中國人體小腸黏膜細(xì)菌微生態(tài)研究.pdf

1、隨著不依賴于培養(yǎng)方法的分子技術(shù)的發(fā)展及其在微生物研究領(lǐng)域的應(yīng)用，我們對(duì)人體胃腸道內(nèi)菌群多樣性的了解越來越深入。很多研究結(jié)果表明腸道菌群與人體健康和疾病狀態(tài)密切相關(guān)。然而大部分這些研究結(jié)果都是基于以大腸或者糞便為標(biāo)本獲得。人體小腸根據(jù)其解剖和生理功能特性可被分為十二指腸、空腸和回腸三個(gè)節(jié)段。小腸是人體進(jìn)行消化、吸收等生理活動(dòng)的重要場(chǎng)所，人體所需的幾乎全部能量和營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)均有小腸提供。因此，棲居在小腸內(nèi)的微生物菌群可能對(duì)人體的很多生理過程有著

2、重要影響，如免疫、代謝和內(nèi)分泌等功能。特殊的解剖位置導(dǎo)致小腸樣本取樣困難，僅有少數(shù)研究對(duì)小腸內(nèi)菌群分布多樣性等進(jìn)行研究，且樣本量小。目前，我們對(duì)小腸內(nèi)菌群的了解還極為有限，尤其是健康狀態(tài)下小腸黏膜菌群的數(shù)據(jù)幾乎還是空白。
　　在上述研究背景下，我們利用16sRNA測(cè)序技術(shù)對(duì)15例器官捐獻(xiàn)者的小腸黏膜菌群進(jìn)行分析。該15例捐獻(xiàn)者死因?yàn)槟X外傷或者腦血管意外，且生前健康狀況良好，其黏膜標(biāo)本于捐獻(xiàn)者死亡后幾分鐘內(nèi)摘取器官過程中獲取。提取黏

3、膜組織菌群的總DNA后進(jìn)行Misqec測(cè)序。利用生物信息學(xué)軟件對(duì)獲得的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，揭示人體空腸上段、交界和回腸三個(gè)部位黏膜的菌群分布及多樣性。
　　本研究發(fā)現(xiàn)小腸黏膜菌群數(shù)量分布從近端小腸到遠(yuǎn)端小腸逐步增加，其黏膜菌群的構(gòu)成主要由變形菌門，厚壁菌門，放線菌門和擬桿菌門構(gòu)成，其中變形菌門在小腸黏膜菌群中的豐度最高。我們的結(jié)果表明空腸和回腸黏膜菌群多樣性存在著差異，與交界處無明顯不同，這種差異主要表現(xiàn)需氧的放線菌門在回腸黏膜的豐度明

4、顯降低。在屬水平，對(duì)小腸黏膜菌群構(gòu)成進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)，片球菌屬，紅球菌屬，乳桿菌屬，嗜鹽單胞菌屬，梭菌屬，羅氏菌屬和科未定菌屬是小腸黏膜的主要優(yōu)勢(shì)菌屬，其在空腸、交界和回腸內(nèi)均是優(yōu)勢(shì)菌屬，提示這些菌群對(duì)于小腸功能的維護(hù)及“塑形”可能起著重要作用。和以往的小腸研究結(jié)果進(jìn)行比較發(fā)現(xiàn)，小腸黏膜不僅與大腸黏膜菌群存在不同的菌群多樣性，且和小腸內(nèi)容物的菌群多樣性也存在差異。
　　我們基于16sRNA測(cè)序的結(jié)果只能提供菌群在結(jié)構(gòu)和多樣性的總體概