直突搖蚊亞科高級(jí)階元的分子系統(tǒng)學(xué)研究(雙翅目-搖蚊科).pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、直突搖蚊亞科是搖蚊科中最大的一個(gè)亞科,迄今已記錄12個(gè)屬群的132屬。同時(shí)被國(guó)際搖蚊學(xué)界公認(rèn)為是系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系最復(fù)雜的分類單元。該亞科與搖蚊科已知其它10個(gè)亞科之間的系統(tǒng)學(xué)關(guān)系以及亞科內(nèi)基于形態(tài)學(xué)劃分初步確定的12個(gè)屬群是否為單系群、屬群之間以及屬群內(nèi)各屬之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系長(zhǎng)期以來(lái)一直是一個(gè)懸而未決而且爭(zhēng)議頗多的難題。本研究首次應(yīng)用分子生物學(xué)技術(shù)手段,對(duì)直突搖蚊亞科高級(jí)分類階元進(jìn)行了系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的分析研究,論文分為四個(gè)部分:
  

2、 第一部分總論:對(duì)搖蚊科及直突搖蚊亞科的分類學(xué)和系統(tǒng)發(fā)育研究的歷史及現(xiàn)狀進(jìn)行了簡(jiǎn)單的回顧,并對(duì)其中相關(guān)的系統(tǒng)發(fā)育研究工作進(jìn)行了總結(jié)。同時(shí)還簡(jiǎn)要的介紹了分子系統(tǒng)學(xué)研究方法,研究現(xiàn)狀,建樹(shù)方法,線粒體基因與核基因在昆蟲(chóng)中的應(yīng)用,總結(jié)了搖蚊科分子系統(tǒng)學(xué)研究的概況。
   第二部分:系統(tǒng)闡述了取樣原則和方法步驟。具體介紹了研究過(guò)程中標(biāo)本采集,鑒定,試驗(yàn)方法,設(shè)備型號(hào),分析軟件,運(yùn)算過(guò)程與參數(shù)等實(shí)驗(yàn)步驟。
   第三部分:用PCR

3、產(chǎn)物直接測(cè)序法測(cè)定了直突搖蚊亞科及外群33屬39種線粒體基因COII和16SrRNA、核基因28SrDNA的部分片段序列,使用ClustalX1.83進(jìn)行序列比對(duì),MEGA4.1進(jìn)行序列組成分析,按照線粒體基因、核基因、核基因之間聯(lián)合、線粒體與核基因之間聯(lián)合分別組成單基因及聯(lián)合數(shù)據(jù)集。在PAUP*4.0中采用NJ法、MP法、ML法以及在Mrbayes V3.1.2中的貝葉斯系統(tǒng)發(fā)育推論法構(gòu)建了直突搖蚊亞科高級(jí)階元系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,得出以下結(jié)

4、論:
   1.線粒體基因COII及16S rRNA具有昆蟲(chóng)線粒體所具有的高A+T含量,分別為69.8%,和78.4%;COII的變異位點(diǎn)數(shù)目最多,16SrRNA的次之,而核28SrDNA最保守,其A T含量與線粒體基因之間存在著明顯的區(qū)別。
   2.數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示:COII的第三位點(diǎn)在分類單元間存在堿基組成偏向性;16SrRNA及COII的第三位點(diǎn)存在堿基替換飽和現(xiàn)象;PTP檢驗(yàn)揭示四個(gè)數(shù)據(jù)集及其聯(lián)合數(shù)據(jù)集都含有顯

5、著區(qū)別于隨機(jī)信號(hào)的系統(tǒng)發(fā)育信息;ILD檢驗(yàn)顯示核基因間不存在異質(zhì)性,其它聯(lián)合數(shù)據(jù)集之間存在異質(zhì)性。
   3.采用四種方法對(duì)四個(gè)數(shù)據(jù)集以及各聯(lián)合數(shù)據(jù)集分別構(gòu)建MP,ML,NJ,BI樹(shù),比較它們之間的差異,結(jié)果表明聯(lián)合數(shù)據(jù)集四種樹(shù)解析力在解釋一些屬群關(guān)系方面優(yōu)于單基因建樹(shù),而且核基因與線粒體聯(lián)合要優(yōu)于核基因聯(lián)合樹(shù),四個(gè)基因片段聯(lián)合ML樹(shù)和BI樹(shù)優(yōu)于MP樹(shù)和NJ樹(shù)。分析認(rèn)為基因聯(lián)合可以增加樹(shù)的解析力,進(jìn)而推測(cè)單個(gè)基因數(shù)據(jù)存在的系統(tǒng)發(fā)

6、育噪音如堿基偏向性,堿基替換飽和,以及基因間的不相合因素可能在聯(lián)合建樹(shù)時(shí)彼此消長(zhǎng)從而提高了樹(shù)的穩(wěn)健性。
   4.基于分子數(shù)據(jù)構(gòu)建的直突搖蚊亞科內(nèi)類群間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
   ①裸須搖蚊屬為較早分化出來(lái)的類群,解釋了該屬在該亞科中的原始性。
   ②棒脈一真開(kāi)氏搖蚊屬群較早被分出,支持依據(jù)形態(tài)特征得到的該屬群是一個(gè)單系的推論,也解釋了在形態(tài)上它們具有相似的一些近祖特征,它們之間的關(guān)系為((心突搖蚊屬,真開(kāi)氏搖蚊屬)雅

7、明搖蚊屬)(棒脈搖蚊屬,提尼曼搖蚊屬))。
   ③環(huán)足搖蚊復(fù)合體得到很好的支持,它們的關(guān)系為((((環(huán)足搖蚊屬,擬毛突搖蚊屬)齒搖蚊屬)擬突搖蚊屬)(流環(huán)足搖蚊屬,刀突搖蚊屬))構(gòu)成環(huán)足搖蚊屬?gòu)?fù)合體:但是沒(méi)有與直突搖蚊屬形成環(huán)足一直突搖蚊屬群,由于研究所取的直突種類有限,我們的結(jié)論有待于進(jìn)一步尋求更多,更充分的證據(jù)。
   ④((陸直突搖蚊屬,偽直突搖蚊屬)擬毛突搖蚊屬)構(gòu)成偽直突搖蚊屬群;(擬開(kāi)氏搖蚊屬,克萊施密搖蚊

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