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文檔簡介
1、食性轉(zhuǎn)換期是大熊貓一生中的重要時期。圈養(yǎng)條件下,10月齡左右的亞成年大熊貓進入食性轉(zhuǎn)換期,該階段是大熊貓由高蛋白飲食(如母乳或牛奶等)向以竹類等高纖維素食物為主食的轉(zhuǎn)化過程。一些研究已證明食物的轉(zhuǎn)換會影響腸道微生物的組成以及宿主的抵抗力,并且大熊貓腸道菌群在降解含高纖維素的竹子中扮演了重要的角色。
為了探究圈養(yǎng)大熊貓食性轉(zhuǎn)換期腸道菌群的多樣性,本實驗采用ERIC-PCR指紋圖譜技術(shù)篩選出腸道菌群多樣性高的樣品,并對篩選出來的樣
2、品構(gòu)建16SrDNA克隆文庫,采用限制性內(nèi)切酶HinfⅠ和MspⅠ對其進行RFLP(RestrictionFragment Length Polymorphism)及測序分析。研究結(jié)果如下:
1.對3只大熊貓在食性轉(zhuǎn)換期的糞便細菌總DNA進行ERIC-PCR指紋圖譜分析,通過圖譜相似性及多樣性篩選出多樣性較高的樣品(F6、F7、G8、J9、G10、J11、J12)。
2.通過構(gòu)建食性轉(zhuǎn)換期大熊貓腸道菌群的克隆文庫及對
3、文庫進行RFLP分析,共獲得787個陽性克隆子,產(chǎn)生224個OTUs。構(gòu)建的文庫覆蓋率都大于78.5%,說明所構(gòu)建的克隆文庫具有良好的代表性。Shannon index(H'),Simpsonindex(1/D),SChaol(S)三個多樣性指數(shù)都表明食性轉(zhuǎn)換期大熊貓腸道菌群多樣性豐富,且食性轉(zhuǎn)換前期和食性轉(zhuǎn)換后期大熊貓腸道菌群的多樣性高于食性轉(zhuǎn)換中期。
3.16S rDNA序列分析發(fā)現(xiàn)食性轉(zhuǎn)換期大熊貓腸道菌群歸為硬壁菌門、變
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