水稻長穗頸eui突變體長選3S最上節(jié)間基因表達研究.pdf

1、長選3S是從溫敏核不育系培矮64S群體中選育出來的一種對赤霉素敏感的長穗頸突變體，受一對隱性基因控制。本文以培矮64S為對照，采用水稻基因芯片和半定量RT—PCR技術對長選3S最上節(jié)間快速伸長期全基因組表達模式進行分析，主要結果如下： 1、在具有60000個雜交點，代表36926個單一基因的的寡聚核苷酸基因芯片上，檢測到545個差異表達基因，其中有362個為上調表達的轉錄本，占差異表達基因的66.42％；183個為下調表達的轉錄

2、本，占差異表達基因的33.58％。通過半定量RT—PCR對差異基因做進一步分析，結果與基因芯片結果一致，表明芯片結果中基因表達差異的可靠性高。 2、通過生物信息學分析發(fā)現(xiàn)，這些差異表達的轉錄本包括信號傳導相關基因、膜及運輸基因、細胞生長與凋亡相關基因、復制與修復相關基因、碳水化合物代謝相關基因，次生代謝物合成相關基因和其它功能未知基因。在信號轉導相關基因以及碳水化合物和次生代謝物相關基因中發(fā)現(xiàn)許多與節(jié)間伸長有關的基因。eui基因

3、可能通過影響這些相關基因的表達，實現(xiàn)最上節(jié)間快速伸長。 3、從芯片結果中選擇表達差異達10倍以上的2個基因進行生物信息學分析，表明其為未知功能基因，其啟動子區(qū)存在激素響應元件，可能與激素信號轉導有關。根據(jù)基因序列設計引物，通過RT—PCR擴增，獲得了包含基因完整ORF的cDNA克隆。測序結果表明他們的序列與9311完全相同，而與日本晴存在堿基差異。構建了該基因的過表達載體，并通過農桿菌介導法成功將該基因轉化到擬南芥中，獲得了轉基