棉纖維發(fā)育突變體SSR標(biāo)記定位和遺傳相似性分析.pdf

1、該研究應(yīng)用傳統(tǒng)遺傳學(xué)方法,分析了新纖維發(fā)育突變體GZnn的遺傳方式,確定了GZnn是受一對隱性基因控制的質(zhì)量性狀.并利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)將該光子基因定位到10號染色體上,與已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的光子N<,1>(位于12號染色體),n<,2>(位于26號染色體)所在染色體不一樣,鑒于美國近年新發(fā)現(xiàn)了n<,3>光子基因,故將我們發(fā)現(xiàn)的新的隱性光子基因命名為n<,4>,該光子基因與分子標(biāo)記sloc1緊密連鎖,距離為10.8cM,而距sloc2-1位點為

2、20.4 cM.利用Mapmaker exp/3.0軟件,對TM-1×GZnn的F2代篩選到的22個多態(tài)性SSR等位位點進行連鎖圖譜的構(gòu)建,結(jié)果有12個多態(tài)性SSR等位位點分布到2個連鎖群上,全長198.4 cM,運用winQTLcart 2.0軟件,采用復(fù)合區(qū)間作圖法,對TM-1×GZnn的F2代衣分、子指、纖維長度、整齊度、比強度、伸長率、馬克隆值等7個數(shù)量性狀進行全基因組的QTL掃描,取LOD值為3.0時,分別發(fā)現(xiàn)了一個與子指有關(guān)

3、的微效QTL(SI02)和一個與纖維長度有關(guān)的微效QTL(FL02),可解釋的表型方差變異分別為4.64﹪和0.19﹪,并將FL02和SI02都定位于第12號染色體上.對三組不同纖維發(fā)育突變體的近等基因系,利用SSR分子標(biāo)記技術(shù),進行了分子水平上的多態(tài)性分析及遺傳相似性和聚類分析,并分類構(gòu)建了這些纖維發(fā)育突變體的SSR指紋圖譜.結(jié)果表明新鄉(xiāng)小吉無絮與中棉12的相似系數(shù)是0.471,與豫棉4號的相似系數(shù)是0.587,二者差異明顯達到顯著水

4、平,初步認為新鄉(xiāng)小吉無絮可能來源于豫棉4號;徐州142無絮(XZ142w)和新鄉(xiāng)小吉無絮(Xin)突變體表型變異相同,而且,兩個無絨無絮突變體SSR標(biāo)記的遺傳相似性達90﹪,然而,SSR指紋圖譜表明兩個突變體具有不同的分子特征,可能是由不同的遺傳背景所致;SSR遺傳相似性分析還表明四個近等基因系GZnn、H154、GZNn與TM-1的相互間差異明顯(相似系數(shù)范圍為0.5-0.62),這說明基因顯隱性的突變差異可以導(dǎo)致較大的遺傳差異.兩個

5、隱性纖維發(fā)育突變體H-154與GZnn的相似系數(shù)達到了0.94,這與纖維性狀的表現(xiàn)及其遺傳方式極其符合,這說明具有相同的表現(xiàn)型也具有一定的遺傳相似性.采用NTSYS 1.8數(shù)據(jù)分析軟件對TM-1、GZnn、H-154、GZNn、XZ142w和Xin六個種質(zhì)進行了聚類分析,并繪制品種親緣關(guān)系樹狀圖.在距離為3的時候,這六個種質(zhì)聚為三類:GZNn、H154、GZnn聚為一支,三個品種均表現(xiàn)為無短絨有長纖維,與三者間有共同的血緣相吻合;而同為