玉米苗期耐鹽性全基因組關聯(lián)分析.pdf

1、玉米是全球最重要的糧食作物之一，鹽脅迫是限制玉米生產(chǎn)的重要非生物逆境脅迫。玉米種質資源中擁有豐富的耐鹽變異，通過挖掘耐鹽種質中優(yōu)異耐鹽基因對研究玉米耐鹽機制以及遺傳改良有著重要作用。本研究主要以368份玉米自交系為研究材料，鑒定苗期耐鹽性，通過全基因組關聯(lián)分析的方法挖掘玉米耐鹽性基因，并將玉米ZmCIPK基因家族作為候選基因進行耐鹽性關聯(lián)分析。主要研究結果如下:
　　1、以耐鹽水平(STL)、鹽脅迫后與正常生長條件下苗期株高比率(

2、SHR)、苗期鮮重比率(SFWR)、苗期干重比率(SDWR)為指標，對368份玉米自交系進行了苗期耐鹽性鑒定，發(fā)現(xiàn)不同自交系系對鹽的耐受性有明顯的差異。進一步將四個指標都完整的269份自交系進行綜合評價，共鑒定出DAN3130、150、CML298、SY3073，GEMS46等25份耐鹽材料;B111、BY4839、CIMBL142、CML426、HZS等25份鹽敏感材料。
　　2、用全基因組關聯(lián)分析方法對玉米苗期耐鹽性進行分析，

3、共檢測到了145個與耐鹽性相關的顯著性位點，包含75個基因，分布在玉米基因組10條染色體。在這些顯著性位點中，10號染色體檢測到了最多的位點，6號染色體次之，9號染色體檢測到的顯著性位點最少。位于3號染色體的基因Gene14，其關聯(lián)信號最強(p=5.12E-07)，同時被SHR和SDWR兩個指標檢測到，在玉米數(shù)據(jù)庫中該基因是一未知基因;位于4號染色體的基因Gene1檢測到了最多的顯著性位點，該基因編碼一個C3HC4型鋅指結構蛋白。

4、>　　3、通過對玉米ZmCIPK基因家族耐鹽性關聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)，在MLM和GLM兩個統(tǒng)計模型p＜0.05水平下，共有14個ZmCIPK基因區(qū)域檢測到了顯著性位點:其中ZmCIPK29基因區(qū)域內(nèi)檢測到了最多的顯著性位點，共有4個顯著性位點。ZmCIPK4、ZmCIPK1和ZmCIPK12基因區(qū)域內(nèi)分別檢測到了3個顯著性位點;在MLM模型p＜0.01的水平下，共有3個ZmCIPK基因（ZmCIPK18、ZmCIPK24-1、ZmCIPK12）區(qū)