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文檔簡介
1、目的:研究黃河三角洲近海岸區(qū)域古菌的多樣性及分布。
方法:以PCR技術(shù)為基礎(chǔ)構(gòu)建古菌16S rDNA基因文庫,在小尺度上選擇6個不同站位的沉積物樣品進行研究。
結(jié)果:1.經(jīng)研究處理后共獲得了568個克隆,擴增所得的16S rRNA基因經(jīng)過限制性雙酶切分析及應用軟件DOTUR進行97% cut off后共得到73個有效操作分類單元(Operational Taxonomic Unit,OUTs)。2.所有陽性克隆經(jīng)雙酶
2、切后進行測序,通過網(wǎng)上進行序列比對通過傳統(tǒng)統(tǒng)計學方法及所獲基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。3.對實驗獲得的16S rDNA分析發(fā)現(xiàn),本次研究的古菌均來自泉生古菌(Crenarchaeota)和廣生古菌(Euryarchaeota)兩大類。其中,Marine Crenarchaeotic Group I(MG- I)(88.8%)占據(jù)了主要地位,接下來依次為Miscellaneous Crenarchaeotic Group(MCG);DSAG(De
3、ep-Sea Archaeal Group)也稱為MBG-B;MBG-D,也稱MG-III(Marine Group III)以及、TMEG(Terrestrial Miscellaneous Eurarchaeotal Goup)。
結(jié)論:結(jié)果反映,MG-I與 MCG這兩個古菌類群的克隆數(shù)占16SrDNA總克隆數(shù)的96%,兩者均是海洋中最為常見的古菌類群,這也符合近海環(huán)境較為穩(wěn)定的特點。近海沉積物中古菌群落結(jié)構(gòu)在水平范圍并沒
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