面向知識(shí)發(fā)現(xiàn)的神經(jīng)信息文獻(xiàn)系統(tǒng)的設(shè)計(jì)與初步實(shí)現(xiàn).pdf

1、神經(jīng)科學(xué)研究產(chǎn)生了格式相異的海量數(shù)據(jù)，隨著神經(jīng)科學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)的進(jìn)步又使得新的神經(jīng)信息數(shù)據(jù)類型不斷增加，并且在訪問多個(gè)不同的神經(jīng)信息數(shù)據(jù)庫時(shí)常常存在搜索語言、訪問方式、數(shù)據(jù)模型及語義推導(dǎo)等多方面的不匹配問題，導(dǎo)致從事腦科學(xué)研究的科研人員難以掌握全部的有用信息，因此整合神經(jīng)信息數(shù)據(jù)資源有著非常重要的意義。
　　 本文研究設(shè)計(jì)了一個(gè)特定的針對(duì)神經(jīng)影像及腦功能研究專題的神經(jīng)信息文獻(xiàn)系統(tǒng)(NILS)，可為研究人員節(jié)省許多數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換之間的工作，

2、促進(jìn)數(shù)據(jù)共享；部分解決異構(gòu)神經(jīng)信息數(shù)據(jù)庫的整合問題，將不同數(shù)據(jù)庫中彼此聯(lián)系的信息整合在一起，形成一個(gè)構(gòu)架于這類數(shù)據(jù)庫之上的數(shù)據(jù)集成平臺(tái)，進(jìn)而有利于數(shù)據(jù)庫的信息挖掘及知識(shí)發(fā)現(xiàn)。主要研究工作包括：
　　 面向知識(shí)發(fā)現(xiàn)，整合神經(jīng)影像及腦功能研究數(shù)據(jù)，抽取神經(jīng)相關(guān)文獻(xiàn)中的有用信息和知識(shí)，并為神經(jīng)信息本體構(gòu)建提供原始數(shù)據(jù)。NILS包括系統(tǒng)維護(hù)、文獻(xiàn)更新、文獻(xiàn)檢索、結(jié)果展示及輸出、文獻(xiàn)信息分析、神經(jīng)影像信息整合、神經(jīng)信息文本挖掘和神經(jīng)本體原

3、型構(gòu)建8大功能模塊。NILS能夠半自動(dòng)地從多個(gè)不同的潛在資源庫中搜集、整理、分析和儲(chǔ)存數(shù)據(jù)，提供多學(xué)科和多層次的整合檢索服務(wù)，幫助我們創(chuàng)建一個(gè)全面認(rèn)識(shí)、了解腦工作原理的神經(jīng)科學(xué)知識(shí)網(wǎng)絡(luò)，并為將來假設(shè)驅(qū)動(dòng)的研究模式提供基礎(chǔ)平臺(tái)，揭示文獻(xiàn)中以前未為人知的多種隱含關(guān)系。
　　 基于浪潮天梭TS10000集群服務(wù)器，采用面向?qū)ο蟮年P(guān)系數(shù)據(jù)庫技術(shù)構(gòu)建整合的、可擴(kuò)展的、用戶化的NILS。數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)選用Oracle 9i，操作系統(tǒng)為Red

4、 Hat Linux 7.3。整個(gè)系統(tǒng)采用Browser/Server架構(gòu)，后臺(tái)程序基于Java進(jìn)行開發(fā)，采用Java Server Page和JavaBean等Java Web應(yīng)用技術(shù)實(shí)現(xiàn)對(duì)數(shù)據(jù)庫的查詢和維護(hù)。在程序設(shè)計(jì)中通過分離表示業(yè)務(wù)，提高系統(tǒng)的可維護(hù)性和可擴(kuò)展性。用戶權(quán)限分級(jí)、查重處理、提交審核、責(zé)任署名和計(jì)量統(tǒng)計(jì)等獨(dú)特的文獻(xiàn)更新子模塊的設(shè)計(jì)確保了系統(tǒng)文獻(xiàn)質(zhì)量。NILS設(shè)置了3種檢索途徑及14種不同的檢索字段，提供邏輯組配檢索及

5、二次循環(huán)檢索，項(xiàng)目可選的檢索結(jié)果展示及輸出功能。系統(tǒng)集成了第三方參考文獻(xiàn)管理軟件EndNote，能夠?qū)z索結(jié)果快速導(dǎo)入到EndNote中，更有利于用戶參考、引用本系統(tǒng)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)。
　　 結(jié)合神經(jīng)影像及腦功能研究的領(lǐng)域特征，設(shè)計(jì)神經(jīng)信息樹型結(jié)構(gòu)索引，用于神經(jīng)信息文獻(xiàn)采集與文獻(xiàn)標(biāo)引，并作為主題瀏覽的分類依據(jù)及用于神經(jīng)信息本體原型構(gòu)建。這一樹型結(jié)構(gòu)目前包括神經(jīng)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)、神經(jīng)生理學(xué)、腦的整合功能、分子神經(jīng)科學(xué)、神經(jīng)系統(tǒng)的起源、遺傳和發(fā)育、