二倍體棉中富含甘氨酸RBP家族的鑒定及進化和表達分析.pdf

1、富含甘氨酸RNA結(jié)合蛋白家族是屬于GRP超家族的第四個亞族。它廣泛存在于各種植物中，并且在植物的生長發(fā)育以及應(yīng)答非生物脅迫方面都起到重要的作用。棉花是重要的經(jīng)濟作物，其纖維是紡織工業(yè)的天然原材料。但是在目前的研究中，棉花RB-GRP家族基因的功能仍然未知。本研究在基因組水平上鑒定該基因家族，分析其基因進化歷史，為進一步研究該蛋白的功能奠定了基礎(chǔ)。并且探明該蛋白對棉花的抗逆性以及在生長發(fā)育過程中的作用機制可為改良棉纖維品質(zhì)，培育出優(yōu)良的棉

2、花品種提供堅實的理論依據(jù)。
　　本研究分別通過生物信息學(xué)、分子生物學(xué)方法對二倍體棉RB-GRP家族基因進行鑒定，進化和表達分析。主要研究結(jié)果如下：⑴從亞洲棉基因組和雷蒙德氏棉基因組中分別鑒別出37和32個RB-GRP家族基因。⑵對這兩個棉屬物種RB-GRP家族基因進行同線性分析發(fā)現(xiàn)片段重復(fù)和串聯(lián)重復(fù)是導(dǎo)致該家族基因擴張的主要原因。⑶亞洲棉和雷蒙德氏棉RB-GRP基因中的串聯(lián)重復(fù)基因位于相應(yīng)的共線模塊中表明這些基因共享一個祖先基因。

3、⑷對亞洲棉和雷蒙德氏棉RB-GRP家族的直系同源基因的選擇壓力分析表明大多數(shù)棉花RB-GRP基因經(jīng)歷了強烈的負向選擇壓力。⑸亞洲棉和雷蒙德氏棉RB-GRP基因在不同非生物脅迫下的表達結(jié)果分析表明它們響應(yīng)植物的ABA脅迫，鹽脅迫和PEG脅迫，并且是通過調(diào)控自身的表達量來賦予植物抗逆性。⑹綜上所述，本研究從亞洲棉和雷蒙德氏棉基因組中分別鑒別出了37和32個RB-GRP基因。片段重復(fù)和串聯(lián)重復(fù)是導(dǎo)致該家族基因擴張的主要機制。二倍體棉中RB-G