核磁處理軟件使用說明

1、Mestre－C WINNMR,核磁處理軟件,核磁數(shù)據(jù)處理軟件 有：NUTS、MestRe-C、Gifa等； NUTS可以處理一維及二維核磁數(shù)據(jù)，其功能包括付立葉變換、相位校正、差譜、模擬譜、勻場(chǎng)練習(xí)等幾乎所有核磁儀器操作軟件的功能；其演示版在http://www.acornnmr.com下載,MestRe-C為處理一維二維核磁數(shù)據(jù)的免費(fèi)軟件，功能完善。其最新版本為2.3，有興趣可在http://qobrue.u

2、sc.es/jsgroup/MestRe-C/MestRe-C.html處查看有關(guān)信息即下載；或所內(nèi)網(wǎng)站上下載；Gifa可以處理一至三維核磁數(shù)據(jù)，為運(yùn)行在LINUX操作系統(tǒng)中X-Window上的免費(fèi)軟件，有關(guān)信息可查看http://www.cbs.univ?montp1.fr/GIFA,核磁處理軟件,Mestre－C,軟件安裝,從ftp上下載軟件，安裝完畢后，將crack軟件解壓縮后將其拷貝到安裝程序所在文件夾，覆蓋原文件即可,獲取

3、核磁數(shù)據(jù),軟件本身帶有一個(gè)ftp客戶端軟件可以從網(wǎng)絡(luò)下載數(shù)據(jù),打開已經(jīng)下載的數(shù)據(jù),軟件可以自動(dòng)識(shí)別核磁數(shù)據(jù)的格式（不同儀器產(chǎn)生的數(shù)據(jù)格式不同）對(duì)于所有的儀器，原始的核磁數(shù)據(jù)文件名為fid對(duì)于bruker儀器產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，因其可以保存處理好的數(shù)據(jù)，可由Mestre-C軟件直接打開，文件名1D為 1r，2D為 2rr,核磁數(shù)據(jù)的目錄結(jié)構(gòu),Bruker儀器：文件名\編號(hào)\，原始數(shù)據(jù)存儲(chǔ)在這個(gè)文件夾中File\open\文件所存盤\文件

4、名\樣品編號(hào)\pdata\處理編號(hào)\文件類型(all files)\文件名1D為 1r，2D為 2rr ，處理過的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)在這個(gè)文件夾中,一維數(shù)據(jù)處理的步驟,打開原始數(shù)據(jù)文件fid文件，是一個(gè)遞減的波形文件進(jìn)行傅立葉變換，設(shè)置參數(shù)，最重要的是set functions中的第一個(gè)參數(shù)（窗函數(shù)）調(diào)整相位基線校正積分，定標(biāo)，標(biāo)記化學(xué)位移等,譜圖處理－設(shè)置窗函數(shù),單擊ft按鈕，在對(duì)話框中點(diǎn)擊set function(s)在打開的對(duì)話

5、框中，修改exponentia的值缺省是0.5Hz，增加此項(xiàng)數(shù)值將會(huì)是峰型變寬，但可消除裂分,相位校正,可選擇自動(dòng)相位校正如果效果不好，可使用手動(dòng)校正點(diǎn)擊手動(dòng)相位校正按鈕在對(duì)話框中點(diǎn)擊biggest按鈕在對(duì)話框中間部分按住鼠標(biāo)左鍵，調(diào)整最高峰附近的峰的相位在對(duì)話框中間部分按住鼠標(biāo)右鍵，調(diào)整遠(yuǎn)離最高峰的其他峰的相位調(diào)到峰行對(duì)稱,基線校正,點(diǎn)擊工具按鈕上基線校正按鈕，在菜單中選擇full auto即可,核磁畫圖,可以不做以上操

6、作直接進(jìn)入圖譜按以下操作進(jìn)行圖譜處理。,１Ｄ處理　　標(biāo)記峰　　定標(biāo)　　積分　　譜圖顯示２Ｄ處理,標(biāo)記峰,找出變換好的圖譜路徑如下：File\open\文件所存盤\文件名\樣品編號(hào)\pdata\文件類型（所有文件all files）\文件名1D為 1r，2D為 2rr1D點(diǎn)擊Peak Picking按鈕，使用鼠標(biāo)在譜圖中進(jìn)行標(biāo)記,點(diǎn)擊Peak Picking按鈕，使用鼠標(biāo)選中（框?。┰谧V圖中進(jìn)行標(biāo)記,化學(xué)位移保留小數(shù)點(diǎn)后３

7、－５位：options/properties/peak pick/decimal,,定標(biāo),如果化學(xué)位移出現(xiàn)偏差，可使用工具條上標(biāo)有TMS的按鈕進(jìn)行定標(biāo)：?jiǎn)螕鬞MS按鈕，鼠標(biāo)指針變?yōu)槭中驮跇?biāo)準(zhǔn)峰上單擊鼠標(biāo)在彈出的對(duì)話框中輸入化學(xué)位移值,積分,點(diǎn)擊積分按鈕，使用鼠標(biāo)進(jìn)行積分可使用自動(dòng)積分積分值可以到出到文件,點(diǎn)擊積分按鈕，按住鼠標(biāo)左鍵拉動(dòng)進(jìn)行積分,用鼠標(biāo)雙擊某一積分面積跳出對(duì)話框把它定為1對(duì)積分面積進(jìn)行調(diào)整，后copy到wo

8、rd,鼠標(biāo)拉倒邊框處，點(diǎn)右鍵對(duì)邊框進(jìn)行調(diào)整,,,譜圖顯示,可使用工具按鈕上有關(guān)譜圖顯示的按鈕進(jìn)行譜圖放大，縮小等操作,Mestre-C有關(guān)參數(shù)的設(shè)置,窗口背景，options－》seting譜圖參數(shù)，options－》properties找出變換好的圖譜路徑如下：File\open\文件所存盤\文件名\樣品編號(hào)\pdata\文件類型（所有文件all files）\文件名1D為 1r，2D為 2rr,2D 處理,2D粘貼1D：從上

9、面圖標(biāo)上點(diǎn)擊setup 1D Traces 再?gòu)奶龅膶?duì)話框中點(diǎn)擊lead from disk選擇1D查找范圍，樣品所在，樣品名，圖譜編號(hào)pdat/1r雙擊。,調(diào)整1d：如圖按左邊對(duì)話進(jìn)行調(diào)整。,,2D校正：advance/ shift spectrum vector/ points to 增減。添加方框線：options/ setting/ gride.選為黑色,畫圖：選擇從上面圖標(biāo)上點(diǎn)擊紅色

10、方框，再?gòu)奶龅膶?duì)話框中點(diǎn)擊紅色方框圖旁邊的第二個(gè)圓圈圖。,,2D去邊框：　　粘貼好1D后，選中1D上邊（或左邊），點(diǎn)擊鼠標(biāo)右鍵/properties/set/none/ok/apply/ok,,,,NOESY, QC需要照以下路徑操作：　　界面左邊lev/negative 調(diào)為０（＋／－）2D去邊框：　　粘貼好1D后，選中1D上邊（或左邊），點(diǎn)擊鼠標(biāo)右鍵/properties/set/none/ok/apply/ok,C 和

11、DEPT,依次打開C和 DEPT；將C譜取峰，校正，確定C譜范圍；將DEPT打開，并確定成與C譜相同范圍將C譜復(fù)制edit/copy spectrum在打開的DEPT中將復(fù)制的C譜粘貼在工具欄stack隨后通過工具欄“左右居”中將兩張譜對(duì)齊以下操作類推即可，此時(shí)需用edit/select all spectrum 工具選擇所用圖譜，然后再copy,核磁處理軟件,WINNMR,網(wǎng)絡(luò)版WINNMR軟件,從ftp上下載該軟件在

12、安裝界面中選擇安裝：WINNMR 1D：1D Post processingWINNMR 2D：2D Post processingWIBu key 2.52asoftware protection 安裝完后在c:\windows\d2nmr.init中加入[settings]Network=1Nethasp=1,網(wǎng)絡(luò)版WINNMR軟件,此軟件對(duì)1D譜放大及DEPT畫圖較好。找出變換好的圖譜路徑如下：File\op

13、en\文件所存盤\文件名\樣品編號(hào)\1D為1r，2D為 2rr點(diǎn)開1D點(diǎn)擊Peak Picking按鈕，使用鼠標(biāo)在譜圖中進(jìn)行標(biāo)記添加圖譜參數(shù)output/acpu從里面選擇所需參數(shù)/show select/ok,標(biāo)記峰圖譜路徑如下analysis/peapking/pc/ok;點(diǎn)擊＊２／２對(duì)圖譜調(diào)整添加圖譜參數(shù)output/acpu從里面選擇所需參數(shù)。,,analysis/peak picking/pc/ok/mouse pp框出

14、所 需的峰/returnanalysis/Calibration/calibraic/returnanalysis/integration/點(diǎn)擊積分按鈕，使用鼠標(biāo)左鍵右鍵把光標(biāo)放到最小的峰上進(jìn)行積分//return/yes打印output/printer set up/set up/布局/橫向/確定/ok (此設(shè)置好后即可）,標(biāo)峰、校準(zhǔn)及積分路徑如下:,調(diào)整圖譜,點(diǎn)擊左邊preview鼠標(biāo)左鍵選中圖譜，向左拉動(dòng)右邊

15、邊框，再用鼠標(biāo)左鍵選中參數(shù)欄，將其拖到圖譜右邊。鼠標(biāo)左鍵選中圖譜，向上下、左右拉動(dòng)邊框，用鼠標(biāo)點(diǎn)擊*2/2調(diào)整圖譜峰高。,打印: 點(diǎn)擊preview/yes 選中參數(shù)把參數(shù)拖到適當(dāng)位置print or edit/copy到word，點(diǎn)擊界面左上角nmr zoom 進(jìn)行放大,,C 和DEPT,按照氫譜做法打開碳譜，進(jìn)行校準(zhǔn)標(biāo)峰后點(diǎn)擊preview雙擊鼠標(biāo)左鍵跳出對(duì)話框把xstar和Xstop化學(xué)位移固定，把顏色改為黑色點(diǎn)擊ok，再fi

16、le/save metafile/確定/yes儲(chǔ)存，return。照上述操作打開dept/preview/調(diào)整圖譜放在中間，刪除參數(shù)，雙擊取消axis、fram ，選定star、stop/ok/在file/open metafile/確定 調(diào)整13C/save metafile/確定/yes,File\open\文件所存盤\文件名\碳譜編號(hào)\1r analysis/peak picking/pc/ok/mouse pp框出所需的峰/

17、,點(diǎn)擊preview雙擊鼠標(biāo)左鍵跳出對(duì)話框把xstar和xstop化學(xué)位移固定,,固定譜寬化學(xué)位移,,鼠標(biāo)左鍵選中圖譜，向左拉動(dòng)右邊邊框，再用鼠標(biāo)左鍵選中參數(shù)欄，將其拖到圖譜右邊。鼠標(biāo)左鍵選中圖譜，向下拉動(dòng)上邊邊框，縮小到頁面1/3處，用鼠標(biāo)點(diǎn)擊*2/2調(diào)整圖譜峰高。,鼠標(biāo),,,,,照上述操作打開dept/preview/調(diào)整圖譜放在中間，刪除參數(shù)，雙擊取消axis、fram ，選定star、stop固定化學(xué)位移/ok/在file/op

18、en metafile/確定 調(diào)整dept/save metafile/確定/yes,*2/2調(diào)整譜峰度,拉大、縮小邊框,,,,選中取消,,,照上述操作打開dept135/preview重復(fù)上述操作/open metafile/確定 調(diào)整13C/print or copy到,2D處理,找出變換好的圖譜路徑如下：File\open\文件所存盤\文件名\樣品編號(hào)\2rr粘貼1r圖譜路徑如下：Utilities/f1-axis ext/

19、 文件所存盤/文件名/樣品編號(hào)/pdata處理編號(hào)/文件類型(all files)/1r/acceptUtilities/f2-axis ext/ 文件所存盤/文件名/樣品編號(hào)/pdata處理編號(hào)/文件類型(all files)/1r/accept,可以拉大邊框?qū)D譜大小調(diào)整，拉后要選中上邊和左邊的1d調(diào)整，點(diǎn)擊右面automatic factor改為2調(diào)整畫面。,,放大圖譜只要用鼠標(biāo)框中2d在點(diǎn)擊鼠標(biāo)左右鍵,然后分別用鼠標(biāo)點(diǎn)擊上邊

20、和左邊的1d調(diào)整，通過點(diǎn)擊一邊把一邊變?yōu)榛疑?，另一邊變?yōu)樗{(lán)色進(jìn)行調(diào)整（灰色不變，藍(lán)色變）。,,打印要把右面colors設(shè)置為黑色,,對(duì)于2d(hsqc、roesy)需要點(diǎn)擊左上角＋/－對(duì)正負(fù)面選擇恰當(dāng)?shù)囊幻孢M(jìn)行處理。下圖為點(diǎn)擊＋/－前,,處理前圖譜不理想，處理后較好圖譜，下圖為點(diǎn)擊＋/－后,,打印設(shè)置,要把打印output/printer set up/set up/布局/橫向/確定/ok (一此設(shè)置好后即可）或者在preview里