14232.用支持向量機和離散增量方法預測人類血液分泌蛋白質_第1頁
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1、分類號——UDC論文題目1012631046017密級——編號——研究生:紅墓指導教師:隆羝亙副熬援專業(yè):塹堡堂研究方向:堡途生塑塑堡堂學院:塹堡型堂皇撞苤堂瞳2013年5月12日內蒙古大學碩士學位論文用支持向量機和離散增量方法預測人類血液分泌蛋白質用支持向量機和離散增量方法預測人類血液分泌蛋白質摘要分泌蛋白質(secretoryprotein)是合成在細胞內的蛋白質,通過各種分泌途徑分泌到細胞外,在生物體中,蛋白質的分泌發(fā)生是一種普遍

2、的生物過程,蛋白質的分泌是生物體保證基本生命活動的重要方式。分泌蛋白質中的一類一一人類血液分泌蛋白質是與癌癥、腫瘤等人類重大疾病相關的,可以用它們來判斷癌癥類型及疾病惡化階段,并用于新藥物的開發(fā)。因此,在生物信息學研究領域,采用有效的方法來確定和預測人類血液分泌蛋白質是至關重要的。由于人類血液中蛋白質組成的復雜性和蛋白質運動范圍的廣泛性,識別人類血液分泌蛋白質非常具有挑戰(zhàn)性。本論文以人類血液分泌蛋白質作為研究對象,采用不同的預測方法,分

3、別對人類血液分泌蛋白質進行了預測研究。論文的主要研究工作如下:1隨著蛋白質數(shù)據(jù)庫的不斷更新,構建了新的人類血液分泌蛋白質數(shù)據(jù)集,擴大了人類血液分泌蛋白質的序列條數(shù)。2利用支持向量機(SVM)、離散增量(ID)和離散增量結合支持向量機(IDSVM)方法,分別對人類血液分泌蛋白質進行預測,均取得了較好的預測效果。3提取了一種新的蛋白質序列特征信息一一平均化學位移信息,并與其它蛋白質序列信息組合,分別作為SVM、ID和IDSVM算法的特征向量

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