過氧化氫酶和葡萄糖氧化酶雙酶連接的分子動力學研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、過氧化氫酶和葡萄糖氧化酶(GOD)在實驗中被共固定在同一材料上發(fā)揮催化作用，因為CAT能夠催化分解GOD催化過程中生成的對細胞有害的過氧化氫。本實驗中擬采用分子動力學模擬手段，通過連接肽將CAT和GOD構(gòu)建成連接酶，使連接酶能夠同時催化兩種底物（β-D-葡萄糖和過氧化氫）。主要進行了以下研究:
　　 根據(jù)實驗條件，對CAT、GOD進行殘基補全和質(zhì)子化狀態(tài)等預(yù)處理。通過連接肽，以共價鍵將CAT和GOD構(gòu)建成連接酶的初始構(gòu)象，分別記

2、為cat-ljt-god。利用Autodock將β-D-葡萄糖分別對接在GOD的活性中心。
　　 利用Gromacs4.5.4軟件，在gromos9653A6力場下，對游離的CAT、GOD以及連接酶構(gòu)象cat-ljt-god在水中進行了分子動力學模擬。通對比游離CAT、GOD和連接酶中CAT、GOD的模擬結(jié)果，結(jié)果發(fā)現(xiàn)CAT和GOD連接后，質(zhì)心距離減小，相互作用加強，CAT和GOD之間的殘基的相互作用致使連接酶中CAT、GOD的

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