中國沿海真帽貝分類及美女蛤隱存種研究.pdf

1、本文分為三部分進(jìn)行了論述：
　　第一部分中國沿海真帽貝形態(tài)學(xué)研究
　　真帽貝，即Patellogastropoda目的帽貝，隸屬于軟體動(dòng)物門(Mollusca)、腹足綱(Gastropoda)，廣泛分布于世界各地的海洋沿岸的巖石潮間帶，深海中亦有分布。本研究對(duì)采自中國沿海的真帽貝樣品進(jìn)行了基于貝殼的形態(tài)學(xué)鑒定，描述了每個(gè)種的貝殼特征，主要包括貝殼的基本參數(shù)、形狀、顏色、殼表的紋理等，并記錄了每一種真帽貝的拉丁學(xué)名、采集地。最

2、終，所有樣品被鑒定到2個(gè)科（笠貝科、花帽貝科），4個(gè)屬（Lottia、Patelloida、Nipponacmea、Cellana），其中鑒定到種水平的共有11個(gè)種，只鑒定到屬水平的有2個(gè)種。
　　第二部分基于COⅠ基因的中國沿海真帽貝DNA條形碼研究
　　目前，根據(jù)形態(tài)特征鑒定真帽貝種存在著不確定性和復(fù)雜性。采用更加有效和準(zhǔn)確的物種鑒定方法來鑒定真帽貝這種普遍的，小型的，殼多變的海洋軟體動(dòng)物就顯得非常的必要。DNA條形碼技

3、術(shù)是一門高效的，非常有用的物種鑒定工具。這種技術(shù)將能夠?yàn)檎婷必惖淖R(shí)別和鑒定效率帶來顯著的提高。本研究中，我們利用線粒體細(xì)胞色素c氧化酶亞單位Ⅰ(COⅠ)基因序列上的一個(gè)片段作為DNA條形碼來評(píng)估DNA條形碼技術(shù)用于鑒定和區(qū)分真帽貝物種的可行性。135條COⅠ序列來源于中國沿海的花帽貝科和笠貝科的13個(gè)種。這些序列經(jīng)過拼接比對(duì)之后的分析結(jié)果表明真帽貝的線粒體COⅠ基因序列中存在堿基插入現(xiàn)象。13個(gè)種種內(nèi)的以及4個(gè)屬屬內(nèi)不同種間的基于Kim

4、ura雙參數(shù)模型計(jì)算的遺傳距離的平均值分別為0.03％-0.21％（最大值1.01％），18.96％-31.30％(最大值37.80％)，它們之間存在一條明顯的條形碼間隙。所有的種都能夠在每種系統(tǒng)樹中以較高的支持度被明顯的區(qū)分出來。基于特征的條形碼分析法能夠?qū)⑺械恼婷必惙N成功鑒定出，在屬水平的鑒別上也發(fā)揮了很好的作用。本研究的結(jié)果證明了基于COⅠ基因的DNA條形碼技術(shù)能夠快速而準(zhǔn)確的鑒定真帽貝的物種。
　　第三部分基于COⅠ基因

5、的南中國海美女蛤隱存多樣性研究
　　該研究以南中國海的海南陵水、海南臨高、海南三亞、廣東陽江、廣西北海5個(gè)海域共89個(gè)美女蛤樣品作為研究對(duì)象，通過對(duì)線粒體DNA(MitochondrialDNA)的COⅠ基因序列的分析對(duì)美女蛤進(jìn)行了隱存種的探究。經(jīng)過PCR擴(kuò)增與測(cè)序，以及對(duì)所得序列進(jìn)行比對(duì)校正后，獲得COⅠ基因片段序列長590bp，檢測(cè)到87個(gè)變異位點(diǎn)，其中有46個(gè)簡約信息位點(diǎn)，核苷酸多樣性為0.02729。89條序列共定義25個(gè)

6、單倍型，單倍型多樣性為0.843。單倍型Hap7可能是由雜交引起的，排除此單倍型，遺傳距離和系統(tǒng)進(jìn)化樹都顯示美女蛤分為3個(gè)進(jìn)化支，其中進(jìn)化支3僅有一個(gè)單倍型Hap25，進(jìn)化支間遺傳距離為3.67％-8.55％，遠(yuǎn)大于進(jìn)化支內(nèi)最大遺傳距離0.85％。并且，運(yùn)用特征法分析的結(jié)果顯示進(jìn)化支1、2、3的特征堿基數(shù)分別為17，16，24個(gè)，也與距離法和單系法的分析結(jié)果一致。本研究表明，基于COⅠ的DNA條形碼技術(shù)能夠運(yùn)用于美女蛤隱存種的探究，三種