蛋白質(zhì)動力學與蛋白質(zhì)折疊的理論研究.pdf

1、譬 7 7 0 7 6 3袒里七學學校代碼：1 0 2 4 6學 號：9 9 1 9 2 0碩士學位論文蛋白質(zhì)動力學與蛋白質(zhì)折疊的理論研究T h e o r e t i c a l S t u d y o f P r o t e i n 珥岫a 耐P m t 2 婦F o l d i n g院系( 所) ： 物理幕專姓 名： 吳穎灝指導教師： 資劍教授完成日期：2 0 0 2 年6 月5 日A b s t r a c tP r o t

2、e i n s ，t h e k e r n e l o f g e n e t i c e x p r e s s i o n ，a r e t h e m o s t a c t i v eb i o l o g i c a l m a c r o m o l e c u l e si nc e l l s ．T h e yp l a yc r u c i a l r o l e si na l m o s ta l lt h e

3、b i o c h e m i c a lp r o c e s s e s ．I t i s s i g n i f i c a n t t o s t u d y t h e s t r u c t u r ea n dm o t i o n o fs u c hm a c r o m o l e c u l e sI nt h i st h e s i s ，w eu s e s i m p l el a t t i c em o

4、 d e lt o d e s c r i b et h e u n i v e r s a lc h a r a c t e r so fn a t i v e p r o t e i n s ．W ea l s o u s eg e n e t i ca l g o r i t h ma n dn e u r a ln e t w o r k m o d e l t o s e a r c h t h e g r o u n d s

5、 t a t e s t r u c t u r e s a n dc l u s t e r t h ed i f f e r e n t p r o t e i n f a m i l i e s ．I n t h e a s p e c t o f P r o t e i n d y n a m i c s ，t h ec o a r s e ·- g r a i nm o n t e - c a r l os i m

6、u l a t i o na n d m o l e c u l a rd y n a m i c sm e t h o d s a r ea p p l i e d t o s t u d y t h e m o t i o no fp r o t e i n s ．F u r t h e r m o r e ，u s i n g G a u s s i a nN e t w o r kM o d e la n dA n i s o

7、t r o p i cN e t w o r kM o d e l ，w ec a n a n a l y s i s t h er e l a t i o n b e t w e e n s t r u c t u r e a n d f u n c t i o n o fd i f f e r e n t p r o t e i n s y s t e m ，i n c l u d i n gA T P S y n t h a s

8、e a n d L a c t a t e D e h y d r o g e n a s eK e y w o r d s ：P r o t e i nF o l d i n g ，P r o t e i nD y n a m i c s ，M o n t e - C a r l oS i m u l a t i o n ，M o l e c u l a rD y n a m i c sS i m u l a t i o n ，G e