大熊貓臥龍圈養(yǎng)種群親子鑒定及種群奠基者效應(yīng)研究.pdf

1、大熊貓(Ailuropoda melanoleuca)是我國特有的珍稀瀕危動物和國家I級重點保護(hù)的野生動物。我國從1953年開始了大熊貓的人工飼養(yǎng)工作，至2007年底，全世界圈養(yǎng)大熊貓總數(shù)為242只。為了了解圈養(yǎng)種群的現(xiàn)有遺傳結(jié)構(gòu)以及奠基者基因在現(xiàn)有圈養(yǎng)種群中的傳遞和分布情況，本文以國內(nèi)最大的大熊貓圈養(yǎng)種群一四川臥龍中國保護(hù)大熊貓研究中心的101只個體(野外出生：22；圈養(yǎng)出生：79)為研究對象，采用7個微衛(wèi)星位點和4個主要組織相容性復(fù)

2、合體(MHC)座位，檢測圈養(yǎng)種群中等位基因的多樣性及分布頻率，分析該種群受到奠基者效應(yīng)影響的情況。主要研究結(jié)果如下：
　　 (1)采用7個微衛(wèi)星DNA位點(Aime-3、Aime-5、Aime-10、Aime-11、Aime-13、Aime-14)進(jìn)行群體檢測所獲得的相關(guān)參數(shù)如下：等位基因數(shù)量的均值為8.3(4-12)，且各位點多態(tài)信息含量(PIC)的均值為0.746(0.614-0.879)，表明種群具有較高的遺傳多態(tài)性。與

3、此同時，各位點的累計個體識別率(DP)和親子鑒定概率分別達(dá)到了100％和99.99％，表明利用本文所選用的7個微衛(wèi)星位點，可無誤地識別臥龍中國保護(hù)大熊貓研究中心的每一只大熊貓個體，并進(jìn)行可靠的親子鑒定。
　　 (2)利用上述7個多態(tài)性微衛(wèi)星位點，對臥龍中國保護(hù)大熊貓研究中心的圈養(yǎng)大熊貓進(jìn)行了親子鑒定，確定了24只個體的最大可能父本，置信度達(dá)到了95％，解決了種群譜系構(gòu)建中的關(guān)鍵技術(shù)問題。
　　 (3)根據(jù)本文的親子鑒定結(jié)

4、果，以及2007年的大熊貓譜系，構(gòu)建了臥龍中國保護(hù)大熊貓研究中心圈養(yǎng)大熊貓的譜系關(guān)系。據(jù)譜系關(guān)系可知，該種群的總奠基者數(shù)目雖為24只，但奠基者的貢獻(xiàn)率卻嚴(yán)重不均等，如譜系號為308()的這只大熊貓，總共有多達(dá)58只后代，占種群后代總數(shù)的近50％，而有另外3只奠基者，其后代則僅為1只。鑒此，本文建議在對優(yōu)勢奠基者的后代繁殖數(shù)量加以限制的同時，迅速提高弱勢奠基者后代的繁殖成功率，從而盡量使奠基者的遺傳基因能夠在種群中得以均衡分布，達(dá)到最大限

5、度地保存奠基者遺傳基因的目標(biāo)。
　　 (4)7個微衛(wèi)星位點在種群的野生個體(n=22)和圈養(yǎng)個體(n=79)中，都發(fā)現(xiàn)了58個等位基因，平均等位基因數(shù)8.3個，未發(fā)現(xiàn)等位基因丟失現(xiàn)象，但經(jīng)過20多年的繁殖，圈養(yǎng)種群中奠基者等位基因的分布頻率已經(jīng)發(fā)生了偏移，出現(xiàn)了兩極分化現(xiàn)象。近交系數(shù)顯示，有4只F2代個體為近親繁殖的后代，且其中的2只個體的父母，均是308()的后代。由此表明了早期有效種群數(shù)少，且奠基者貢獻(xiàn)率的不均衡，已帶來了種

6、群遺傳結(jié)構(gòu)不合理的問題。建議進(jìn)一步完善圈養(yǎng)大熊貓的遺傳管理譜系，并科學(xué)地制定年度的繁殖配對計劃。
　　 (5)4個II類MHC基因的多態(tài)座位(DQA1、DQA2、DQB1、DRB3)在種群的野生個體(n=22)中共發(fā)現(xiàn)了23個等位基因，但在圈養(yǎng)的奠基個體(n=24)和整個圈養(yǎng)個體(n=79)中，僅分別發(fā)現(xiàn)了19個和18個等位基因。此結(jié)果與微衛(wèi)星結(jié)果的不同之處在于：圈養(yǎng)種群在短期內(nèi)便出現(xiàn)了嚴(yán)重的MHC等位基因丟失的情況。