微陣列技術(shù)中生物信息的利用和挖掘.pdf

1、本文分別對兩個相對獨立的微陣列研究中，生物信息的利用和挖掘進行了闡明。首先是通過對尖孢鐮刀菌微陣列的制備、雜交和分析過程的研究，勾勒出微陣列技術(shù)中生物信息的挖掘基本過程；然后從微生物功能基因微陣列中g(shù)yrB和錯配探針微陣列的設(shè)計、制備以及實驗數(shù)據(jù)的分析中，進一步闡述微陣列技術(shù)中信息利用和數(shù)據(jù)挖掘的過程。 首先，從尖孢鐮刀菌黃瓜專化型菌株ATCCl6416的cDNA分生孢子發(fā)育文庫中共獲得6448條表達序列標(biāo)簽(EST)，并且把它

2、們拼接成3372條推測獨立的轉(zhuǎn)錄本(TUT)。隨后我們構(gòu)建了含有3158條cDNA序列的尖孢鐮刀菌微陣列，用以分析分生孢子發(fā)育過程中的基因表達狀況。很多核糖體蛋白基因本身就在我們的文庫中高度冗余，同時還被檢測到在發(fā)育中的表達量在孢子和芽管中高豐度表達。一個時鐘調(diào)控基因顯示在孢子萌發(fā)的階段表達量上升，而信號基因ras卻在菌絲體中表達量最高。這些結(jié)果都提示ras相關(guān)基因的主要功能是調(diào)節(jié)菌絲體的生長，而很可以它和其它信號基因，如時鐘調(diào)控基因，