揚(yáng)子鱷種群MHC II類B基因多態(tài)性分析及幾種野生動(dòng)物的分子鑒定.pdf

1、為了研究揚(yáng)子鱷（Alligator sinensis）種群MHC基因的多態(tài)性，我們選取了安徽宣城野生揚(yáng)子鱷種群、安徽省揚(yáng)子鱷繁殖研究中心飼養(yǎng)種群和浙江長興飼養(yǎng)種群三個(gè)亞種群的14條揚(yáng)子鱷，利用一對(duì)特異性引物擴(kuò)增出揚(yáng)子鱷MHC II類B基因第三外顯子的部分片段，并對(duì)其進(jìn)行了克隆、測(cè)序，結(jié)果從這些揚(yáng)子鱷樣本中共獲得34種不同序列，每個(gè)亞種群內(nèi)分別檢測(cè)到15，9和10個(gè)不同序列。另外，第三外顯子核苷酸的非同義替換率顯著小于同義替換率，可能暗示

2、了揚(yáng)子鱷種群MHC II類B基因第三外顯子的多態(tài)性不是由平衡選擇保持的。并且在這三個(gè)亞種群中都發(fā)現(xiàn)有相同的等位基因，例如等位基因Alsi-29和Alsi-34，這可能表明這三個(gè)亞種群之間曾經(jīng)發(fā)生過基因交換。
　　另外，我們分別使用不同方法對(duì)梅花鹿和亳州市藥品監(jiān)督管理局送檢的三件猴骨樣品（BZ01、BZ02和BZ03）進(jìn)行了分子鑒定。對(duì)于梅花鹿的鑒定，我們運(yùn)用了序列特異性擴(kuò)增區(qū)域（ SequenceCharacterised Amp

3、lified Region，SCAR）標(biāo)記方法，使用100條隨機(jī)引物分析了皖南地區(qū)黑麂（Muntiacus crinifrons）、黃麂（Muntiacusreevesi）、梅花鹿（Cervus nippon kopschi）和毛冠鹿（Elaphoduscephalophus）等12個(gè)動(dòng)物個(gè)體的隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)DNA（ randomlyamplified polymorphic DNA，RAPD），得到一條梅花鹿物種特異性擴(kuò)增片段。對(duì)該片段

4、克隆、測(cè)序后，我們根據(jù)其序列設(shè)計(jì)出一對(duì)梅花鹿特異性鑒定引物。通過這對(duì)引物的使用使得梅花鹿樣品的鑒定更加容易、快捷、可靠。而對(duì)于猴骨樣品，我們則利用線粒體12S rRNA基因和Cyt b基因部分序列，通過DNA序列比對(duì)的方法對(duì)其進(jìn)行了鑒定。結(jié)果表明，BZ01號(hào)樣品為藏酋猴（Macaca thibetana），BZ02和BZ03號(hào)樣品為獼猴（Macaca mulatta）。另外，我們還發(fā)現(xiàn)，在利用DNA序列比對(duì)法進(jìn)行近緣物種的鑒定時(shí)，不同種