南海海域11種常見笛鯛屬魚類的分子系統(tǒng)學研究.pdf

1、采用聚合酶鏈式反應(PCR)技術對笛鯛屬的11個習見種：勒氏笛鯛(Lutjanus.russellii)、紅鰭笛鯛(Lutjanus.erythropterus)、紫紅笛鯛(Lutjanus.argentimaculatus)、星點笛鯛(Lutjanus.stellatus)、約氏笛鯛(Lutjanus.johnii)、千年笛鯛(Lutjanus.sebae)、金帶笛鯛(Lutjanus.fulvus)、金焰笛鯛(Lutjanus.fu

2、lviflamma)、畫眉笛鯛(Lutjanus.vitta)、奧氏笛鯛(Lutjanus.ophuysenii)和馬拉巴笛鯛(Lutjanus.malabaricus)的mtDNA的CO I基因與核糖體DNA的ITS區(qū)全序列進行了擴增。PCR產物純化后經T載體連接進行克隆、測序，序列結果對比拼接后提交GenBank并獲得序列登錄號(EU502667-EU502710)。CO I基因序列全長1551bp，A、T、G、C的含量平均為28.

3、7％、28.7％、19.0％和27.9％，AT含量稍高于GC含量，11種笛鯛中堿基組成差異不大。利用MEGA4.0軟件檢測到簡約信息位點(parsimony informative sites)371個，轉換和顛換比為2.0。Tamura-Nei平均遺傳距離為0.125。利用測得序列分別構建了NJ和ME分子系統(tǒng)樹，選用諧魚(Emmelichtys truhsakeri GenBank登錄號AP004446)為外群，發(fā)現(xiàn)兩種方法構建的系統(tǒng)

4、樹基本一致：畫眉笛鯛、奧氏笛鯛和金帶笛鯛聚為一支；馬拉巴笛鯛、紅鰭笛鯛和千年笛鯛聚為一支；盒焰笛鯛、約氏笛鯛和勒氏笛鯛聚為一支；紫紅笛鯛和星點笛鯛聚為一支。種間關系在應用這兩種方法分析時都得到了高于50％的支持率，其中馬拉巴笛鯛和紅鰭笛鯛有著最為緊密的親緣關系，奧氏笛鯛和畫眉笛鯛有著較為緊密的親緣關系。總體來看各個種之間均保持了一定的遺傳距離，沒有出現(xiàn)種間個體相互混雜的現(xiàn)象，這也說明了在南海海域的這11種笛鯛仍保持了自己的遺傳特性。對核

5、糖體DNA ITS區(qū)比對后發(fā)現(xiàn)各物種序列長度有一定差異，但是其堿基組成比例卻沒有很大的差別。A、T、G、C含量平均為17.0％、19.4％、30.3％和33.4％，GC含量遠遠超過AT含量。經過比對后發(fā)現(xiàn)變異位點753個，其中包括簡約信息位點620個。核酸轉換值和顛換值分別為140和221，轉換/顛換比值平均為0.6，這一比值遠遠低于正常DNA序列的比值。根據Kimura-2雙參數和Jukes-Cantor單參數兩種模型計算的11種笛鯛