簡(jiǎn)介：安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文黃山風(fēng)景區(qū)常綠闊葉樹生齒裂菌屬分類學(xué)研究及該屬種間遺傳多樣性分析姓名賈國(guó)軍申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別碩士專業(yè)微生物學(xué)指導(dǎo)教師林英任201106IIABSTRACTHUANGSHANSCENICSPOTLOCATEDINSOUTHERNANHUIPROVIENCEISTHEMAINLSCAPEAREAOFOURCOUNTRYTHECOMPLEXTERRAINMILDTEMPERATUREPLENTIFULRAINFALLMAKEITSUITABLEFREPRODUCTIONOFNUMEROUSPLANTSCOCCOMYCESSPECIESAREWIDELYDISTRIBUTEDASWELLMEMBERSOFCOCCOMYCESWHICHCOLLECTEDFROMTHEEVERGREENBROADLEAVEDTREESOFHUANGSHANSCENICSPOTWERESYSTEMATICALLYSTUDIEDWITHTHEMOSTADVANCEDPOLYACTERINTEGRATEDTAXONOMYMETHODFOCUSEDONTHEACTERSOFMPHOLOGYDEVELOPMENTALBIOLOGYECOLOGYDISTRIBUTIONETCMEOVERTHEMETHODOFTHENUCLEOTIDESEQUENCESOFINTERNALTRANSCRIBEDSPACERITSWEREUSEDTOINFERPHYLOGEICRELATIONSHIPSOFTHE18COCCOMYCESSTRAINSRESULTSDETERMINEDTHEIMPTANCEOFSOMEMPHOLOGICALACTERSTHECATEGYDIVERSITYOFHOSTSONTHECLASSIFICATIONOFFUNGALSPECIESLEVELRELATIONSHIPSGEICDIVERSITYOFTHEINTERSPECIFICSTRAINSOFCOCCOMYCESWEREFURTHERCONFIRMEDSPECIMENSOFCOCCOMYCESONTHEEVERGREENBROADLEAVEDTREESCOLLECTEDFROMHUANGSHANSCENICSPOTOWNEDBYTHEHERBARIUMOFFESTFUNGIOFANHUIAGRICULTURALUNIVERSITYAAUFWERECLASSIFIEDIDENTIFIEDACCDINGTOTHETAXONOICPRINCIPLESOFSHERWOOD1980JOHNSTON1986SPOONER1990KIRKETAL200813SPECIESWEREINDENTIFIEDINCLUDINGCOCCOMYCESCYCLOBALANOPSISCDELTACHUANGSHANENSISCILLICIICOLACLEPTIDEUSCLIMITATUSCMAGNUSCMINIMUSCMUCRONATUSCMULTANGULARISCOCCULTUSCSINENSISCSYMPLOCIAMONGTHEMCMINIMUSWASANEWSPECIESTOBEPUBLISHEDLATINDIAGNOSESWEREGIVENASWELLMPHOLOGICALACTERISTICSHABITSHOSTSDISCUSSIONSWEREPROVIDEDFEACHSPECIESDICHOTOMOUSKEYTOTHESESPECIESWERECOMPLIEDINTHISTHESISFRESHMATERIALSOFCOCCOMYCESCOLLECTEDFROMHUANGSHANSCENICSPOTTIANTANGZHAINATIONALFESTPARKWANFOSHANNATIONALFESTPARKWEREISOLATEDCULTIVATEDBYTISSUEISOLATIONTECHNIQUE13PURESTRAINSWEREOBTAINEDDNAOFALLTHESTRAINSWEREEXTRACTEDDETECTEDRDNAITSREGIONSWEREAMPLIFIEDBYPCRTHENSEQUENCEDGCCONTENTOF18STRAINSWEREANALYSEDBYTHEMETHODOFMEGA41THESTATISTICALRESULTSINDICATEDTHATTHELENGTHOFITSSEQUENCESOFEACHCOCCOMYCESWASRANGEFROM436BPTO457BPTHEGCCONTENTSOFTHEITSSEQUENCESVARIEDFROM480TO516THELENGTHOFITSSEQUENCESGCCONTENTOFINTRASPECIFICSTRAINSARELOWERVARIABLETHANTHATOFINTERSPECIFICSTRAINSTHISSHOWSTHATINTERSPECIFICGEICDIVERSITYISMEABUNDANTTHANOFINTRASPECIFICAPHYLOGEICTREEOF18STRAINSWASCONSTRUCTEDBY

簡(jiǎn)介：謹(jǐn)以此論文獻(xiàn)給敬愛的父母一李淵卜一二㈡。，鼻。一吐洚LIIIRLIF1LLLLLIIRLIY1926837大葉藻科的系統(tǒng)發(fā)育與大葉藻居群遺傳學(xué)研究學(xué)位論文完成日期2Q生圣旦窆旦指導(dǎo)教師簽字答辯委員會(huì)成員簽字1’___。_一／么彥’姚∥F77吻，乞乞

簡(jiǎn)介：中國(guó)科學(xué)院研究生院碩士學(xué)位論文東亞特有珍稀瀕危植物連香樹的居群遺傳學(xué)研究姓名袁珊申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別碩士專業(yè)植物學(xué)指導(dǎo)教師王恒昌201205ABSTRACTABSTRACTINORDERTOSTUDYTHEGENETICDIVERSITYANDSTRUCTUREOFTHEEASTASIANNATIVEANDENDANGEREDPLANTCERCIDIPHYLLUMJAPONICUMSIEBETZUCC，WEUSED11PAIRSOFAMPLIFIEDFRAGMENTLENGTHPOLYMORPHISMAFLPMARKERSTOEXAMINEATOTALOF25POPULATIONSTHATSAMPLEDFROMCHINAANDJAPANTHERESULTSSHOWEDTHATTHEPERCENTAGEOFPOLYMORPHICLOCIPWAS9725％，NEI’SGENEDIVERSITYHWAS04736ANDSHANNONINFORMATIONINDEXIWAS03514ONSPECIESLEVEL，INDICATINGAHIGHLEVELOFGENETICDIVERSITYOFTHESPECIESTHISMAYBERESULTEDFROMTHELONGEVOLUTIONARYHISTORYANDWIDELYGEOGRAPHICDISTRIBUTIONOFTHESPECIESINTHEPASTHOWEVER，ATPOPULATIONLEVEL，THEYWEREONLY6704％，0218AND03294RESPECTIVELY，SUGGESTINGALOWLEVELOFGENETICDIVERSITYTHISWASRELATIVELYCONSISTENT、析MTHERAREANDENDANGEREDSTATUSOFCERCIDIPHYLLUMJAPONICUM，WHICHDEMONSTRATEDTHATTHEGENETICVARIATIONOFSMAUPOPULATIONSTENDEDTODECREASEINTHELONGEVOLUTIONARYHISTORYTHEGENETICVARIATIONANALYSESSHOWEDTHATTHECOEFFICIENTOFGENEDIFFERENTIATIONWAS02938ANDTHEGENEFLOWWAS06010AMONGPOPULATIONSCOMBININGTHEFSTO221FROMTHEAMOVAANALYSIS，WEREVEALEDARELATIVELYHIGHGENETICVARIATIONRESULTEDFROMTHELOWGENEFLOWAMONGTHEPOPULATIONSINADDITION，WETESTEDTHEGENETICVARIATIONANDDIFFERENTIATIONOFFOURPOPULATIONSOFCERCIDIPHYLLUMJAPONICUMALONGTHEFOURRIPARIANRIVERSINTHENORTHERNANDSOUTHERNSLOPESOFTHESHENNONGJIAMOUNTAIN，ASWELLASTHEEFFECTOFSHENNONGJIAMOUNTAINASANATURALBARRIERTOTHEGENETICSTRUCTUREOFTHISSPECIESOURRESULTSSUGGESTEDTHATLARGEMOUNTAINMAYHAVESERVEDASAPHYSICALBARRIERTOGENEFLOWBETWEENPLANTPOPULATIONSTHELOWLEVELOFGENETICDIFFERENTIATIONOFPOPULATIONSBETWEENSOUTHERNANDNORTHERNSLOPEMAYHAVERESULTEDFROMTHEINTEMALCHARACTERSOFLONGDISTANCEDISPERSALABILITYOFPOLLENANDSEEDOFTHESPECIESINSUMMARY，THESTUDYONPOPULATIONGENETICDIVERSITYANDSTRUCTUREOFCERCIDIPHYLLUMJAPONICUMCALLPROVIDEFUNDMENTALINFORMATIONFORTHEFURTHERCONSERVATIONOFTHESPECIESQJQIAOJIAYUNNANANDDLLDALAOLING，HUBEIPOPULATIONS、ⅣI廿LHIGHERGENETICDIVERSITYWEREPROPOSEDTOGIVEPRIORITYTOBECONSERVEDKEYWORDSAFLP，CERCIDIPHYLLUMJAPONICUM，NATIVEANDENDANGEREDPLANTGENETICDIVERSITYGENETICSTRUCTURE

簡(jiǎn)介：F』IIIIIIILLILLLLILLIIIFLL|MLLIULULEY1830520太平洋鯡和大頭鱈的群體遺傳學(xué)研究學(xué)位論文完成日期生』竺仝指導(dǎo)教師簽字答辯委員會(huì)成員簽字煎魚二

簡(jiǎn)介：版權(quán)聲明任何收存和保管本論文各種版本的單位和個(gè)人，未經(jīng)本論文作者同意，不得將本論文轉(zhuǎn)借他人，亦不得隨意復(fù)制、抄錄、拍照或以任何方式傳播。否則，引起有礙作者著作權(quán)之問(wèn)題，將可能承擔(dān)法律責(zé)任。通過(guò)35SLFYGR在PKL突變體中過(guò)量表達(dá)“Y，可以某種程度上逆轉(zhuǎn)由于PKL突變導(dǎo)致的開花延遲。這些結(jié)果提示，PKL很可能通過(guò)某種方式結(jié)合并調(diào)節(jié)“】，的表達(dá)，進(jìn)而參與開花時(shí)間的調(diào)節(jié)。綜上所述，本課題通過(guò)RNA測(cè)序和CHIP測(cè)序的方法，從基因組水平研究擬南芥三個(gè)不同發(fā)育時(shí)期PKL所調(diào)節(jié)的下游靶基因。發(fā)現(xiàn)PKL在不同的生長(zhǎng)時(shí)期會(huì)參與調(diào)控不同下游基因的表達(dá)，并且在這三個(gè)發(fā)育時(shí)期都存在一些特異的PKL結(jié)合位點(diǎn)；找到了一些受到PKL調(diào)節(jié)的包括開花相關(guān)基因包括“Y基因及其下游調(diào)控的基因在內(nèi)的下游基因，表明PKL下游基因的多樣性可能是造成PK／突變體的表型多樣性的主要原因，這一結(jié)果能夠很好地解釋P肼突變體延遲開花的表型；PKL蛋白在開花起始時(shí)結(jié)合并上調(diào)ⅡV基因、以及通過(guò)上調(diào)“】，上游基因進(jìn)而上調(diào)凹】，可能是PKL調(diào)節(jié)擬南芥開花時(shí)間的重要分子機(jī)制。關(guān)鍵詞擬南芥，染色質(zhì)重塑因子，PICKLE，RNA測(cè)序，染色質(zhì)免疫共沉淀，開花2

簡(jiǎn)介：學(xué)校代號(hào)10532學(xué)號(hào)B0911T0017分類號(hào)密級(jí)博士學(xué)位論文擬南芥CRY2調(diào)控光形態(tài)建成的分子遺傳學(xué)與生化分析學(xué)位申請(qǐng)人姓名王琴培養(yǎng)單位化學(xué)化工學(xué)院導(dǎo)師姓名及職稱劉選明教授林辰濤教授學(xué)科專業(yè)分析化學(xué)研究方向生化分析與分子生物學(xué)論文提交日期2013年6月7日THEMOLECULARGEICALBIOCHEMICALSTUDYOFCRY2INCONTROLLINGPHOTOMPHOGENESISINARABIDOPSISBYQINWANGMSHUNANUNIVERSITY2010ADISSERTATIONSUBMITTEDINPARTIALSATISFACTIONOFTHEREQUIREMENTSFTHEDEGREEOFDOCTOFSCIENCEINANALYTICALCHEMISTRYINTHEGRADUATESCHOOLOFHUNANUNIVERSITYSUPERVISPROFESSLIUXUANMINGPROFESSLINCHENTAOJUNE2013

簡(jiǎn)介：廈門大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明本人呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下，獨(dú)立完成的研究成果。本人在論文寫作中參考其他個(gè)人或集體己經(jīng)發(fā)表的研究成果，均在文中以適當(dāng)方式明確標(biāo)明，并符合法律規(guī)范和廈門大學(xué)研究生學(xué)術(shù)活動(dòng)規(guī)范試行。另外，該學(xué)位論文為桶省穰課題組的研究成果，獲得課題組經(jīng)費(fèi)或?qū)嶒?yàn)室的資助，在篆H∞實(shí)驗(yàn)室完成。請(qǐng)?jiān)谝陨侠ㄌ?hào)內(nèi)填寫課題或課題組負(fù)責(zé)人或?qū)嶒?yàn)室名稱，未有此項(xiàng)聲明內(nèi)容的，可以不作特別聲明。聲明人簽名箋3務(wù)砂N年毛月弓日目錄目錄摘要IABSTRACTIV第一章引言111荔枝螺THAIS簡(jiǎn)介112荔枝螺的應(yīng)用價(jià)值213荔枝螺的繁殖習(xí)性214分類學(xué)研究手段和方法315遺傳標(biāo)記及其在群體遺傳學(xué)和系統(tǒng)進(jìn)化的應(yīng)用816國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀1217研究意義18第二章荔枝螺貝殼形態(tài)分類研究2021荔枝螺屬THAISR6DING，1798一20第三章荔枝螺齒舌形態(tài)分析3531材料與方法3532結(jié)果與分析3633討論40第四章基于COI和16SRRNA基因的荔枝螺系統(tǒng)發(fā)育分析4341材料與方法4342結(jié)果與分析4743討論60第五章中國(guó)沿岸8個(gè)地理群體的疣荔枝螺遺傳結(jié)構(gòu)分析6651材料與方法6652結(jié)果與分析6953討論78結(jié)論與研究展望81參考文獻(xiàn)84圖版92

簡(jiǎn)介：STUDIESONTHEMOI之PHOLOGYANDGENETICDIVERSITYOFHEMIBARBUSMACULATUSINHENANPROVINCEADISSERTATIONSUBMIAEDTOTHEGRADUATESCHOOLOFHENANNORMALUNIVERSITYINPARTIALFULFILLMENTOFTHEREQUIREMENTSFORTHEDEGREEOFMASTEROFSCIENCEBYBAOZHANMENGSUPERVISORPROFLIXUEJUNMAY，2014較小，但二者與南陽(yáng)、淇河群體遺傳距離較大。6本研究表明，DNA條形碼適用于胸亞科魚類，基于對(duì)絢亞科7種10個(gè)體的COI基因序列分析，發(fā)現(xiàn)在觴亞科魚類中COI基因序列可以較好地區(qū)分各物種。因此，COI基因序列對(duì)該亞科的分類是一個(gè)行之有效的DNA條形碼序列。關(guān)鍵詞鲴I，形態(tài)特征，分子條形碼技術(shù)，遺傳多樣性II

簡(jiǎn)介：基于比較基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)的枯草芽比較基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)的枯草芽孢桿菌桿菌過(guò)量積累過(guò)量積累核黃素核黃素遺傳遺傳機(jī)理機(jī)理研究研究INSIGHTSINTOGEICACTERISTICSOFRIBOFLAVINOVERPRODUCINGBACILLUSSUBTILISBASEDONCOMPARATIVEGENOMICSTRANOMICS國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目（973計(jì)劃）2011CBA00804；國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目NSFC21206112；國(guó)家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃（863計(jì)劃）2012AA022103；一級(jí)學(xué)科化學(xué)工程與技術(shù)學(xué)科專業(yè)生物化工研究生王光路指導(dǎo)教師趙學(xué)明教授天津大學(xué)化工學(xué)院二零一四年十月中文摘要中文摘要本課題選取核黃素合成基礎(chǔ)菌株為研究對(duì)象，通過(guò)比較基因組與比較轉(zhuǎn)錄組分析，篩選出潛在正向突變，進(jìn)一步利用無(wú)痕等位基因置換技術(shù)，逆向代謝工程重構(gòu)突變菌株，考察不同突變對(duì)于核黃素合成貢獻(xiàn)度。對(duì)鑒定的正向突變進(jìn)行機(jī)理分析，闡述導(dǎo)致枯草芽孢桿菌過(guò)量合成核黃素的遺傳機(jī)制。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)表明，和對(duì)照菌株相比，BSUBTILIS24PMX45菌株共有945個(gè)差異表達(dá)基因，表達(dá)水平上調(diào)的基因有483個(gè)，表達(dá)水平下調(diào)的基因有462個(gè)。進(jìn)一步數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)，BSUBTILIS24PMX45核黃素合成途徑表達(dá)水平較高，但嘌呤代謝途徑、一碳單位代謝相關(guān)途徑表達(dá)水平低。同時(shí)，中心碳代謝途徑和葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)基因表達(dá)水平較低，這些可能是該菌葡萄糖利用速率低、生長(zhǎng)速度慢和核黃素合成速率較低的原因。結(jié)合全基因組突變分析與比較轉(zhuǎn)錄組結(jié)果，通過(guò)無(wú)痕等位基因置換技術(shù)，鑒定出7個(gè)正向突變RIBC（G199D）、RIBD（G39A）、PURA（P242L）、CCPN（A44S）、YVRH（R222Q）、YHCF（R90）、YWAA（Q68）。將正向突變以及游離質(zhì)粒PMX45重構(gòu)至工程菌株BSW54PMX45，可達(dá)到BSUBTILIS24PMX45菌株80的核黃素合成水平。其中，RIBC（G199D）、RIBD（G39A）顯著解調(diào)了核黃素操縱子的表達(dá)。PURA（P242L）導(dǎo)致了腺苷琥珀酸合成酶活性喪失，導(dǎo)致IMP向AMP合成受阻，菌體過(guò)量合成GMPGDPGTP，提高了核黃素合成前體物的供給水平。CCPN（A44S）喪失部分抑制活性，解調(diào)了糖異生代謝途徑，提升了戊糖磷酸途徑的通量和前體物核酮糖5磷酸的供給。雙組分系統(tǒng)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)子基因YVRH（R222Q）突變顯著提升核黃素合成能力。RTPCR實(shí)驗(yàn)表明，受其負(fù)調(diào)控LYTABC的表達(dá)水平明顯上調(diào)，說(shuō)明YVRH（R222Q）部分丟失功能。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)表明，LYTC（NACETYLMURAMOYLLALANINEAASE）過(guò)表達(dá)導(dǎo)致菌株嘌呤合成途徑顯著增強(qiáng)，提高了核黃素合成能力，推測(cè)LYTC的過(guò)表達(dá)改變了細(xì)胞壁完整性和滲透性，并進(jìn)一步解調(diào)了嘌呤合成途徑。在谷氨酸棒桿菌工程菌株△4PPC中過(guò)表達(dá)NACETYLMURAMOYLLALANINEAASE可顯著提高5氨基乙酰丙酸合成能力，說(shuō)明這種作用機(jī)制對(duì)于提高生物基產(chǎn)品的產(chǎn)量可能具有一定普遍適用性。關(guān)鍵詞關(guān)鍵詞枯草芽孢桿菌；核黃素；轉(zhuǎn)錄組測(cè)序；逆向代謝工程；突變分析；

簡(jiǎn)介：中圖分類號(hào)Q3窆UDC570碩士學(xué)位論文學(xué)校代碼Q三三密級(jí)公玨過(guò)量碘對(duì)線蟲生長(zhǎng)發(fā)育影響的遺傳學(xué)研究GENETICANALYSISOFTHEBIOLOGICALEFFECTOFEXCESSIODIDEINCELEGANS作者姓名學(xué)科專業(yè)學(xué)院系、所指導(dǎo)導(dǎo)師許昭發(fā)遺傳學(xué)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室馬龍教授論文答辯日期幽答辯委員會(huì)主席翅孕I中南大學(xué)二0一四年六月碩士學(xué)位論文中文摘要摘要過(guò)量碘對(duì)線蟲生長(zhǎng)發(fā)育影響的遺傳學(xué)研究碘是生物體必需的一種微量元素，在高等動(dòng)物中主要用于合成甲狀腺激素，調(diào)節(jié)代謝。碘缺乏和過(guò)量都會(huì)導(dǎo)致嚴(yán)重的后果，碘缺乏是甲狀腺功能低下和智力發(fā)育遲鈍的一個(gè)主要原因，而碘過(guò)量是高碘性甲狀腺腫、甲狀腺功能亢進(jìn)等諸多甲狀腺疾病的主要風(fēng)險(xiǎn)因素。然而，碘過(guò)量致病的分子機(jī)制尚不明了。相對(duì)哺乳動(dòng)物，碘在其他動(dòng)物上的研究也很少，秀麗線蟲CAENORHABDITISELEGANS是一種常用的、重要的模式動(dòng)物，而碘在秀麗線蟲上幾乎沒有研究。目的研究過(guò)量碘對(duì)秀麗線蟲生長(zhǎng)發(fā)育的影響，了解線蟲應(yīng)對(duì)過(guò)量碘的基因及分子機(jī)制。方法在線蟲培養(yǎng)基中加入不同濃度的碘，培養(yǎng)野生型線蟲N2，觀察過(guò)量碘對(duì)線蟲生長(zhǎng)發(fā)育的影響。通過(guò)EMSETHYLMETHANESULFONATE正向遺傳篩選獲得相關(guān)突變體，利用SNPSINGLENUCLEOTIDEPOLYMORPHISM遺傳作圖分析定位突變所在染色體及區(qū)間位置，并克隆突變基因。用DCFDA2’，7DICHLORODIHYDROFLUORESCEINDIACETATE對(duì)不同品系線蟲體內(nèi)活性氧族REACTIVEOXYGENSPECIES，ROS水平進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果我們?cè)诰€蟲培養(yǎng)基里加入不同濃度的碘化鈉，發(fā)現(xiàn)野生型線蟲呈現(xiàn)一種碘濃度依賴的負(fù)相關(guān)生長(zhǎng)模式，當(dāng)濃度達(dá)到5MM及以TT

簡(jiǎn)介：BYZHANGNINGNINGADISSERTATIONSUBMITTEDTOUNIVERSITYOFCHINESEACADEMYOFSCIENCESINPARTIALFULFFILMENTOFTHEREQUIREMENTFORTHEDEGREEOFMASTEROFSCIENCEKUNMINGINSTITUTEOFBOTANYCHINESEACADEMYOFSCIENCESMAY2014研究生學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)聲明本人完全了解并同意遵守中科院昆明植物研究所有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，即研究所有權(quán)保留送交論文的復(fù)印件和電子文件，并提供論文的目錄檢索及借閱、查閱研究所可以公布論文的全部或部分內(nèi)容，可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索，可以采用影印、縮印或其它復(fù)制手段保存和匯編本學(xué)位論文。保密的論文在解密后遵守此規(guī)定。作者簽名導(dǎo)師簽名時(shí)間刀仫J27

簡(jiǎn)介：針興號(hào)。Q逛B⑧皂。舅I蒸拳杰。羹博士學(xué)位論文學(xué)號(hào)皂2QL墊』叢六儲(chǔ)礴越堿摯屬％忽種細(xì)胞遺傳學(xué)與螺J紊統(tǒng)避花研究。一指導(dǎo)熬I師攀季K專業(yè)研，菇、努向L‘●‘論文答辯峙閘楊賻容周永紅J教授橙物學(xué)植物分類翱熹統(tǒng)進(jìn)化20T7年5月22日答辯委員會(huì)主席余懋群巾科院成都生物所∞。H車受鞠ADISSERTATIONPRESENTEDTOSICHUANAGRICULTURALUNIVERSITYINFULFILLMENTOFTHEREQUIREMEMFORTHEDOCTORDEGREEOFBOTANYCYTOGENETIC，PHYLOGENETICANDEVOLUTIONARYSTUDIESONHQPLOIDEOPOACEAESTUDIES0NHEXAPLOIDEVMUSLOACEAETRITICEAEBYYANGCAIRONGDIRECTEDBYPROFZHOUYONGHONGDRZHANGHAIQINDRBERNARDRBAUMUNIVERSITYOFOTTAWA，CANADADRDOUGLASAJOHNSONUNIVERSITYOFOTTAWA，CANADAMAY2017

簡(jiǎn)介：關(guān)于基因型一表型相關(guān)問(wèn)題的統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)及計(jì)算生物學(xué)分析陳文海指導(dǎo)老師谷迅教授復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院復(fù)旦大學(xué)博士學(xué)位論文關(guān)于基因型表型相關(guān)問(wèn)題的統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)及計(jì)算生物學(xué)分析目錄摘要IABSTMCTIII前言L第一章文獻(xiàn)綜述31I引言312FISHER幾何模型及表型進(jìn)化的選擇模型313基因多效性的度量4131多效性的直接計(jì)算及問(wèn)題4132利用數(shù)學(xué)模型通過(guò)其它觀測(cè)來(lái)間接計(jì)算S14利用數(shù)學(xué)模型來(lái)間接計(jì)算基因多效性GU方法簡(jiǎn)介一6141蛋白質(zhì)序列進(jìn)化模型6142選擇強(qiáng)度與模型分類914_3蛋白質(zhì)序列的進(jìn)化速率11144估計(jì)基因多效性和選擇強(qiáng)度13145基因多效性的初步分析16IA6對(duì)GU方法的幾點(diǎn)評(píng)注I715胞吐作用1716參考文獻(xiàn)21第二章關(guān)于基因多效性概念和統(tǒng)計(jì)估計(jì)問(wèn)題的進(jìn)一步探討鴣21引言2822HL模型的簡(jiǎn)要介紹2923多層次基因型表型映射模型及最小多效性的概念3324基因型表型映射的線性模型及其秩的定義3424。I單映射情景34242線性變換映射模型從一步映射推廣到多步映射3S25基因型表型映射下秩的估計(jì)36251穩(wěn)態(tài)選擇模型下的自然選擇系數(shù)37252MARTINLENORMAND方法37253GU方法3826有效最小多效性對(duì)于X的一種各選解釋38261MARTINLCNORMAND方法RL對(duì)應(yīng)于隨機(jī)突變39262GU方法39263PIGANCAUWALKCR方法3927數(shù)據(jù)分析和測(cè)試。40271GU方法對(duì)蛋白質(zhì)序列的應(yīng)用一40272GU方法對(duì)核苷酸序列的應(yīng)用412S基于MATLAB的計(jì)算流程～42281有效基因多效性丘43282估計(jì)步驟44283有效選擇強(qiáng)度44284有效基因多效性的糾偏估計(jì)4S29計(jì)算機(jī)模擬46291突變秩對(duì)估計(jì)的影響46

簡(jiǎn)介：SICHUANAGRICULTURALUNIVERSITYMASTERDISSERTATIONTHEPHYLOGENETICANDGENETICDIVERSITYSTUDIESOFAGROPYRONCRISTATUMLGAERTNERPOACEAETRITICEAEBASEDONMORPHOLOGYANDGBSSIGENE一一，一ZHUOXIAOFENGBOTANYDIRECTEDBYPROFXIAOLIWANGDRLINASHAYAAN，SICHUAN，PRCMAY，2015摘要LULLLLLLLLLLLLLLLLLMIILRLLLLLLLLLLLLFJ0126769冰草AGROPYRONCRISTATUMLGAERTNER為禾本科POAEEAE小麥族TRITIEEAE多年生草本植物，是冰草屬的模式種，廣泛分布于歐亞大陸的北亞熱帶和溫寒帶等地區(qū)。冰草是草原草甸的重要組成成分，對(duì)生態(tài)環(huán)境的改善、水土保持有著重要作用冰草莖葉柔嫩、飼口性好、生長(zhǎng)迅速，具有很高的飼用價(jià)值；冰草具有抗旱、抗寒、耐鹽堿以及對(duì)各種病蟲害的抗性，是小麥遺傳改良的重要資源。目前，對(duì)冰草的研究主要集中在生態(tài)建設(shè)、遺傳育種等方面，而對(duì)于其系統(tǒng)發(fā)育、居群遺傳結(jié)構(gòu)、分支系統(tǒng)學(xué)方面的研究還未見報(bào)道。本研究選取47個(gè)冰草植物的14個(gè)形態(tài)性狀，63個(gè)冰草植物以及25個(gè)其近緣的二倍體屬種植物的GBSSI基因序列，從形態(tài)學(xué)和分子系統(tǒng)學(xué)兩方面對(duì)其進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育重建，探討冰草及其近緣屬植物間的系統(tǒng)關(guān)系，冰草居群間的親緣關(guān)系、遺傳分化、形態(tài)變異以及遺傳結(jié)構(gòu)，冰草植物的遺傳多樣性。研究結(jié)果表明1冰草在物種水平上及居群水平上均表現(xiàn)出豐富的遺傳多樣性7【O05。冰草居群間遺傳分化系數(shù)為0058，居群內(nèi)遺傳的多樣性是導(dǎo)致冰草物種遺傳多樣性豐富的主要因素。2分子系統(tǒng)樹中，冰草分別與EREMOPYRUMDISTANS、AGROPYRONMONGOLICUM以及TAENIATHERUMCAPUTMEDUSAE聚在一起，支持P染色體組與F染色體組有較近的親緣關(guān)系。3中亞冰草居群分布在分子系統(tǒng)樹及分支系統(tǒng)樹的各個(gè)分支中，中亞居群與歐洲、東亞的遺傳距離較近，推測(cè)中亞可能是冰草的生物多樣性起源中心。青藏高原冰草居群與中亞、歐洲居群遺傳距離較遠(yuǎn)，且在系統(tǒng)發(fā)育樹中大多形成獨(dú)立的分支，推測(cè)在長(zhǎng)期的演化歷史進(jìn)程中，青藏高原冰草居群已經(jīng)處于相對(duì)獨(dú)立的狀態(tài)。4中亞冰草居群在進(jìn)化歷史過(guò)程中可能經(jīng)歷過(guò)明顯的群體擴(kuò)大和定向選擇事件TAJIMASD185001，P005。歐洲、東亞居群中性檢測(cè)值均為負(fù)值，且差異不顯著，說(shuō)明歐洲與東亞冰草居群未偏離中性進(jìn)化模型，居群相對(duì)結(jié)構(gòu)穩(wěn)定。關(guān)鍵詞分支分析；分子系統(tǒng)學(xué)；形態(tài)學(xué)性狀；GBSSL基因；冰草；遺傳多樣性

簡(jiǎn)介：分類號(hào)密級(jí)UDC編號(hào)工學(xué)碩士學(xué)位論文結(jié)合表觀遺傳學(xué)的轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控功能分析方法研究碩士研究生董增超指導(dǎo)教師馮偉興教授學(xué)科、專業(yè)檢測(cè)技術(shù)與自動(dòng)化裝置論文主審人王科俊教授哈爾濱工程大學(xué)2013年01月CLASSIFIEDINDEXUDCADISSERTATIONFTHEDEGREEOFMENGRESEARCHOFANALYSISMETHODTOINVESTIGATEREGULATYFUNCTIONOFTRANIONFACTWITHEPIGEICFACTSCIDATEDONGZENGCHAOSUPERVISFENGWEIXINGACADEMICDEGREEAPPLIEDFMASTEROFENGINEERINGSPECIALTYDETECTIONTECHNOLOGYAUTOMATIONEQUIPMENTDATEOFSUBMISSIONJAN2013DATEOFALEXAMINATIONMAR2013UNIVERSITYHARBINENGINEERINGUNIVERSITY