TD70-KasalathRIL群體遺傳圖譜構(gòu)建及粒型性狀的QTL定位.pdf

1、水稻粒型性狀是重要的農(nóng)藝性狀，粒型是評價水稻品質(zhì)的重要指標(biāo)之一，也會影響到水稻的產(chǎn)量。因此，研究水稻粒型性狀的遺傳基礎(chǔ)對水稻的高產(chǎn)和優(yōu)質(zhì)育種具有重要的意義。大多數(shù)研究表明水稻的粒型性狀屬于數(shù)量遺傳性狀，通過其分子水平的定位研究，可為水稻粒型相關(guān)性狀的基因克隆提供重要的依據(jù)。
　　 本研究利用特大粒粳稻品種TD70和小粒秈稻品種Kasalath為親本構(gòu)建含240個株系的F7和F8重組自交系群體，在2010年利用F7代群體構(gòu)建一張總

2、長1832.47cM，含141個SSR分子標(biāo)記的水稻全基因組連鎖圖譜。利用該圖譜分別在2010年和2011年對粒長、粒寬、粒厚、長寬比和千粒重等5個性狀進(jìn)行了QTL定位及相關(guān)分析。主要研究結(jié)論如下:
　　 1、兩年間重組自交系內(nèi)粒型性狀間的相關(guān)性類似，RIL群體中，粒長、粒寬、粒厚和粒重4個性狀之間都存在極顯著的正相關(guān)。2010年F7重組自交系群體240個系間千粒重按≦25g，25-30g，30-35g，35-40g，≧40g進(jìn)

3、行分組，并對各組分別進(jìn)行粒型性狀間的相關(guān)分析，得出在不同的千粒重范圍內(nèi)，粒型性狀對千粒重作用的大小順序不同。當(dāng)千粒重≦25g時，粒重的增加主要是靠增加粒長和粒厚，隨著粒重的增加，粒長對粒重的作用逐漸變小，而粒寬和粒厚的作用逐漸增大，尤其當(dāng)千粒重在35g以上時，粒重的增加粒寬和粒厚的效應(yīng)相對比粒長大，尤以粒厚的作用較顯著。
　　 2、對水稻粒型相關(guān)性狀的QTL定位
　　 兩年共檢測到有關(guān)粒長的QTL有5個，分別位于第2、第

4、3和第7染色體上，其中qGL3-1在兩年中都有檢測到，其平均LOD值為30.98，而平均貢獻(xiàn)率為56.19％，效應(yīng)值比較大。qGL2-1、qGL7-1只有在2011年被檢測到，qGL2-2和qGL7-2只有在2010年被檢測到。所有檢測到的粒長有關(guān)的QTL的增效等位基因均來自大粒親本TD70。
　　 與粒寬有關(guān)的QTL兩年總共檢測到6個，其中第2染色體3個，第5染色體2個和第9染色體1個。兩年共同檢測到的QTL有qGW2-1、q

5、GW2-2、qGW5-1和qGW5-2，其平均LOD值分別為3.33、14.32、4.92和5.58，平均貢獻(xiàn)率為4.42％、29.41％、10.37％和7.61％。
　　 7個與粒厚有關(guān)的QTL位點，分別位于第2、第3、第5、第9和第12染色體上，其LOD值在2.93-10.91之間，貢獻(xiàn)率介于5.07％-21.19％之間。兩年都檢測到的只有2個。
　　 qRLW3-1和qRLW5-3兩個QTL位點是兩年都檢測到的有關(guān)

6、長寬比的QTL，其中qRLW3-1的LOD值和貢獻(xiàn)率都比較大，增效等位基因來源于大粒親本TD70，而qRLW5-3的增效等位基因來源于小粒親本Kasalath。另外還有5個與長寬比有關(guān)的QTL位點只在其中的一年里檢測到，分別位于第2、第4和第5染色體上。
　　 定位到與千粒重有關(guān)的QTL有6個，其中第3和第11染色體上各1個，第2和10染色體上2個。在兩年中能穩(wěn)定表達(dá)的有qTGW2-1和qTGW3-1，其平均LOD值為5.38和

7、19.81，貢獻(xiàn)率為11.51％和40.65％。
　　 粒長、粒寬、粒厚、長寬比和千粒重5個性狀兩兩之間大多具有顯著的表型相關(guān)性，相關(guān)性較強的性狀之間具有較多共同或緊密連鎖的QTL。如第2染色體上控制粒長的qGL2-1，控制粒寬的qGW2-2，控制粒厚的qGT2-3，控制長寬比的qRLW2-1和控制千粒重的qTGW2-1都位于RM1347-RM5699區(qū)間內(nèi);第3染色體上的qGL3-1、qGT3-1、qRLW3-1和qTGW3-