用DNA序列探討壁虎科蜥蜴間的關系和云南半葉趾虎的種群結構.pdf

1、基于12SrRNA基因全序列及C-mos基因序列片段探討了壁虎科(Gekkonidae)蜥蜴的屬間關系；用Cyt b基因全序列和ND2-tRNA<'Tyr>基因片段初步研究了云南半葉趾虎(Hemiphyllodactylus yunnanensis)的種群結構；用12SrRNA基因全序列探討了中國壁虎屬(Gekko)七物種間的系統(tǒng)關系。 1壁虎科蜥蜴的屬間關系 壁虎科包括了壁虎類蜥蜴85％的屬，廣泛分布于所有大陸及幾乎

2、全部島嶼。到目前為止，壁虎科是壁虎類蜥蜴中屬間關系最不清楚的一個分支。本研究獲得了壁虎科34個屬和鱗腳虎科2個屬的C-mos基因部分序列和線粒體12S rRNA基因全序列。最大簡約法(MP)和最大似然法(ML)用軟件PAUP 4.0b10進行分析。貝葉斯法分析應用MrBayes 3.084軟件。按照多數(shù)一致原則(>50％)構建一致樹。所有的系統(tǒng)發(fā)生樹都支持壁虎科是單系的。在一致樹中，壁虎科共分為A-F六個支，這六個分支與傳統(tǒng)的形態(tài)學分組

3、之間有著較大的差異。從構建的系統(tǒng)發(fā)生樹中可以發(fā)現(xiàn)Sphaerodactylus位于壁虎亞科的內部。結果同時也顯示除Ailuronyx之外，Teratoscincus+Pristurus是壁虎科其他壁虎的姐妹群，這在一定程度上證明了沙虎亞科的有效性。因此將球趾虎族提升為球趾虎亞科，還是維持Kluge(1987)的球趾虎族，以及沙虎亞科的有效性問題還值得進一步研究。 2云南半葉趾虎的種群結構 采自云貴高原的9個地點的云南半

4、葉趾虎共41個個體，囊括了傳統(tǒng)分類的四個亞種。獲得所有樣本的Cytb基因的全序列和31個樣本的ND2-tRNA<'Tyr>基因片段。用MEGA 3.O軟件分析DNA序列差異，定義單元型，并計算亞種內及亞種間的遺傳距離(P距離)。根據(jù)Cyt b基因的全序列和ND2-tRNA<'Tyr>基因片段均定義了22個單元型。亞種內Cyt b基因的平均遺傳距離為0.09-9.88％： ND2-tRNA<'Tyr>基因的平均遺傳距離為0.37-10.3

5、7％。亞種之間的遺傳距離(Cyt b： 18.33-21.89％：ND2-tRNA<'Tyr>：14.97-18.43％)遠遠高于亞種內的距離，僅一個例外就是指名亞種與金平亞種之間的距離(Cyt b：5.30[％]；ND2-tRNA<'Tyr>：4.33％) 較小。用DnaSP 3.14軟件計算各地方種群內的核苷酸多樣性(π)和單元型多樣性(h)，分析結果顯示，云南半葉趾虎具有極高的核苷酸和單元型多樣性。最大簡約法(MP)和最大似然法(

6、ML)用軟件PAUP 4.0b10進行分析。貝葉斯法分析應用MrBayes 3.084軟件?；趦啥尾煌幕蚝腿N不同的方法構建的系統(tǒng)發(fā)生樹表明云南半葉趾虎分為兩個單系群。用AMOVA 1.55軟件分析種群的分化和種群結構的地理格局，結果建議將云南半葉趾虎分為三組。傳統(tǒng)的金平亞種與指名亞種關系比較近，分為一組，而龍陵亞種和獨山亞種則分別屬于另外兩組。 3中國壁虎屬七物種間的系統(tǒng)發(fā)生關系 壁虎屬(Gekko)在中國有1

7、1個種。本研究測定了壁虎屬7個種的12S rRNA基因全序列。用MEGA 2.0軟件分析DNA序列差異。最大簡約法(MP)和最大似然法(ML)用軟件PAUP 4.0b10進行分析。貝葉斯法分析應用MrBayes 3.084軟件。分析結果表明大壁虎與小型壁虎之間的遺傳距離(23.19-26.36％，平均為24.94[％])比這6種小型壁虎之間的遺傳距離(10.53-18.98％，平均為15.03％)要大很多。而且，大壁虎與小型壁虎之間的遺

8、傳距離和已報道的蜥蜴類12S rDNA的屬間距離不相上下。在重建的分子系統(tǒng)樹中，壁虎屬內除大壁虎之外的6種小型壁虎以很高的置信度聚集成一個單系群，大壁虎作為壁虎屬中最原始的一員與屬內其他種類以極高的置信度形成姐妹群的關系。因此，是否將大壁虎與小型壁虎分建新屬值得進一步探討。鉛山壁虎與多疣壁虎分別屬于兩個不同的單系群，而它們之間的遺傳距離達到15.28％，從分子水平上進一步證實了鉛山壁虎作為一個種的有效性。從分子水平揭示的小型壁虎親緣關系