栓菌及其近緣屬的分子系統(tǒng)學(xué)研究.pdf

1、栓菌(Trametes)及其近緣屬菌物是多孔菌中的重要類群，廣泛分布于各種自然環(huán)境中。栓菌的一些種在制藥與環(huán)境治理等方面有重要應(yīng)用價(jià)值。目前對(duì)栓菌的分類主要建立在菌絲類型、孢子形態(tài)、腐朽類型等形態(tài)學(xué)基礎(chǔ)上，然而有些栓菌及其近緣種擁有較為相似的形態(tài)學(xué)及顯微學(xué)結(jié)構(gòu)，因此僅以形態(tài)特征作為分類依據(jù)有時(shí)并不可靠，容易造成分類上的混淆。隨著分子系統(tǒng)學(xué)的發(fā)展，核苷酸序列在系統(tǒng)演化和分類研究中提供了最直接的證據(jù)，已廣泛用于真菌分子系統(tǒng)學(xué)的研究。本研究通

2、過(guò)克隆、測(cè)序ITS序列和mt SSU rDNA基本全長(zhǎng)序列，并結(jié)合GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中相關(guān)的基因序列對(duì)栓菌及其近緣屬菌物的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進(jìn)行了分析并且分別構(gòu)建了系統(tǒng)樹和生成了相關(guān)區(qū)域的二級(jí)結(jié)構(gòu)，主要結(jié)果如下：
　　(1)根據(jù)ITS序列和mt SSU rDNA序列所形成的系統(tǒng)樹具有良好的一致性，即絕大部分栓菌在系統(tǒng)樹上可以聚為一枝，紅孔菌屬與栓菌屬菌物擁有密切的親緣關(guān)系，在系統(tǒng)樹中不能與栓菌屬菌物完全分開(kāi)，對(duì)兩個(gè)屬菌株二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)

3、也表現(xiàn)出了高度的相似性。
　　(2)本研究證明雅致栓菌(Trametes elegans)是屬于栓菌屬的菌株，其與栓菌屬聚為一枝且與紅孔菌屬的關(guān)系較近。
　　(3)革孔菌屬菌物與栓菌屬菌物在以ITS序列和mt SSU rDNA序列所形成的系統(tǒng)樹上均能完全分開(kāi)，其中在以前系統(tǒng)分類學(xué)中存在爭(zhēng)議的菌物硬毛栓菌(Coriolopsis trogii)可以與革孔菌屬菌物聚為一枝且其相關(guān)區(qū)域的二級(jí)結(jié)構(gòu)與革孔菌屬菌物相似而與栓菌屬菌物有較

4、大不同，因此本研究認(rèn)為硬毛栓菌不屬于栓菌屬而屬于革孔菌屬。
　　(4)一色齒毛菌(Cerrena unicolor)與栓菌屬親緣關(guān)系較遠(yuǎn)，其在系統(tǒng)樹中的位置能夠與栓菌屬菌物完全分開(kāi)。相關(guān)區(qū)域二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)也顯示其與栓菌屬相差甚遠(yuǎn)，因此本研究認(rèn)為Cerrena unicolor不適合作為栓菌群菌物的代表種。
　　(5)對(duì)ITS-1及ITS-2區(qū)二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)展現(xiàn)出了與系統(tǒng)樹分析結(jié)果良好的一致性，ITS區(qū)序列堿基構(gòu)成的變化可能并

5、不對(duì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的變化產(chǎn)生重大影響，利用這一特點(diǎn)可以將一些序列變化較快從而造成序列對(duì)位排列困難的菌株進(jìn)行二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)來(lái)解決它們的系統(tǒng)發(fā)育問(wèn)題，對(duì)能夠正確進(jìn)行序列對(duì)位排列的菌株來(lái)說(shuō)，ITS二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)也對(duì)解決菌物的系統(tǒng)發(fā)育問(wèn)題起到了良好的輔助作用。
　　(6)本研究證明mt SSU rDNA的基本全長(zhǎng)序列可以很好的解決栓菌及其近緣屬菌物的系統(tǒng)發(fā)育問(wèn)題，該序列較長(zhǎng)且具有保守區(qū)與可變區(qū)，擁有豐富的生物信息學(xué)位點(diǎn)，可以很好的解決菌物屬間和屬