數(shù)據(jù)庫期刊數(shù)據(jù)庫臨床試驗等,個人空間,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,17,檢索欄可輸入一個或多個檢索詞（系統(tǒng)默認(rèn)空格為AND檢索）如：aloe psoriasis（蘆薈治療牛皮癬的文獻）,三、PubMed 基本檢索規(guī)則,多個檢索詞輸入,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,18,檢索欄可輸入布爾邏輯運算式：（運算符須大寫）如：asthma AN

11、D (therapy OR treatment)字段限定符：[ ]，空格按詞組匹配如：aloe AND psoriasis[ti]如：Stem cell transplantation[ti],三、PubMed 基本檢索規(guī)則,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,19,邏輯運算式輸入：aloe AND psoriasis[ti]牛皮癬出現(xiàn)在篇名中,,,,,,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室

12、,20,字段限定 stem cell transplantation[ti],,,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,21,著者檢索：姓全稱在前，名首字母在后，[au]。如: smith ab[au] “paulsen e”[au],三、PubMed 基本檢索規(guī)則,邏輯運算式輸入：Paulsen E撰寫的蘆薈治療牛皮癬的文章,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,22,刊名檢索：全稱或MED

13、LINE認(rèn)可的標(biāo)準(zhǔn)縮寫, [so]如：Journal of investigative dermatology[so] J invest dermatol[so],三、PubMed 基本檢索規(guī)則,,輸入刊名檢索發(fā)表在該刊上的文獻（限定出處字段SO）,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,23,PubMed記錄字段說明,文摘第一著者單位地址出版商提供文獻識別號著者群版權(quán)說明參考評論文獻合著者文獻參考評論

14、定稿版校樣版輸入日期輸入完成日期電子出版日期,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,24,,電子出版日期文獻出版日期數(shù)據(jù)加入PubMed日期文獻勘誤參考文獻勘誤全部著者姓名全部調(diào)研者姓名作為文章主題的著者全稱文獻相關(guān)注釋基金編號基因符號期編號資助調(diào)研者資助調(diào)研單位國際標(biāo)準(zhǔn)期刊號美國立醫(yī)學(xué)圖書館識別號期刊全稱,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,25,,,最后修訂日期規(guī)

15、范詞表詞規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘版權(quán)擁有者題錄提供機構(gòu)的識別號病史相關(guān)與原始記錄其他關(guān)鍵詞提供其他關(guān)鍵詞的機構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機構(gòu)文章總頁數(shù)出版商提供數(shù)據(jù)時間期刊出版國數(shù)據(jù)庫文獻編號,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,26,作為主題詞的個人姓名出版狀態(tài)文獻類型出版模式（紙張或電子） 參考文獻數(shù)已撤回的文獻酶或化學(xué)物質(zhì)代碼正在撤消中的文章初版文獻修訂和再版的文章子專題文檔太空

16、署提供的數(shù)據(jù)二次文獻數(shù)據(jù)庫以及文章討論的分子序列訪問號原文來源引用了病例的文獻內(nèi)部處理代碼標(biāo)準(zhǔn)期刊縮寫文獻標(biāo)題翻譯標(biāo)題更新文獻文獻正在更新期刊卷號,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,27,截詞檢索：treat*可檢出：treat, treated, treatment...強迫短語檢索：“ ”，不進行自動轉(zhuǎn)換匹配和擴展檢索如：“acute low back pain” “ang

17、1”（血管緊張素1縮寫）檢出1085篇比較：ang 1 檢出9956篇，誤檢多，其中有：,三、PubMed 基本檢索規(guī)則,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,28,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,29,自動轉(zhuǎn)換匹配檢索詞： 對常用醫(yī)學(xué)名詞自動在規(guī)范詞索引（主題詞、副主題詞、物質(zhì)名稱）中轉(zhuǎn)換、并默認(rèn)在所有記錄字段中匹配。如：renal failure kidney fail

18、ure[MESH] OR (kidney[All Fields] AND failure[All Fields]) OR (renal[All Fields] AND failure[All Fields])…,三、PubMed 基本檢索規(guī)則,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,30,,結(jié)果顯示頁右側(cè)Details顯示系統(tǒng)自動匹配轉(zhuǎn)換的檢索詞,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,31,自動轉(zhuǎn)換匹配檢索詞：

19、如：hypertension therapyDetails:("hypertension"[MeSH Terms] OR "hypertension"[All Fields]) AND ("therapy"[Subheading] OR "therapy"[All Fields] OR "therapeutics"[MeS

20、H Terms] OR "therapeutics"[All Fields]),三、PubMed 基本檢索規(guī)則,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,32,四、PubMed 檢索限制：Limits,PubMed主頁、結(jié)果顯示頁、高級檢索界面均有Limits鏈接。,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,33,全文、免費全文、摘要限定,出版日期限定,文獻類型限定,語種限定,研究對象人/動物限

21、定,性別限定,年齡限定,各種專題的子數(shù)據(jù)庫限定,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,34,五、PubMed 高級檢索功能,一個網(wǎng)頁中集多種功能于一體,基本檢索,檢索細(xì)節(jié),檢索式編制,檢索歷史,其他檢索資源,結(jié)果預(yù)覽,檢索框中只能輸入檢索詞，不能輸入檢索式。多個字段檢索要分多次輸入。,檢索歷史中顯示歷次檢索式、時間和檢出篇數(shù)?？山M配檢索式，如：#1 OR #2，#1 AND child點擊編號可對檢索式進行刪除、保存

22、等操作。,在History中快速顯示檢索式與檢出篇數(shù),顯示轉(zhuǎn)換規(guī)范詞及運算的詳細(xì)過程，可確定規(guī)范詞,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,35,六、PubMed其他資源,1. Mesh Database（規(guī)范化醫(yī)學(xué)主題詞表）功能：確定規(guī)范化主題詞查看主題詞詞義注釋、樹狀結(jié)構(gòu)表選擇副主題詞、擴展下位主題詞、指定主要主題詞進入途徑：MeSH Database鏈接：PubMed主頁，Advanced Search界面

23、MeSH選項：基本檢索框前Search下拉菜單的,文章A著者用詞：腎衰竭renal failure 規(guī)范主題詞MeSH：腎功能衰竭kidney failure,文章B著者用詞：腎功能衰竭Kidney failure規(guī)范主題詞MeSH：腎功能衰竭kidney failure,,,詞表中：腎衰竭 見 腎功能衰竭renal failure see kidney failure,（2）醫(yī)學(xué)主題詞表（MeSH）,20

24、24/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,37,進入 MeSH,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,38,MeSH詞檢索,例1：2006-10年關(guān)于舌根癌治療的文獻。課題分析：舌根癌的不同表達形式（OR）：tongue base cancer、cancer/carcinoma/tumor of tongue base、cancer of the base of tongue…治療的不同表達形式（

25、OR） ：therapy/treat/treatment, surgery, radiotherapy…兩個概念之間：舌根癌 AND 治療,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,39,,,輸入自由詞，查找規(guī)范詞,未匹配到規(guī)范詞,選擇提示中相關(guān)上級概念詞舌癌,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,40,,,,只查重點論述的文獻,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,41,系統(tǒng)自動擴展檢索下位

26、詞，勾選后不檢索下位詞,,樹形結(jié)構(gòu),上位詞,該詞無下位詞,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,42,輸入舌根的自由詞檢索式，進行AND運算。,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,43,初步結(jié)果，未限定年份,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,44,,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,45,設(shè)定的限制,,,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,46,輸入(t

27、ongue[ti] AND base[ti] AND (cancer[ti] OR carcinoma[ti] OR tumor[ti])) AND (therapy OR treat* OR surgery OR radiotherap* OR rehabilitat*),,自由詞檢索查全文獻,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,47,,,,加工中，無MeSH詞,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,4

28、8,,,比MeSH多10篇,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,49,,排序方式選擇,Abstract格式提供全文鏈接、規(guī)范詞等信息,MEDLINE格式提供所有字段信息,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,50,點擊標(biāo)題顯示文摘增強格式,,文獻歸類功能,,,PMC免費全文鏈接,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,51,文摘增強格式,相關(guān)論文,MeSH詞、物質(zhì)名、文獻類型等信息,LinkOut外

29、部資源鏈接,全文鏈接，我校訂購的數(shù)據(jù)庫可鏈全文，需在校園網(wǎng)內(nèi)設(shè)免費代理,相關(guān)的網(wǎng)上免費醫(yī)學(xué)指南信息,,全文鏈接，部分需連外網(wǎng),,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,52,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,53,輸出方式選擇,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,54,輸出方式選擇（send to）,File：保存檢索結(jié)果為文本文件Clipboard 剪貼板，多次檢索，可暫存每次檢索需下載的

30、記錄，最后一起保存。 最多允許存儲500條，保留8小時。Email: 通過郵件發(fā)送Collections：將檢索結(jié)果存到My NCBI中Order：全文傳遞服務(wù)，需帳號、收費。,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,55,訂閱最新結(jié)果,點擊后點“XML”按鈕,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,56,,需IE7.0以上版本,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,57,,,定期點擊鏈接，接收課題

31、最新相關(guān)論文,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,58,MeSH詞檢索,例2：用MeSH檢索2003-09年期間關(guān)于霉酚酸酯在腎衰竭治療中療效觀察的文獻。課題分析：匹配物質(zhì)名稱：mycophenolate mofetil匹配主題詞：renal failure, treatment effect（AND）匹配副主題詞：drug therapy, surgery, therapy,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)

32、圖書館文獻檢索教研室,59,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,60,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,61,,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,62,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,63,,,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,64,,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,65,MeSH檢索的優(yōu)點,查全同義詞:如：renal

33、/kidney failure; tongue cancer/tumor…查全子概念:如：chronic/acute kidney failure, ATN,,自動擴展檢索下位詞,上位詞,勾選后不擴展下位詞,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,66,MeSH檢索的優(yōu)點,根據(jù)樹形結(jié)構(gòu)調(diào)整檢索詞縮小：不擴展下位詞，或選用某個下位詞；擴大：選用上位詞，或選用多個同位詞；了解同一概念的同義詞、近義詞，供自由詞檢索參考,

34、,款目詞：規(guī)范詞所替代的不同表達形式的自由詞,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,67,MeSH檢索的優(yōu)點,提高文獻相關(guān)度標(biāo)有MeSH詞的都是文章的主題，篩去非主題的文章Major Topic Headings（加權(quán)，重點論述的主題）,,,,帶*的是文獻重點論述的主題,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,68,MeSH檢索的缺陷,人工標(biāo)引費時，最新論文還未標(biāo)MeSH詞（ In Process），用MeS

35、H會漏檢。Medline不收錄的文獻，Supplied by publisher的文獻，不標(biāo)MeSH詞。新詞、一些很專指的概念沒有對應(yīng)的規(guī)范詞。如：SARS（03年詞表中沒有），舌根癌查上述類型的文獻需結(jié)合自由詞檢索,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,69,六、PubMed其他資源,2. Journal Database（期刊信息庫）通過輸入刊名全稱或縮寫、ISSN號等瀏覽期刊出版社等詳細(xì)信息。提供期刊：在

36、PMC中的免費全文鏈接在Nucleotide，Protein，Pubmed等庫中的記錄鏈接。相關(guān)的其他期刊……,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,70,輸入待檢期刊名,期刊詳細(xì)信息,全文等鏈接,2024/3/18,復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室,71,七、PMC (PubMed Central),生命科學(xué)免費期刊資源中心免費提供900多種期刊的10多萬篇全文其中部分文獻被PubMed涵蓋,2024/3/18,復(fù)旦